Biopolym. Cell. 1999; 15(4):328-336.
http://dx.doi.org/10.7124/bc.00052F
Методи
Взаємодія ціанінових барвників з нуклеїновими кислотами. 8. Вивчення ціанінових барвників як флюоресцентних зондів для детекції нуклеїнових кислот
1Ярмолюк С. М.
  1. Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
    Вул. Академіка Заболотного, 150, Київ, Україна, 03680

Abstract

Вивчено 19 поліметинових ціанінових барвників із різними гетероциклами як можливих флюорес­центних зондів для гомогенної детекції нуклеїнових кислот у розчині. Досліджено спектрально-люмінесцентні властивості вільних барвників, у присутності білка, а також їхніх комплексів з ДНК і РНК. Було запропоновано модель «в'язкого оточення» для пояснення зростання інтен­сивності флюоресценції ціанінових барвників у їхніх комплексах з нуклеїновими кислотами.
Повний текст: (PDF, українською)

References

[1] Rye HS, Yue S, Wemmer DE, Quesada MA, Haugland RP, Mathies RA, Glazer AN. Stable fluorescent complexes of double-stranded DNA with bis-intercalating asymmetric cyanine dyes: properties and applications. Nucleic Acids Res. 1992;20(11):2803-12.
[2] Rye HS, Dabora JM, Quesada MA, Mathies RA, Glazer AN. Fluorometric assay using dimeric dyes for double- and single-stranded DNA and RNA with picogram sensitivity. Anal Biochem. 1993;208(1):144-50.
[3] Hirons GT, Fawcett JJ, Crissman HA. TOTO and YOYO: new very bright fluorochromes for DNA content analyses by flow cytometry. Cytometry. 1994;15(2):129-40.
[4] Rye HS, Drees BL, Nelson HC, Glazer AN. Stable fluorescent dye-DNA complexes in high sensitivity detection of protein-DNA interactions. Application to heat shock transcription factor. J Biol Chem. 1993;268(33):25229-38.
[5] Goodwin PM, Johnson ME, Martin JC, Ambrose WP, Marrone BL, Jett JH, Keller RA. Rapid sizing of individual fluorescently stained DNA fragments by flow cytometry. Nucleic Acids Res. 1993;21(4):803-6.
[6] Skeidsvoll J, Ueland PM. Analysis of double-stranded DNA by capillary electrophoresis with laser-induced fluorescence detection using the monomeric dye SYBR green I. Anal Biochem. 1995;231(2):359-65.
[7] Lee LG, Chen CH, Chiu LA. Thiazole orange: a new dye for reticulocyte analysis. Cytometry. 1986;7(6):508-17.
[8] Haughland RP. Molecular probes. Handbook of fluorescent probes and research chemicals. 1996 Eugene: OR Molecular Probes., p. 679.
[9] Carlsson C, Larsson A, Jonsson M, Albinsson B, Norden B. Optical and photophysical properties of the oxazole yellow DNA probes YO and YOYO. Journal of Physical Chemistry, 1994;98(40):10313-10321.
[10] Yarmoluk SM, Kovalska VB, Smirnova TV, Shandura MP, Kovtun YP, Matsuka GK. Interaction of cyanine dyes with nucleic acids. 2. Spectroscopic properties of methyleneoxy analogues of Thiazole Orange. Biopolym. Cell. 1996; 12(6):74-81.
[11] Rye HS, Glazer AN. Interaction of dimeric intercalating dyes with single-stranded DNA. Nucleic Acids Res. 1995;23(7):1215-22.
[12] Yarmoluk SM, Zhyvoloup AN, Koval'ska VB, Klimenko IV, Kukharenko AP, Kovtun YP, Slominsky YL. Interaction of cyanine dyes with nucleic acids. I. Studies on monomethyne cyanine dyes as possible fluorescent probes for the detection of nucleic acids. Biopolym. Cell, 1996; 12 (1):69-74.
[13] Ischenko A. A. Structure and spectral-luminescent properties of polymethine dyes - K.: Naukova dumka, 1994. 231 p.
[14] Jacobsen JP, Pedersen JB, Hansen LF, Wemmer DE. Site selective bis-intercalation of a homodimeric thiazole orange dye in DNA oligonucleotides. Nucleic Acids Res. 1995;23(5):753-60. as the preferred binding site.