Biopolym. Cell. 1997; 13(3):222-231.
Геном та його регуляція
Клонування геному Rhizobium meliloti у векторах різного типу
1Рум'янцева Т. Б., 2Єрко В. М., 1Сімаров Б. В.
  1. Всеросійський науково-дослідний інститут сільськогосподарської мікробіології Россельхозакадеміі
    шосе Подбельського 3, Санкт-Петербург, Пушкін 8, Російська Федерація, 196608
  2. Інститут фізіології рослин і генетики НАН України
    вул. Васильківська, 31/17, Київ, Україна, 03022

Abstract

З використанням бактеріофага EMBL3 і плазміди pVZ301 як векторів для клонування гепіерологічної ДНК було отримано банки генів штамів СХМ1 та СХМ 1-188 R. meliloti. Під час скринінгу фагового банку «симбіотичними» генами (nif, nod) і eff+ -генами, які, імовірно, беруть участь у розвитку бобово-ризобіального симбіозу. Плазмідний банк генів використано для комплементації лейцинових ауксотрофів для вивчення впливу ауксотрофності на розвиток симбіозу між бульбочко­вими бактеріяліи люцерни та їх рослиною хазяїном Medicago sativa.

References

[1] Long SR. Rhizobium genetics. Annu Rev Genet. 1989;23:483-506.
[2] Watson RJ. Molecular genetics of Rhizobium Meliloti symbiotic nitrogen fixation. Biotechnol Adv. 1989;7(1):31-45.
[3] Batut J, Terzaghi B, Gherardi M, Huguet M, Terzaghi E, Garnerone AM, et al. Localization of a symbiotic fix region on Rhizobium meliloti pSym megaplasmid more than 200 kilobases from the nod-nif region. Mol Gen Genet. 1985;199(2):232–9.
[4] DNA cloning: a practical approach. Ed. DM Glover. Oxford, IRL Press, 1985; Vol. 1 and 2: 435 p
[5] Long SR, Buikema WJ, Ausubel FM. Cloning of Rhizobium meliloti nodulation genes by direct complementation of Nod? mutants. Nature. 1982;298(5873):485–8.
[6] Michiels J, Vande Broek A, Vanderleyden J. Molecular cloning and nucleotide sequence of the Rhizobium phaseoli recA gene. Mol Gen Genet. 1991;228(3):486-90.
[7] Maniatis T, Fritsch EF, Sambrook J. Molecular cloning: a laboratory manual. New York: Cold Spring Harbor Lab., 1982. 545 p.
[8] Fedorov SN, Butvina OYu, Simarov BV. Mutagenic effect of UV-iradiation on alfalfa nodule bacteria and studies on symbiotic properties of the auxotrophic mutants obtained. Genetika. 1983;19(5):727-36.
[9] Fedorov SN. Obtaining mutants of alfalfa nodule bacteria with altered symbiotic properties under UV radiation. Auth. Thesis. ... kand biol nauk. L., 1987; 16 p.
[10] Fedorov SN, Simarov BV. Obtaining mutants with altered properties in symbiotic Rhizobium meliloti UV-rays. Sel'skokhozyaystvennaya Biologiya. 1987; 9: 44-9.
[11] Aronshtam AA, Umarov BR, Yerko VN et al. Use of a Rhizobium meliloti cosmid gene bank for cloning the leucine biosynthesis gene, which is involved in regulation the develop­ ment of nitrogen-fixing symbiosis with alfalfa. Soviet Ge­netics. 29(2):185-92.
[12] Yerko VN, Starchenkov EP. Complementation of Rhizobium meliloti leucine auxotrophy by the gene bank of Rhizobium leguminosarum bv. Viceae VF39. Fiziologiia i biokhimiia kul'turnykh rasteniy. 1994; 26(3):264-8.
[13] Simarov BV, Sharypova LA, Chesnokova ON, Onischuk OP, Kuchko VV. Analysis of Rhizobium meliloti Tn5 mutants with enhanced symbiotic efficiency. Genetika. 1990;26(4):630-5.
[14] Zinchenko V. Proc. 5 Int. Symp. on photosynthetic prokaryotes. Grindenwald, 1985: 371.
[15] Kondorosi E, Banfalvi Z, Kondorosi A. Physical and genetic analysis of a symbiotic region of Rhizobium meliloti: Identification of nodulation genes. Mol Gen Genet. 1984;193(3):445–52.
[16] B?nfalvi Z, Sakanyan V, Koncz C, Kiss A, Dusha I, Kondorosi A. Location of nodulation and nitrogen fixation genes on a high molecular weight plasmid of R. meliloti. Mol Gen Genet. 1981;184(2):318-25.
[17] Figurski DH, Helinski DR. Replication of an origin-containing derivative of plasmid RK2 dependent on a plasmid function provided in trans. Proc Natl Acad Sci U S A. 1979;76(4):1648-52.
[18] Frischauf AM, Lehrach H, Poustka A, Murray N. Lambda replacement vectors carrying polylinker sequences. J Mol Biol. 1983;170(4):827-42.
[19] Miller JH. Experiments in molecular genetics. Cold Spring Harbor Laboratory, 1972, 466 p.
[20] Kaslow DC. A rapid biochemical method for purifying lambda DNA from phage lysates. Nucleic Acids Res. 1986;14(16):6767.
[21] Birnboim HC, Doly J. A rapid alkaline extraction procedure for screening recombinant plasmid DNA. Nucleic Acids Res. 1979;7(6):1513-23.
[22] Marmur J. A procedure for the isolation of deoxyribonucleic acid from micro-organisms. J Mol Biol. 1961;3(2):208–18.
[23] Mazin AV, Kuznedelov KD, Kraev AS et al. Methods of Molecular Genetics and Genetic Engineering. Novosibirsk: Nauka, 1990. 248 p.
[24] Grunstein M, Hogness DS. Colony hybridization: a method for the isolation of cloned DNAs that contain a specific gene. Proc Natl Acad Sci U S A. 1975;72(10):3961-5.
[25] Southern EM. Detection of specific sequences among DNA fragments separated by gel electrophoresis. J Mol Biol. 1975;98(3):503-17.
[26] Plasmids: A practical approach. Edited by K.G. Hardy. Oxford-Washington, DC: IRL Press, 1987; 180 p.
[27] Fedorov SN, Fokina IF, Simarov BV. Assessment symbiotic properties of alfalfa nodule bacteria in the laboratory. Sel'skokhozyaystvennaya Biologiya. 1986; 1:112-8.