Biopolym. Cell. 1986; 2(6):311-316.
Структура та функції біополімерів
Повний автоматичний синтез фосфотриефірним методом олігодезоксирибонуклеотидів на синтезаторі «Виктория-4М»
1Грязнов С. М., 2Потапов В. К., 2Горн В. В., 2Заритова В. Ф., 2Средін Ю. Г., 3Потьомкін Г. А., 1Шабарова З. А.
  1. Московський Державний Університет ім. М. В. Ломоносова
    Москва, СРСР
  2. Інститут біоорганічної хімії Сибірського відділення АН СРСР
    Новосибірськ, СРСР
  3. СКТБ спеціальної електроніки та аналітичного приладобудування СВ АН СРСР
    Новосибірськ, СРСР

Abstract

Розроблено регламент роботи нової моделі автоматичного синтезатора олігонуклеотидів «Вікторія-4М» для двох схем фосфотриефірного методу синтезу в напрямку від 3'- до 5'-кінця з використанням нуклеотидного компонента як у розчині, так і на полімерних носіях. Останніми слугували сополімер стирол-тетрафторетилен і вітчизняний силохром С-80. Порівняльний аналіз результатів повністю автоматичного синтезу низки олігодезоксирибонуклеотидів показав, що, незважаючи на розходження в хімічній природі і структурі носіїв і компонентів нарощування полінуклеотидного ланцюга, середній вихід на стадії в розрахунку на виділений продукт становить 75–80 %, що дозволяє зробити висновок про ефективну роботу синтезатора і можливості проведення автоматичного синтезу у будь-якому з представлених варіантів.

References

[1] Potapov VK, Potemkin GA, Gorn VV, Zarytova VF, Sredin YuG, Shabarova ZA, Knorre DG. Semi-automatic solid-phase synthesis of oligodeoxyribonucleotides. Dokl Akad Nauk SSSR. 1982; 263(6):1386-9.
[2] Lomakin AI, Yastrebov SI, Popov SG. Automated synthesis of oligodeoxyribonucleotides. I. A study of solid supports based on silica gel "Silochrom". Russian Journal of Bioorganic Chemistry. 1985, 11 (7):920-926.
[3] Efimov VA, Reverdatto SV, Chakhmakhcheva OG. New effective method for the synthesis of oligonucleotides via phosphotriester intermediates. Nucleic Acids Res. 1982;10(21):6675-94.
[4] Rosenthal A, Cech D, Veiko VP, Orezkaja TS, Kuprijanova EA, Shabarova ZA. Triester-festphasensynthese von oligodesoxyribonucleotiden an polystyren-teflon tr?gern. Tetrahedron Lett. 1983; 26(16)1691-4.
[5] Gorn VV, Zarytova VF. Solid-phase synthesis of deoxyribooligonucleotides suitable for direct use in ligase reactions. Russian Journal of Bioorganic Chemistry. 1985; 11(6):808-14.
[6] Bausk EV, Gorn VV, Lebedev AV. General scheme of the solid-phase phosphotriester synthesis of 5'-phosphorylated-oligodeoxyribonucleotides on the basis of ?-cyanoethyl p-chlorophenyl esters of N-acylnucleoside-5'-phosphates. Russian Journal of Bioorganic Chemistry. 1985; 11(6):815-20.
[7] Gryaznov SM. Testing of the regulations of the machine-oligonucleotide synthesizer "Victoria-3." MSU. Moscow, 1984; Dep. VINITI 30.08.84, N 6054.
[8] Gryaznova OI, Dolinnaya NG, Isagulyants MG, Metelev VG, Oretskaya TS, Udalov NI, Sokolova NI, Shabarova ZA. Studies of synthesis and thermal stability of oligodesoxyribonucleotide duplexes with structural anomalies. Russian Journal of Bioorganic Chemistry 1986, 12 (1):124-32.
[9] Jones SS, Reese CB, Sibanda S, Ubasawa A. The protection of uracil and guanine residues in oligonucleotides synthesis. Tetrahedron Lett. 1981; 22(47):4755-8.
[10] Dobrynin VN, Filippov SA, Byslrov NS, Severtsova IV, Kolosov MN. Methylimidazole catalyzed rapid phosphotriester synthesis of oligodeoxynucleotides on a silica gel support in dichloroethane. Russian Journal of Bioorganic Chemistry 1983, 9 (5):706-10.