Biopolym. Cell. 2024; 40(3):219-219.
http://dx.doi.org/10.7124/bc.000AFF
Хроніка та інформація
Реалістичний асортимент нових еталонів метагеноміки з різноманітними біологічними та технологічними характеристиками
1Шарма Н. К., 1Чхугані К., 2Мунтяну В., 3, 4Скумс П., 3Зеліковський А., 1Мангул С.
  1. Університет Південної Каліфорнії
    Лос-Анджелес, штат Каліфорнія, США, 90007
  2. Технічний університет Молдови
    168, Бул. Стефан чел Маре, Кишинів, Республіка Молдова, MD–2004
  3. Університет штату Джорджія
    Атланта, штат Джорджія, США, 30302,
  4. Університет Коннектикуту
    352, Менсфілд Роуд, Сторрс, Коннектикут, США, 06269

Abstract

Мета. Вирішити проблему дефіциту високоякісних експериментальних тестів у метагеноміці шляхом розробки економічно ефективного, напівреального інструменту генерації еталонів, MetaWiz, який може модифікувати існуючі експериментальні дані для створення різноманітних та реалістичних метагеномних еталонів. Висновки. MetaWiz пропонує економічно ефективне рішення проблеми створення високоякісних тестів у метагеноміці. Здатність інструменту створювати напівреальні контрольні показники на основі наявних експериментальних даних зберігає важливі технологічні та біологічні аспекти, надаючи переваги перед суто обчислювальними симуляціями. Цей підхід може бути поширений за межі вірусних послідовностей на різні дані секвенування, підвищуючи всебічність порівняльних досліджень метагеноміки в різних біологічних контекстах.
Keywords: метагеноміка, генерація тесту продуктивності, MetaWiz, мікробні геноми, виправлення помилок
Повний текст: (PDF, англійською)