Biopolym. Cell. 2005; 21(1):48-54.
http://dx.doi.org/10.7124/bc.0006DB
Клітинна біологія
Внутрішньо- і міжмолекулярні взаємодії, опосередковані адаптерним білком Ruk/CIN85/SETA
1Ільницька О. М., 1Дрель В. Р., 1Шуваєва Г. Ю., 1Гаврилов С. В., 1Федиишн Я. Я., 1Маєвська О. М., 1Ігуменцева Н. І., 2Гут І. Т., 3Бухман В. Л., 1Дробот Л. Б.
  1. Інститут біології клітини НАН України
    вул. Драгоманова, 14/16, Львів, Україна, 79005
  2. Університетський коледж Лондона
    вул. Гавер, Лондон, WC1E 6BT, Велика Британія
  3. Школа Біологічних наук Кардіффа
    сер Мартін Еванс будівля, музей Avenue, Кардіфф, CF10 3AX

Abstract

RuklCIN85lSETA є представником окремої еволюційно кон­сервативної родини адаптернихі риштувальних білків, залуче­них до апоптичного сигналювання і сигналювання, залежного від рецепторних тирозинових протеїнкіназ, перебудови актинового цитоскелету і адгезії клітин, контролю функцій подоцитів і Т клітин. Оскільки Ruk/CIN85/ SETA містить одно­ часно SH3 домени і багаті на пролін послідовності на рівні одного поліпептидного ланцюга та С-кінцевий суперспіралізований район, можна припустити, що його біологічна ак­тивність регулюється за рахунок внутрішньо- і міжмолеку­лярних взаємодій. Здатність багатих на пролін мотивів Ruk взаємодіяти з власними SH3 доменами та суперспіралізованої ділянки — опосередковувати олігомеризацію різних ізоформ до­сліджували за допомогою методу зв'язування in vitro GST-зли­тих білків. Показано, шр SH3A і, в меншій мірі, SH3B домени Ruk кооперативно взаємодіють із власними багатими на пролін послідовностями, у той час як суперспіралізований район забезпечує олігомеризацію ізоформ. Не виключено при цьому, що SH3C домен чинить конформаційний вплив на суперспіралізований район, обмежуючи, в такий спосіб, ступінь олігомеризації. Нами також встановлено, що здатність екзо­генних лігандів взаємодіяти з багатими на пролін мотивами Ruk координовано змінюється протягом TNFa-індукованого апоптозу мієломоноцитарних клітин лінії U937.
Keywords: адаптер ний білок, SH3 домен, багата на пролін ділянка, суперспіралізований район, білково-білкові взаємодії
Повний текст: (PDF, англійською)

References

[1] Pawson T, Nash P. Assembly of cell regulatory systems through protein interaction domains. Science. 2003;300(5618):445-52.
[2] Zarrinpar A, Bhattacharyya RP, Lim WA. The structure and function of proline recognition domains. Sci STKE. 2003;2003(179):RE8.
[3] Gout I, Middleton G, Adu J, Ninkina NN, Drobot LB, Filonenko V, Matsuka G, Davies AM, Waterfield M, Buchman VL. Negative regulation of PI 3-kinase by Ruk, a novel adaptor protein. EMBO J. 2000;19(15):4015-25.
[4] Take H, Watanabe S, Takeda K, Yu ZX, Iwata N, Kajigaya S. Cloning and characterization of a novel adaptor protein, CIN85, that interacts with c-Cbl. Biochem Biophys Res Commun. 2000;268(2):321-8.
[5] Borinstein SC, Hyatt MA, Sykes VW, Straub RE, Lipkowitz S, Boulter J, Bogler O. SETA is a multifunctional adapter protein with three SH3 domains that binds Grb2, Cbl, and the novel SB1 proteins. Cell Signal. 2000;12(11-12):769-79.
[6] Dikic I. CIN85/CMS family of adaptor molecules. FEBS Lett. 2002;529(1):110-5.
[7] Buchman VL, Luke C, Borthwick EB, Gout I, Ninkina N. Organization of the mouse Ruk locus and expression of isoforms in mouse tissues. Gene. 2002;295(1):13-17.
[8] Chen B, Borinstein SC, Gillis J, Sykes VW, Bogler O. The glioma-associated protein SETA interacts with AIP1/Alix and ALG-2 and modulates apoptosis in astrocytes. J Biol Chem. 2000;275(25):19275-81.
[9] Soubeyran P, Kowanetz K, Szymkiewicz I, Langdon WY, Dikic I. Cbl-CIN85-endophilin complex mediates ligand-induced downregulation of EGF receptors. Nature. 2002;416(6877):183-7.
[10] Szymkiewicz I, Kowanetz K, Soubeyran P, Dinarina A, Lipkowitz S, Dikic I. CIN85 participates in Cbl-b-mediated down-regulation of receptor tyrosine kinases. J Biol Chem. 2002;277(42):39666-72.
[11] Petrelli A, Gilestro GF, Lanzardo S, Comoglio PM, Migone N, Giordano S. The endophilin-CIN85-Cbl complex mediates ligand-dependent downregulation of c-Met. Nature. 2002;416(6877):187-90.
[12] Hutchings NJ, Clarkson N, Chalkley R, Barclay AN, Brown MH. Linking the T cell surface protein CD2 to the actin-capping protein CAPZ via CMS and CIN85. J Biol Chem. 2003;278(25):22396-403.
[13] Schmidt MH, Chen B, Randazzo LM, Bogler O. SETA/CIN85/Ruk and its binding partner AIP1 associate with diverse cytoskeletal elements, including FAKs, and modulate cell adhesion. J Cell Sci. 2003;116(Pt 14):2845-55.
[14] Tibaldi EV, Reinherz EL. CD2BP3, CIN85 and the structurally related adaptor protein CMS bind to the same CD2 cytoplasmic segment, but elicit divergent functional activities. Int Immunol. 2003;15(3):313-29.
[15] Drel VR, Danyluk OYu, Shuvajeva GYu, Ihumenceva NI, Kit YuYa, Gout IT, Buchman VL, Drobot LB. Subcellular localization of adapter protein Ruk, in HEK293 cells. Biopolym Cell. 2002; 18(4):312-8.
[16] Kit YY, Drel VR, Petriv OI, Kovalyova VA, Shuvaeva GY, Palivoda OY, Vovk EI, Bobak YP, Rzeszowska-Wolny J, Gout IT, Buchman VL, Drobot LB. Adaptor protein Ruk1 forms protein-protein complexes with endonuclease activity in HEK293 cells. Biochemistry (Mosc). 2003;68(7):810-5.
[17] Borthwick EB, Korobko IV, Luke C, Drel VR, Fedyshyn YY, Ninkina N, Drobot LB, Buchman VL. Multiple domains of Ruk/CIN85/SETA/CD2BP3 are involved in interaction with p85alpha regulatory subunit of PI 3-kinase. J Mol Biol. 2004;343(4):1135-46.
[18] Webster GA, Perkins ND. Transcriptional cross talk between NF-kappaB and p53. Mol Cell Biol. 1999;19(5):3485-95.
[19] Laemmli UK. Cleavage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage T4. Nature. 1970;227(5259):680-5.
[20] Towbin H, Staehelin T, Gordon J. Electrophoretic transfer of proteins from polyacrylamide gels to nitrocellulose sheets: procedure and some applications. 1979. Biotechnology. 1992;24:145-9.
[21] Kowanetz K, Szymkiewicz I, Haglund K, Kowanetz M, Husnjak K, Taylor JD, Soubeyran P, Engstrom U, Ladbury JE, Dikic I. Identification of a novel proline-arginine motif involved in CIN85-dependent clustering of Cbl and down-regulation of epidermal growth factor receptors. J Biol Chem. 2003;278(41):39735-46.
[22] Verdier F, Valovka T, Zhyvoloup A, Drobot LB, Buchman V, Waterfield M, Gout I. Ruk is ubiquitinated but not degraded by the proteasome. Eur J Biochem. 2002;269(14):3402-8.
[23] Watanabe S, Take H, Takeda K, Yu ZX, Iwata N, Kajigaya S. Characterization of the CIN85 adaptor protein and identification of components involved in CIN85 complexes. Biochem Biophys Res Commun. 2000;278(1):167-74.
[24] Xu W, Doshi A, Lei M, Eck MJ, Harrison SC. Crystal structures of c-Src reveal features of its autoinhibitory mechanism. Mol Cell. 1999;3(5):629-38.
[25] Williams JC, Weijland A, Gonfloni S, Thompson A, Courtneidge SA, Superti-Furga G, Wierenga RK. The 2.35 A crystal structure of the inactivated form of chicken Src: a dynamic molecule with multiple regulatory interactions. J Mol Biol. 1997;274(5):757-75.
[26] Sicheri F, Moarefi I, Kuriyan J. Crystal structure of the Src family tyrosine kinase Hck. Nature. 1997;385(6617):602-9.
[27] Nagar B, Hantschel O, Young MA, Scheffzek K, Veach D, Bornmann W, Clarkson B, Superti-Furga G, Kuriyan J. Structural basis for the autoinhibition of c-Abl tyrosine kinase. Cell. 2003;112(6):859-71.
[28] Zhang H, Gallo KA. Autoinhibition of mixed lineage kinase 3 through its Src homology 3 domain. J Biol Chem. 2001;276(49):45598-603.
[29] Yuzawa S, Suzuki NN, Fujioka Y, Ogura K, Sumimoto H, Inagaki F. A molecular mechanism for autoinhibition of the tandem SH3 domains of p47phox, the regulatory subunit of the phagocyte NADPH oxidase. Genes Cells. 2004;9(5):443-56.
[30] Moarefi I, LaFevre-Bernt M, Sicheri F, Huse M, Lee CH, Kuriyan J, Miller WT. Activation of the Src-family tyrosine kinase Hck by SH3 domain displacement. Nature. 1997;385(6617):650-3.
[31] Briggs SD, Sharkey M, Stevenson M, Smithgall TE. SH3-mediated Hck tyrosine kinase activation and fibroblast transformation by the Nef protein of HIV-1. J Biol Chem. 1997;272(29):17899-902.
[32] Hansson H, Smith CI, H?rd T. Both proline-rich sequences in the TH region of Bruton's tyrosine kinase stabilize intermolecular interactions with the SH3 domain. FEBS Lett. 2001;508(1):11-5.