Biopolym. Cell. 2014; 30(6):477-480.
Біомедицина
Асоціація між генетичними варіантами PSMB5 і PSMC6 та дитячим ожирінням з-поміж жителів Латвії
1Парамонова Н., 2, 3Купча С., 2, 3Румба-Розенфелде І., 2, 4Сьяксте Н., 1Сьяксте Т.
  1. Геноміки та біоінформатики, Інститут біології
    Латвійський університет
    вул. Мієр 3, Саласпилс, Латвія, LV-2169
  2. Медичний факультет,
    Латвійського університету
    бульвар Раїна 19, Рига, Латвія, LV-1586
  3. Дитяча лікарня університету
    вул. Юглас, 20, Рига, Латвія, LV-1079
  4. Латвійський інститут органічного синтезу
    Вул. Айзкрауклес, 21, Рига, Латвія, LV-1006

Abstract

Згідно з останніми даними, убіквітин-залежна протеасомна сис- тема бере участь у патогенезі ожиріння. Мета. Оцінити можливий зв’язок між генетичними варіантами протеасомних генів PSMB5 і PSMC6 та схильністю до захворювання дитячим ожирінням у Латвійській популяции. Методи. Локуси rs11543947 (PSMB5), rs2295826 і rs2295827 (PSMC6) генотипували у 94 дітей з надлишковою вагою і у 191 здорового індивіда. Оцінку проводили за асоціацією з ожирінням як таким, за сімейною історією та за статтю. Результати. Гетерозиготний генотип, який належить до локусу rs11543947 (PSMB5), виявився помірно асоційованим ( Р < 0,01) із захворюванням як таким і з ожирінням з сімейною історією (співвідношення шансів СШ = 2,445 [95 % ДІ 1.378–4.339] і СШ = 2,746 [95 % ДІ 1.427–5.283] відповідно). Цей генотип найчастіше спостерігався у чоловіків із сімейною історією ожиріння (P < 0,05) та у жінок без сімейної історії (P < 0,01). Гетерозиготні генотипи по локусах rs2295826 і rs2295827 знайдено в помірній асоціації (P < 0,01) в основній групі захворювання і у пацієнтів з сімейною історією (СШ = 2,119 [95 % ДІ 1.207–3.718] і СШ = 2,379 [95 % ДІ 1.249–4.533] відповідно), а також у чоловіків. Багатолокусний генотип rs11543947/rs2295826-rs2295827, представлений гетерозиготами по всіх локусах, і гаплотип, представлений рідкісними алелями, були найчастішими у групі хворих на ожиріння порівняно з контрольною групою (Р < 0,001 і Р = 0,0001 відповідно). Висновки. Генетичні варіації локусів PSMB5 (rs11543947) і PSMC6 (rs2295826 і rs2295827) можуть впливати на схильність до захворювання ожирінням у детей Латвійської популяції.
Keywords: PSMB5, PSMC6, SNPs, ожиріння, сімейне ожиріння, взаємодія генотип–стать

References

[1] Chang TL, Chang CJ, Lee WY, Lin MN, Huang YW, Fan K. The roles of ubiquitin and 26S proteasome in human obesity. Metabolism. 2009;58(11):1643-8.
[2] Sakamoto K, Sato Y, Sei M, Ewis AA, Nakahori Y. Proteasome activity correlates with male BMI and contributes to the differentiation of adipocyte in hADSC. Endocrine. 2010;37(2):274-9.
[3] Otoda T, Takamura T, Misu H, Ota T, Murata S, Hayashi H, Takayama H, Kikuchi A, Kanamori T, Shima KR, Lan F, Takeda T, Kurita S, Ishikura K, Kita Y, Iwayama K, Kato K, Uno M, Takeshita Y, Yamamoto M, Tokuyama K, Iseki S, Tanaka K, Kaneko S. Proteasome dysfunction mediates obesity-induced endoplasmic reticulum stress and insulin resistance in the liver. Diabetes. 2013;62(3):811-24.
[4] Gragnoli C. Overweight condition and waist circumference and a candidate gene within the 12q24 locus. Cardiovasc Diabetol. 2013;12:2.
[5] Kitamura A, Maekawa Y, Uehara H, Izumi K, Kawachi I, Nishizawa M, Toyoshima Y, Takahashi H, Standley DM, Tanaka K, Hamazaki J, Murata S, Obara K, Toyoshima I, Yasutomo K. A mutation in the immunoproteasome subunit PSMB8 causes autoinflammation and lipodystrophy in humans. J Clin Invest. 2011;121(10):4150-60.
[6] Kupca S, Sjakste T, Paramonova N, Sugoka O, Rinkuza I, Trapina I, Daugule I, Sipols AJ, Rumba-Rozenfelde I. Association of obesity with proteasomal gene polymorphisms in children. J Obes. 2013;2013:638154.
[7] Sjakste T, Paramonova N, Wu LS-S, Zemeckiene Z, Sitkauskiene B, Sakalauskas R, et al. PSMA6 (rs2277460, rs1048990), PSMC6 (rs2295826, rs2295827) and PSMA3 (rs2348071) genetic diversity in Latvians, Lithuanians and Taiwanese. Meta Gene. 2014;2:283–98.
[8] Sjakste T, Paramonova N, Rumba-Rozenfelde I, Trapina I, Sugoka O, Sjakste N. Juvenile idiopathic arthritis subtype- and sex-specific associations with genetic variants in the PSMA6/PSMC6/PSMA3 gene cluster. Pediatr Neonatol. 2014;55(5):393-403.
[9] Hammer Q, Harper D, Ryan P. Past: Paleontological Statistics software packarge for education and data analysis. Paleontologija Electronica. 2001; 4(1):9pp
[10] Rozas J. DNA sequence polymorphism analysis using DnaSP. Methods Mol Biol. 2009;537:337-50.
[11] Lewis CM. Genetic association studies: design, analysis and interpretation. Brief Bioinform. 2002;3(2):146-53.
[12] Shi H, Jiang B, Wei Sim JD, Chum ZZ, Ali NB, Toh MH. Factors associated with obesity: a case-control study of young adult Singaporean males. Mil Med. 2014;179(10):1158-65.
[13] Bennet L, Lindblad U, Franks PW. A family history of diabetes determines poorer glycaemic control and younger age of diabetes onset in immigrants from the Middle East compared with native Swedes. Diabetes Metab. 2014 . pii: S1262-3636(14)00136-0.
[14] Benjamin AM, Suchindran S, Pearce K, Rowell J, Lien LF, Guyton JR, McCarthy JJ. Gene by sex interaction for measures of obesity in the framingham heart study. J Obes. 2011;2011:329038.
[15] Heid IM, Jackson AU, Randall JC, Winkler TW, Qi L, Steinthorsdottir V, Thorleifsson G, Zillikens MC, Speliotes EK, M?gi R, Workalemahu T, White CC, Bouatia-Naji N, Harris TB, Berndt SI, Ingelsson E, Willer CJ, Weedon MN, Luan J, Vedantam S, Esko T, Kilpel?inen TO, Kutalik Z, Li S, Monda KL, Dixon AL, Holmes CC, Kaplan LM, Liang L, Min JL, Moffatt MF, Molony C, Nicholson G, Schadt EE, Zondervan KT, Feitosa MF, Ferreira T, Lango Allen H, Weyant RJ, Wheeler E, Wood AR; MAGIC, Estrada K, Goddard ME, Lettre G, Mangino M, Nyholt DR, Purcell S, Smith AV, Visscher PM, Yang J, McCarroll SA, Nemesh J, Voight BF, Absher D, Amin N, Aspelund T, Coin L, Glazer NL, Hayward C, Heard-Costa NL, Hottenga JJ, Johansson A, Johnson T, Kaakinen M, Kapur K, Ketkar S, Knowles JW, Kraft P, Kraja AT, Lamina C, Leitzmann MF, McKnight B, Morris AP, Ong KK, Perry JR, Peters MJ, Polasek O, Prokopenko I, Rayner NW, Ripatti S, Rivadeneira F, Robertson NR, Sanna S, Sovio U, Surakka I, Teumer A, van Wingerden S, Vitart V, Zhao JH, Cavalcanti-Proen?a C, Chines PS, Fisher E, Kulzer JR, Lecoeur C, Narisu N, Sandholt C, Scott LJ, Silander K, Stark K, Tammesoo ML, Teslovich TM, Timpson NJ, Watanabe RM, Welch R, Chasman DI, Cooper MN, Jansson JO, Kettunen J, Lawrence RW, Pellikka N, Perola M, Vandenput L, Alavere H, Almgren P, Atwood LD, Bennett AJ, Biffar R, Bonnycastle LL, Bornstein SR, Buchanan TA, Campbell H, Day IN, Dei M, D?rr M, Elliott P, Erdos MR, Eriksson JG, Freimer NB, Fu M, Gaget S, Geus EJ, Gjesing AP, Grallert H, Gr?ssler J, Groves CJ, Guiducci C, Hartikainen AL, Hassanali N, Havulinna AS, Herzig KH, Hicks AA, Hui J, Igl W, Jousilahti P, Jula A, Kajantie E, Kinnunen L, Kolcic I, Koskinen S, Kovacs P, Kroemer HK, Krzelj V, Kuusisto J, Kvaloy K, Laitinen J, Lantieri O, Lathrop GM, Lokki ML, Luben RN, Ludwig B, McArdle WL, McCarthy A, Morken MA, Nelis M, Neville MJ, Par? G, Parker AN, Peden JF, Pichler I, Pietil?inen KH, Platou CG, Pouta A, Ridderstr?le M, Samani NJ, Saramies J, Sinisalo J, Smit JH, Strawbridge RJ, Stringham HM, Swift AJ, Teder-Laving M, Thomson B, Usala G, van Meurs JB, van Ommen GJ, Vatin V, Volpato CB, Wallaschofski H, Walters GB, Widen E, Wild SH, Willemsen G, Witte DR, Zgaga L, Zitting P, Beilby JP, James AL, K?h?nen M, Lehtim?ki T, Nieminen MS, Ohlsson C, Palmer LJ, Raitakari O, Ridker PM, Stumvoll M, T?njes A, Viikari J, Balkau B, Ben-Shlomo Y, Bergman RN, Boeing H, Smith GD, Ebrahim S, Froguel P, Hansen T, Hengstenberg C, Hveem K, Isomaa B, J?rgensen T, Karpe F, Khaw KT, Laakso M, Lawlor DA, Marre M, Meitinger T, Metspalu A, Midthjell K, Pedersen O, Salomaa V, et al. Meta-analysis identifies 13 new loci associated with waist-hip ratio and reveals sexual dimorphism in the genetic basis of fat distribution. Nat Genet. 2010;42(11):949-60.
[16] Paramonova N, Wu L. Shi-Shin, Rumba-Rozenfelde I, Wang J-Y, Sjakste N, Sjakste T. Genetic variants in the PSMA6, PSMC6 and PSMA3 genes associated with childhood asthma in Latvian and Taiwanese populations. Biopolym Cell. 2014; 30(5):377–87.
[17] Kalnina J, Paramonova N, Sjakste N, Sjakste T. Study of association between polymorphisms in the PSMB5 (rs11543947) and PSMA3 (rs2348071) genes and multiple sclerosis in Latvians. Biopolym Cell. 2014; 30(4):305–9.
[18] Kaufman F. Type 2 diabetes mellitus in children and adolescents: the new epidemic. Obesity in Childhood and Adolescence, W. Keiss, C. Marcus, and M. Wabitsch, EdsKarger, Hillside, NJ, USA, 2004: 183-4.
[19] de Luca C, Olefsky JM. Stressed out about obesity and insulin resistance. Nat Med. 2006;12(1):41-2.