Biopolym. Cell. 1988; 4(5):227-232.
http://dx.doi.org/10.7124/bc.00022F
Структура та функції біополімерів
Вплив нуклеотидних замін на профілі денатурації ДНК
1Разлуцький І. В., 1Шляхтенко Л. С., 1Любченко Ю. Л.
  1. Інститут молекулярної генетики АН СРСР
    Москва, СРСР

Abstract

Отримано профілі плавлення рестрикційних фрагментів ДНК розміром – 1150 пар нуклеотидів (п. н.), що відрізняються один від одного поділами 1, 5 і 6 п. н. Показано, що у всіх випадках делеції призводять до зсуву одного піка на профілі плавлення без зміни положення інших трьох піків. Ефект становить 0,28±0,03 °С при делеції ділянки з чотирьох AT-і однієї GC-пари і –0,14±0,03 °С – при делеції однієї GC-пари. Проведено також дослідження плавлення фрагментів ДНК методом гель-електрофорезу в градієнті концентрації денатуруючих агентів. Показано, що делеція однієї GC-пари призводить до помітного зсуву електрофоретичної кривої денатурації.
Повний текст: (PDF, російською)

References

[1] Lyamichev VI, Panyutin IG, Cherny DI, Lyubchenko YuL. Localization of low-melting regions in phage T7 DNA. Nucleic Acids Res. 1983;11(7):2165-76.
[2] Frank-Kamenetskii MD. Theoretical models of DNA. II. Theoretical methods for studying biopolymers. Moscow, VINITI, 1979; Vol. 15:42-73.
[3] Lyubchenko YL, Frank-Kamenetskii MD, Vologodskii AV, Lazurkin YS, Gause GG Jr. Fine structure of DNA melting curves. Biopolymers. 1976;15(6):1019-36.
[4] Wada A, Yabuki S, Husimi Y. Fine structure in the thermal denaturation of DNA: high temperature-resolution spectrophotometric studies. CRC Crit Rev Biochem. 1980;9(2):87-144.
[5] Lazurkin IuS. Molecular melting of DNA and the effect of the fine structure of fusion curves. Mol Biol (Mosk). 1977;11(6):1311-24. Review. Russian.
[6] Fischer SG, Lerman LS. Separation of random fragments of DNA according to properties of their sequences. Proc Natl Acad Sci U S A. 1980;77(8):4420-4.
[7] Myers RM, Maniatis T, Lerman LS. Detection and localization of single base changes by denaturing gradient gel electrophoresis. Methods Enzymol. 1987;155:501-27.
[8] Lyamichev VI, Panyutin IG, Lyubchenko YuL. Gel electrophoresis of partially denatured DNA. Retardation effect: its analysis and application. Nucleic Acids Res. 1982;10(15):4813-26.
[9] Lyubchenko YL, Vologodskii AV, Frank-Kamenetskii MD. Direct comparison of theoretical and experimental melting profiles for RF II phiX174 DNA. Nature. 1978;271(5640):28-31.
[10] Maniatis T, Fritsch EF, Sambrook J. Molecular cloning - a laboratory manual. New York, Cold Spring Harbor, 1982; 545 p.
[11] Kozyavkin SA, Lyubchenko YL. The nonequilibrium character of DNA melting: effects of the heating rate on the fine structure of melting curves. Nucleic Acids Res. 1984;12(10):4339-49.
[12] Perelroyzen MP, Lyamichev VI, Kalambet YuA, Lyubchenko YuL, Vologodskii AV. A study of the reversibility of helix-coil transition in DNA. Nucleic Acids Res. 1981;9(16):4043-59.
[13] Pavlov VM, Lyubchenko YuL. A new method for rcording of DNA differential melting curves. Biopolymers. 1978; 17(3):795-798.
[14] Taniguchi T, Ohno S, Fujii-Kuriyama Y, Muramatsu M. The nucleotide sequence of human fibroblast interferon cDNA. Gene. 1980;10(1):11-5.
[15] Gubanov VV, Lebedev IuB, Monastyrskaia GS, Rubtsov PM, Skriabin KG. Primary structure of the E. coli DNA region preceding the tryptophan operon genes. Bioorg Khim. 1984;10(3):415-7.