Biopolym. Cell. 1991; 7(6):88-91.
http://dx.doi.org/10.7124/bc.000304
Структура та функції біополімерів
Пакет прикладних програм для класифікації білків за їхнім амінокислотним складом і первинною структурою
1Париліс І. І., 1Казанов Є. Ю., 1Саліхов Р. С., 1Юкельсон Л. Я., 1Хамідов Д. Х.
  1. Інститут біохімії Академії наук Республіки Узбекистан
    Ташкент, Узбекистан

Abstract

В роботі запропоновано метод класифікації білків по амінокислотному складу та первинній структурі на основі нової попарної відстані. Описано пакет прикладних програм для реалізації цього методу на IBM-сумісній персональній ЕОМ. Програми, що входять в пакет, дають можливість співставляти одержані для нової відстані результати з традиційними. Приведено достатній критерій для класифікації білків.
Повний текст: (PDF, російською)

References

[1] Dayhoff MO. Atlas of protein sequence and structure. Washington, 1973. Suppl 1:112.
[2] Fitch WM, Margoliash E. Construction of phylogenetic trees. Science. 1967;155(3760):279-84.
[3] Vapnik VN. Restore dependency on empirical data. M. Nauka, 1979. 340 p.
[4] Parilis II, Bussel' GL, Iukel'son LIa, Khamidov DKh. Classification and identification of toxic polypeptides using a pattern recognition method. Mol Biol (Mosk). 1988;22(6):1697-701.
[5] Parilis II, Salikhov RS, Mirkhodzhayev DB. et al. Comparative analysis of the nerve growth factor (NGF) by use of computer programs. . Dokl Akad Nauk UzSSSR. 1990; 11(1):53-5.
[6] Ayala FJ. Evolution: molecular biology provides effective methods for reconstructing phylogeny. Zh Obshch Biol. 1986;47(4):479-93.
[7] Selby MJ, Edwards RH, Rutter WJ. Cobra nerve growth factor: structure and evolutionary comparison. J Neurosci Res. 1987;18(2):293-8.
[8] Graur D, Bdolah A, Wollberg Z, Kochva E. Homology between snake venom sarafotoxins and mammalian endothelins. Isr J Zool. 1988/ 1989; 35:171-5.
[9] Tamiya N, Maeda N, Cogger HG. Neurotoxins from the venoms of the sea snakes Hydrophis ornatus and Hydrophis lapemoides. Biochem J. 1983;213(1):31-8.
[10] Zykova TA, Kozlovskaia EP. Amino acid sequence of a neurotoxin from the anemone Radianthus macrodactylus. Bioorg Khim. 1989;15(10):1301-6.