Взаємодія ціанінових барвників з нуклеїновими кислотами. 6. Синтез та спектроскопічні властивості кон\'югатів тіазолового ораижеяого з амінокислотами

Ярмолюк, С. М.; Криворотенко, Д. В.; Герасимчук, Ю. С.

doi:10.7124/bc.000521

Biopolym. Cell. 1999; 15(3):247-251.

http://dx.doi.org/10.7124/bc.000521

Методи

Взаємодія ціанінових барвників з нуклеїновими кислотами. 6. Синтез та спектроскопічні властивості кон'югатів тіазолового ораижеяого з амінокислотами

1Ярмолюк С. М., 1Криворотенко Д. В., 1Герасимчук Ю. С.

Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
Вул. Академіка Заболотного, 150, Київ, Україна, 03680

Abstract

Описано синтез амінокислотних похідних (L-Trp та L-Tyr) з тіазоловим оранжевим – монометиновим ціаніновим барвником, що значно підвищує інтенсивність власної флюоресценції при зв'язуванні з нуклеїновими кислотами. Гідроксисукцинімідний ефір Cyan 6 (2-[-(М-карбоксиетил-хінолін)-метил]-3 -метилбензтіазол - 1, 4-n-толулолсульфата) був використаний для кон'югації. Взаємодію синтезованих кон'югатів з нуклеїновими кислотами досліджено спектроскопічними методами.

Повний текст: (PDF, англійською)

References

[1] Kalashnikov VV, Samukov VV, Shubina TN, Yamshchikov VF. Application of the reverse-phase chromatography in oligonucleotide synthesis. Russian Journal of Bioorganic Chemistry. 1983, 9(5):666-672.

[2] Schwartz HE, Ulfelder KJ. Capillary electrophoresis with laser-induced fluorescence detection of PCR fragments using thiazole orange. Anal, Chem. 1992, 64(15):1737—1740.

[3] Haughland RP. Handbook of fluorescent probes and research chemicals. Molecular Probes. Eugene: OR, 1996. 679 p.

[4] Yarmoluk SM, Kovalska VB, Smirnova TV, Shandura MP, Kovtun YP, Matsuka G. Kh. Interaction of cyanine dyes with nucleic acids. 2. Spectroscopic properties of methyleneoxy analogues of Thiazole Orange. Biopolym. Cell. 1996; 12(6):74-81

[5] Skeidsvoll J, Ueland PM. Analysis of double-stranded DNA by capillary electrophoresis with laser-induced fluorescence detection using the monomeric dye SYBR green I. Anal Biochem. 1995;231(2):359-65.

[6] Yarmoluk SM, Kostenko AM, Kornushyna OS, Dubey IY. Interaction of cyanine dyes with nucleic acids. 4. Efficient 5'-fluorescent labelling of oligonucleotides with monomethyne pyrylium cyanine dye, Cyan 39. Biopolym. Cell. 1998; 14(1):82-86

[7] Ernst LA, Gupta RK, Mujumdar RB, Waggoner AS. Cyanine dye labeling reagents for sulfhydryl groups. Cytometry. 1989;10(1):3-10.

[8] Mujumdar RB, Ernst LA, Mujumdar SR, Waggoner AS. Cyanine dye labeling reagents containing isothiocyanate groups. Cytometry. 1989;10(1):11-9.

[9] Southwick PL, Ernst LA, Tauriello EW, Parker SR, Mujumdar RB, Mujumdar SR, Clever HA, Waggoner AS. Cyanine dye labeling reagents - carboxymethylindocyanine succinimidyl esters. Cytometry. 1990;11(3):418-30.

[10] Yarmoluk SM, Zhyvoloup AN, Koval'ska VB, Klimenko IV, Kukharenko AP, Kovtun Y, Slominsky YL. Interaction of cyanine dyes with nucleic acids. I. Studies on monomethyne cyanine dyes as possible fluorescent probes for the detection of nucleic acids. Biopolym. Cell. 1996; 12(1):69-74

[11] Akins DL, Kumar VT. HHigh-performance liquid chromatography of cyanine dyes multiphase separation, purification, and substitution of the counter ion. J Chrom A. 1995; 689(2):269—273.