Biopolym. Cell. 1993; 9(6):31-35.
http://dx.doi.org/10.7124/bc.00037D
Структура та функції біополімерів
Конформационназміна тирозил-тРНК синтетази з печінки бика при взаємодії з гомологичной тРНКTyr за даними флюоресцентной спектроскопії
1Кліменко І. В., 1Корнелюк О. І., 1Мацука Г. Х.
  1. Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
    Вул. Академіка Заболотного, 150, Київ, Україна, 03680

Abstract

Флюоресцентный зонд AEDANS ковалентно приєднували до тирозил- тРНК синтетази із печінки бика (КФ 6.1.1.1). Стехіометрія зв'язування складає біля двох молекул зонда на димеїр ферменту. Для вимірювання відстаней між шістьма триптофановими залишками синтетази (донор) та ковалентно приєднаним AEDANS (акцептор) використовували синглет-синглетний перенос енергії за Ферстеровським механізмом. У вільному ферменті середня відстань донор–акцептор складає 2,74 нм. Взаємодія гомологічної тРНКTyr з тирозил-тРНК синтетазою з печінки бика призводила до збільшення флюоресценції AEDANS-міченого ферменту (25%). Після зв'язування з гомологічною тРНКTyr середня відстань між триптофановими залишками і зондом AEDANS зменшилася до 2,53 нм. Гетерологічна тРНКTyr із Е. соlі не індукувала таких змін. Додавання ATP до комплексу синтетази з голомогічною тРНКTyr викликає подальше збільшення флюоресценції AEDANS (32 %) та скорочення відстані донор– акцептор до 2,41 нм. Ці результати свідчать про конформаційні зміни іеукаріотичної тирозил-тРНК синтетази при взаємодії з гомологічною тРНКTyr .
Повний текст: (PDF, російською)

References

[1] Kisselev LL., Favorova OO, Lavrik OI. Biosynthesis of proteins from amino acids to aminoacyl-tRNA. Moscow, Nauka, 1984; 408 p.
[2] Riesner D, Pingoud A, Boehme D, Peters F, Maass G. Distinct steps in the specific binding of tRNA to aminoacyl-tRNA synthetase. Temperature-jump studies on the serine-specific system from yeast and the tyrosine-specific system from Escherichia coli. Eur J Biochem. 1976;68(1):71-80.
[3] Krauss G, Riesner D, Maass G. Mechanism of discrimination between cognate and non-cognate tRNAs by phenylalanyl-tRNA synthetase from yeast. Eur J Biochem. 1976;68(1):81-93.
[4] Rould MA, Perona JJ, Steitz TA. Structural basis of anticodon loop recognition by glutaminyl-tRNA synthetase. Nature. 1991;352(6332):213-8.
[5] Cavarelli J, Rees B, Ruff M, Thierry JC, Moras D. Yeast tRNA(Asp) recognition by its cognate class II aminoacyl-tRNA synthetase. Nature. 1993;362(6416):181-4.
[6] Korneliuk AI, Kurochkin IV, Matsuka GKh. Tyrosyl-tRNA synthetase from the bovine liver. Isolation and physico-chemical properties. Mol Biol (Mosk). 1988;22(1):176-86.
[7] Stryer L. Fluorescence energy transfer as a spectroscopic ruler. Annu Rev Biochem. 1978;47:819-46.
[8] Ehrenberg M, Cronvall E, Rigler R. Fluorescence of proteins interacting with nucleic acids. Correction for light absorption. FEBS Lett. 1971;18(2):199-203.
[9] Grinvald A, Haas E, Steinberg IZ. Evaluation of the distribution of distances between energy donors and acceptors by fluorescence decay. Proc Natl Acad Sci U S A. 1972;69(8):2273-7.
[10] Wu CW, Stryer L. Proximity relationships in rhodopsin. Proc Natl Acad Sci U S A. 1972;69(5):1104-8.
[11] Haas E, Katchalski-Katzir E, Steinberg IZ. Effect of the orientation of donor and acceptor on the probability of energy transfer involving electronic transitions of mixed polarization. Biochemistry. 1978;17(23):5064-70.
[12] Klimenko IV. Polarization of fluorescence and viscosity of microenvironment of tryptophan residues of eukaryotic tyrosyl-tRNA synthetase. Biopolym Cell. 1992; 8(3):3-6.
[13] Hudson EN, Weber G. Synthesis and characterization of two fluorescent sulfhydryl reagents. Biochemistry. 1973;12(21):4154-61.