Biopolym. Cell. 2019; 35(6):476-485.
Віруси та клітина
Генетичне різноманіття вірусу шарки сливи в Україні
1Куценко О. В., 1Будзанівська І. Г., 1Шевченко О. В.
  1. Навчально-науковий центр «Інститут біології та медицини»
    Київського національного університету імені Тараса Шевченка
    вул. Володимирська, 64/13, Київ, Україна, 01601
Мета. Встановлення генетичного різноманіття вірусу шарки сливи (ВШС) в Україні. Методи. Імуно-фер-мент-ний аналіз (ІФА), полімеразна ланцюгова реакція зі зворотною транскрипцією (ЗТ-ПЛР), сиквенування ДНК та філогенетичний аналіз. Результати. Зразки були вибрані з різних регіонів України за візуальними симптомами та діагностовані за допомогою ІФА в модифікації «сендвіч». В подальшому за допомогою ЗТ-ПЛР були отримані та сиквеновані амплікони гена капсидного білку вірусу. Отриманні послідовності аналізували за допомогою філогенетичних методів. В результаті вивчено генетичне різноманіття ВШС у різних регіонах України, встановлено філогенетичні зв’язки між українськими ізолятами та проведено їх порівняльну характеристику із ізолятами з сусідніх країн. Висновки. На території України циркулюють штами М та D вірусу шарки сливи. Вперше ВШС діагностували в Харківській області. Ізоляти PPV, що циркулюють в Україні, найбільш подібні до ізолятів з Німеччини, Туреччини, Угорщини та Канади. Отримані результати можуть бути використані в подальшому для прогнозування поширення вірусу в різних регіонах України та сусідніх країнах, встановлення його походження та прогнозування розвитку можливих епідемій.
Keywords: вірус шарки сливи, ген капсидного білка, філогенетичний аналіз, сиквенування, генетичне різноманіття, Україна