Biopolym. Cell. 1993; 9(5):61-66.
Структура та функції біополімерів
Передбачення вторинної структури білків модифікованим GUHA-методом
1Братусь А. В., 1Мальченко С. З., 1Чащин М. О.
  1. Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
    Вул. Академіка Заболотного, 150, Київ, Україна, 03680

Abstract

У роботі запропоновано новий метод передбачення вторинної структури білка, що базується на відомому в галузі експертних систем GUHA-методі. Навчання та передбачення грунтуються на інформації про вторинну структуру 108 білків (біля 20000 амінокислотних залишків) з рентгенострухтурним розділенням менше 0,2 нм. Середня точність передбачення з використаного в роботі банку даних складає для α-спіралі - 74 %, β-складки – 67 %, нерегулярної структури – 71 %; загальна – 68%

References

[1] Sternberg MJ, Islam SA. Local protein sequence similarity does not imply a structural relationship. Protein Eng. 1990;4(2):125-31.
[2] Hajek P, Havranek T. Mechanizing Hypothesis Formation: Mathematical Foundations for a General Theory. Springer; 1978 416 p.
[3] Maltchenko SZ, Chaschin NA. Prediction of protein secondary structures. Biopolym Cell. 1992; 8(5):21-31.