Biopolym. Cell. 1989; 5(4):30-37.
http://dx.doi.org/10.7124/bc.0000D0
Структура та функції біополімерів
Статистична значущість зустрічальності деяких складних поєднань нуклеотидів: порівняння моделей ДНК
1Субоч Г. М., 1Сприжицький Ю. А.
  1. Інститут молекулярної генетики АН СРСР
    Москва, СРСР

Abstract

Запропоновано схему моделювання ланцюжка ДНК як послідовності блоків нуклеотидів. Показано, що така модель адекватніше описує спостережувані частоти зустрічальності локальних дзеркальних гомопурин- гомопіримідинових повторів, ніж марковська однорідна модель другого порядку. Описано методику оцінки статистичної значущості зустрічальності в ДНК деяких складних поєднань нуклеотидів.
Повний текст: (PDF, російською)

References

[1] Day GR, Blake RD. Statistical significance of symmetrical and repetitive segments in DNA. Nucleic Acids Res. 1982;10(24):8323-39.
[2] Saurin W. Repetitive palindromic sequences in Escherichia coli. Detection and characterization with a new computer program. Comput Appl Biosci. 1987;3(2):121-7.
[3] Suboch GM, SPrizhitsky YuA, Alexandrov AA. Occurrence of homoPurine-homoPyrimidine mirror rePeats in natural DNAs. Biopolym Cell. 1989; 5(4):24-30.
[4] Sprizhitskii IuA, Nechipurenko IuD, Aleksandrov AA, Vol'kenshtein MV. Characteristics of nucleotide blocks in coding and non-coding DNA sequences from different organisms. Mol Biol (Mosk). 1988;22(2):338-56.
[5] Efron B. Bootstrap Methods: Another Look at the Jackknife. Ann Stat. 1979;7(1):1–26.
[6] Boos DD, Monahan JF. Bootstrap methods using prior information. Biometrika. 1986;73(1):77–83.
[7] GenBank (1986). Genetic sequence data bank, R. 44.0. BBN laboratories, USA.
[8] Borodovskii MIu, Sprizhitskii IuA, Golovanov EI, Aleksandrov AA. Statistical characteristics of primary structures of the functional regions of the Escherichia coli genome. III. Computer recognition of coding regions. Mol Biol (Mosk). 1986;20(5):1390-8.