Biopolym. Cell. 1989; 5(6):32-39.
http://dx.doi.org/10.7124/bc.0000F4
Структура та функції біополімерів
Теоретичне вивчення низькочастотних коливань макромолекул ДНК
1Волков С. Н., 2Косевич А. М., 1, 3Вайнреб Г. Є.
  1. Інститут теоретичної фізики АН УРСР
    Київ, СРСР
  2. Фізико-технічний інститут низьких температур АН УРСР
    Харків, СРСР
  3. Тимчасовий науковий колектив «Відгук», Міністерства вищої і середньо-спеціальної освіти
    Київ, СРСР

Abstract

Досліджено коливання структурних елементів полінуклеотидного ланцюга щодо рівноважної конформації двотяжової ДНК. У розгляд включено відносні рухи нуклеотидів, попарно зв’язаних водневими зв’язками, згинання полінуклеотідних ланцюгів і внутрішньонуклеозидна рухливість. Виконано аналіз нормальних коливань двотяжового ланцюга і визначено структуру низькочастотного спектра коливань ДНК. Використовуючи теоретичні результати та їхнє узгодження з даними спектроскопії комбінаційного розсіювання (КР), запропоновано інтерпретацію спостережуваних особливостей у спектрах низькочастотних коливань ДНК.
Повний текст: (PDF, російською)

References

[1] Maleev VIa. Spiral oscillation of bases in nucleic acid. Biofizika. 1965;10(5):729-34.
[2] Painter PC, Mosher L, Rhoads C. Low-frequency modes in the raman spectrum of DNA. Biopolymers. 1981;20(1):243–7.
[3] Urabe H, Tominaga Y. Low-frequency Raman spectra of DNA. J Phys Soc Japan. 1981. 50:3643-3644.
[4] Urabe H, Tominaga Y. Low-lying collective modes of DNA double helix by Raman spectroscopy. Biopolymers. 1982;21(12):2477-81.
[5] Urabe H. Experimental evidence of collective vibrations in DNA double helix (Raman spectroscopy). J Chem Phys. 1983;78(10):5937-9.
[6] Urabe H, Hayashi H, Tominaga Y, Nishimura Y, Kubota K, Tsuboi M. Collective vibrational modes in molecular assembly of DNA and its application to biological systems. Low frequency Raman spectroscopy. J Chem Phys. 1985;82(1):531-5.
[7] Lindsay S, Powell J, Rupprecht A. Observation of Low-Lying Raman Bands in DNA by Tandem Interferometry. Phys Rev Lett. 1984;53(19):1853–5.
[8] Demarco C, Lindsay SM, Pokorny M, Powell J, Rupprecht A. Interhelical effects on the low-frequency modes and phase transitions of Li- and Na-DNA. Biopolymers. 1985;24(11):2035-40.
[9] Urabe H, Sugawara Y, Tsukakoshi M, Ikegami A, Iwasaki H, Kasuya T. Raman spectroscopic study on low-frequency collective modes in self-associates of guanosine monophosphates. Biopolymers. 1987;26(6):963–71.
[10] Prohofsky E., Lu K., Van Zandt L., Putnam B. Breathing modes and induced resonant melting of the double helix. Phys Lett. 1979;70(5-6):492–4.
[11] Mei WN, Kohli M, Prohofsky EW, Van Zandt LL. Acoustic modes and nonbonded interactions of the double helix. Biopolymers. 1981;20(4):733-52.
[12] Wittlin A, Genzel L, Kremer F, Haseler S, Poglitsch A, Rupprecht A. Far-infrared spectroscopy on oriented films of dry and hydrated DNA. Phys Rev A. 1986;34(1):493-500.
[13] Chou KC. Low-frequency collective motion in biomacromolecules and its biological functions. Biophys Chem. 1988;30(1):3-48.
[14] Volkov SN, Kosevich AM. Conformational fluctuations of double-stranded DNA. Kyiv, 1986; (PrePrint. UkSSR. Inst theor. Physics; N 86-119R) 25 p.
[15] Volkov SN, Kosevich AM. Conformation oscillations of DNA. Mol Biol (Mosk). 1987;21(3):797-806.
[16] Saenger W. Principles of nucleic acid structure. New York: Springer, 1984; 556 p.
[17] Volkov SN, Kosevich AM, Weinreb GE. Spectrum of low-frequency vibrations of DNA macromolecules. Kiev, 1988. (Preprint . Acad. Sci. of Ukr. S.S.R., Inst. Theor. Phys; 88-177E). 19 p.