Biopolym. Cell. 1996; 12(2):68-73.
Геном та його регуляція
Підходи до геноідентифікації видів бактерій роду Campylobacter за допомогою методу полімеразної ланцюгової реакції з універсальними праймерами
1Кірик Д. Л., 2Бур'яновський Л. М., 1Шабловська Е. О., 1Пінчук І. В., 1Кролевецька Н. М., 1Кікоть В. І.
  1. Інститут епідеміології та інфекційних хвороб ім. Л. В. Громашевського АМН України
    вул. Амосова, 5, Київ, Україна, 03038
  2. Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
    Вул. Академіка Заболотного, 150, Київ, Україна, 03680

Abstract

В роботі розглянуто підходи до розробки методу геноідентифікації бактерій роду Campylobacter на. основі полімеразної ланцюгової реакції (ПЛР) з використанням універсальних олігонуклеотиднихпраймерів – REP (repetitive extragenic palindromic sequences). Для всіх штамів виду С. jejuni була характерна наявність ПЛР-продукту розміром 600 п. и. Виявлено п'ять групп ПЛР-сероварів у штамів С. jejuni одного серовару (Lio 32), що різняться за мінорними фрагментами. Це може бути важливим для встановлення джерела інфекції при епідеміологічному аналізі.

References

[1] Fox JG, Taylor NS, Penner JL, Shames B, Gurgis RV, Tomson FN. Investigation of zoonotically acquired Campylobacter jejuni enteritis with serotyping and restriction endonuclease DNA analysis. J Clin Microbiol. 1989;27(11):2423-5.
[2] Nachamkin I, Bohachick K, Patton CM. Flagellin gene typing of Campylobacter jejuni by restriction fragment length polymorphism analysis. J Clin Microbiol. 1993;31(6):1531-6.
[3] Giesendorf BA, van Belkum A, Koeken A, Stegeman H, Henkens MH, van der Plas J, Goossens H, Niesters HG, Quint WG. Development of species-specific DNA probes for Campylobacter jejuni, Campylobacter coli, and Campylobacter lari by polymerase chain reaction fingerprinting. J Clin Microbiol. 1993;31(6):1541-6.
[4] Sultanov GV, Cherkassky BL, Navashin SM et al. A new medium for the diagnosis of campylobacteriosis. Especially dangerous infections in the Caucasus: Proc. sixth boundary scientific. Conf. Stavropol, 1987: 276-8.
[5] Instructions for clinical and laboratory diagnosis of campylobacteriosis. M., 1989. 25 p.
[6] Lior H, Woodward DL, Edgar JA, Laroche LJ, Gill P. Serotyping of Campylobacter jejuni by slide agglutination based on heat-labile antigenic factors. J Clin Microbiol. 1982;15(5):761-8.
[7] Higgins CF, Ames GF, Barnes WM, Clement JM, Hofnung M. A novel intercistronic regulatory element of prokaryotic operons. Nature. 1982;298(5876):760-2.
[8] Versalovic J, Koeuth T, Lupski JR. Distribution of repetitive DNA sequences in eubacteria and application to fingerprinting of bacterial genomes. Nucleic Acids Res. 1991;19(24):6823-31.
[9] Ausubel FM. Current protocols in molecular biology. New York: Wiley, 1987: 241.
[10] Chen WP, Kuo TT. A simple and rapid method for the preparation of gram-negative bacterial genomic DNA. Nucleic Acids Res. 1993;21(9):2260.