Biopolym. Cell. 1991; 7(3):60-65.
http://dx.doi.org/10.7124/bc.0002D1
Структура та функції біополімерів
Вивчення взаємодії антикодонової гілки дріжджової фенілаланінової тРНК з малими субчастинками рибосом печінки кроля
1Ковальчук О. В., 1Потапов А. П.
  1. Інститут молекулярної біології і генетики АН УСРС
    Київ, СРСР

Abstract

Ізольована гілка, як і ціла молекула тРНКPhe , кооперативно зв'язується з двома рівними за спорідненістю сайтами 40S субчастинки рибосом. Однак спорідненість фрагменту з рибосомою вища. Це обумовлено більшим в порівнянні з тРНК коефіцієнтом кооперативності утворення комплексу рибосоми з антикодоновою гілкою. Коефіцієнт кооперативності дорівнює 4 для тРНКPhe і 47 – для її антикодонової гілки; якщо коефіцієнт кооперативності не враховується, то константи зв'язування дорівнюють 1,2 · 107 M–1 (тРНКPhe) та 0,5 · 107 M–1 (гілка) для кожного сайту при 2 °С і 20 мМ концентрації Mg2+. Вирішальне значення для випикненя кооперативного ефекту має комплементарність кодон-антикодонових пар. Виявлено кодон-незалежне зв'язування тРНК з малими субчастинками рибосом, в той же час антикодонова гілка не зв'язується з рибосомами при відсутності матриці.
Повний текст: (PDF, російською)

References

[1] Rodnina MV, El'skaya AV, Semenkov YuP, Kirillov SV. Number of tRNA binding sites on 80 S ribosomes and their subunits. FEBS Lett. 1988;231(1):71-4.
[2] Potapov AP. A stereospecific mechanism for the aminoacyl-tRNA selection at the ribosome. FEBS Lett. 1982;146(1):5-8.
[3] Potapov AP. Mechanism of the stereospecific stabilization of codon-anticodon complexes in ribosomes during translation. Zh Obshch Biol. 1985;46(1):63-77.
[4] Rose SJ 3rd, Lowary PT, Uhlenbeck OC. Binding of yeast tRNAPhe anticodon arm to Escherichia coli 30 S ribosomes. J Mol Biol. 1983;167(1):103-17.
[5] Nekhay S. A., Saminsky E. M. Binding of yeast tRNAPhe with anticodon arm to Escherichia coli 305 Subunits and 70S ribosomes. Biopolym Cell. 1989; 5(2):62-9.
[6] Falvey AK, Staehelin T. Structure and function of mammalian ribosomes. I. Isolation and characterization of active liver ribosomal subunits. J Mol Biol. 1970;53(1):1-19.
[7] Kirillov SV, Makhno VI, Semenkov IuP. Effect of the molecular weight of polyuridylic acid and the presence of ribosomal protein S1 on the stability of the complex of transport RNA with small ribosomal subunits. Dokl Akad Nauk SSSR. 1976;229(2):488-91.
[8] Potapov AP, Soldatkin KA, Soldatkin AP, El'skaya AV. The role of a template sugar-phosphate backbone in the ribosomal decoding mechanism. Comparative study of poly(U) and poly(dT) template activity. J Mol Biol. 1988;203(4):885-93.
[9] Maxam AM, Gilbert W. A new method for sequencing DNA. Proc Natl Acad Sci U S A. 1977;74(2):560-4.
[10] Nirenberg M, Leder P. RNA codewords and protein synthesis. The effect of trinucleotides upon the binding of sRNA to ribosomes. Science. 1964;145(3639):1399-407.
[11] Rodnina MV, El'skaya AV, Semenkov YP, Kirillov SV. Interaction of tRNA with the A and P sites of rabbit-liver 80S ribosomes and their 40S subunits. Eur J Biochem. 1989;185(3):563-8.
[12] Ackers GK, Shea MA, Smith FR. Free energy coupling within macromolecules. The chemical work of ligand binding at the individual sites in co-operative systems. J Mol Biol. 1983;170(1):223-42.
[13] Metzler D. Biochemistry: the chemical reactions of living cells. Elsevier, 1977; 1164 p
[14] Dahlquist FW. The quantitative interpretation of maximum in Scatchard plots. FEBS Lett. 1974;49(2):267-8.