Biopolym. Cell. 2002; 18(6):540-546.
http://dx.doi.org/10.7124/bc.000633
Біоорганічна хімія
Взаємодія ціанінових барвників з нуклеїновими кислотами. Спектрально-люмінесцентні властивості сери пірилієвих та піридинієвих моно/триметинціанінів
1Ковальська В. Б., 2Валюх І. В., 1Костенко О. М., 1Дмитрієва С. Ю., 3Толмачов О. І., 1Ярмолюк С. М.
  1. Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
    Вул. Академіка Заболотного, 150, Київ, Україна, 03680
  2. Київський національний університет імені Тараса Шевченка
    вул. Володимирська 64, Київ, Україна, 01033
  3. Інститут органічної хімії НАН України
    вул. Мурманська, 5, Київ, Україна, 02660

Abstract

Досліджено спектрально-люмінесцентні властивості серії пірилісвих та піридинієвих моно/ три­ метинціанінів як флуоресцентних барвників для визначення та мічення нуклеїнових кислот (НК). Вперше показано, що 5,6-метилендіокси-бензотіазоломонометинпіридоціанін MDO40 е перспек­тивним барвником для флуоресцентного визначення НК у гомогенних системах детекції та для конструювання так званих "спалахуючих зондів" ("Light-uр probes") на основі олігонуклеотидів.
Повний текст: (PDF, українською)

References

[1] Haugland RP. Handbook of fluorescent probes and research chemicals. Molecular Probes Inc. Sixth ed. Eugene: OR, 1996. 680 p.
[2] Svanvik N, Westman G, Wang D, Kubista M. Light-up probes: thiazole orange-conjugated peptide nucleic acid for detection of target nucleic acid in homogeneous solution. Anal Biochem. 2000;281(1):26-35.
[3] Fan ZH, Mangru S, Granzow R, Heaney P, Ho W, Dong Q, Kumar R. Dynamic DNA hybridization on a chip using paramagnetic beads. Anal Chem. 1999;71(21):4851-9.
[4] Whitcombe D, Newton CR, Little S. Advances in approaches to DNA-based diagnostics. Curr Opin Biotechnol. 1998;9(6):602-8.
[5] Ishiguro T, Saitoh J, Yawata H, Otsuka M, Inoue T, Sugiura Y. Fluorescence detection of specific sequence of nucleic acids by oxazole yellow-linked oligonucleotides. Homogeneous quantitative monitoring of in vitro transcription. Nucleic Acids Res. 1996;24(24):4992-7.
[6] Yarmoluk SM, Kostenko AM, Dubey IY. Interaction of cyanine dyes with nucleic acids. Part 19: new method for the covalent labeling of oligonucleotides with pyrylium cyanine dyes. Bioorg Med Chem Lett. 2000;10(19):2201-4.
[7] Yarmoluk SM, Losytskyy MYu, Kovatska VB, Tomachynski SM, Ogutchansky TYu, Kostenko OM, Kurdyukov VV, Tolmachev OI. Interaction of cyanine dyes with nucleic acids. New (pyrido)(thio)trimethincyanine dye CCyan 40 for fluorescent labeling of oligonucleotides. Biopolym Cell. 2002; 18(4):340-6.
[8] Yarmoluk SM, Zhyvoloup AN, Koval'ska VB, Klimenko IV, Kukharenko AP, Kovtun YP, Slominsky YL. Interaction of cyanine dyes with nucleic acids. I. Studies on monomethyne cyanine dyes as possible fluorescent probes for the detection of nucleic acids. Biopolym Cell. 1996; 12(1):69-74.
[9] Yarmoluk SM, Kovalska VB, Smirnova TV, Shandura MP, Kovtun YP, Matsuka GKh. Interaction of cyanine dyes with nucleic acids. 2. Spectroscopic properties of methyleneoxy analogues of Thiazole Orange. Biopolym Cell. 1996; 12(6):74-81.
[10] Yarmoluk SM, Kovalska VB, Kovtun YuP. Interaction of cyanine dyes with nucleic acids. 5. Towards model of «half intercalation of monomethyne cyanine dyes into double-stranded nucleic acids. Biopolym Cell. 1999; 15(1):75-82.
[11] Kiprianov AI. The color and structure of polymethine dyes. Kiev: Naukova Dumka. 1979; 666 p.