Вивчено основні побічні реакції, що супроводжують міжнуклеотидну конденсацію в Н-фосфонатпому методі олігонуклеотидного синтезу, та досліджено їх кі- нетику в присутності ряду основ. Знайдено стійкі модифікації гетероциклічних основ півалоїлхлоридом. Показано, що ацилювання P–Н-зв'язків призводить до розщеплення олігонуклеотидного ланцюга в ділянках, що містять P–С-зв'язки. Виявлено, що швидкість побічних реакцій в декілька разів нижча у хіноліні, ніж в більш основному піридині.