Biopolym. Cell. 1991; 7(5):37-41.
http://dx.doi.org/10.7124/bc.0002F0
Структура та функції біополімерів
Вплив термінальної модифікації олігонуклеотидів на їхню стабільність у клітинах мікоплазм
1Власов В. В., 1Заритова В. Ф., 1Іванова К. М., 1Крєндєлєв Ю. Д., 2Овандер М. М., 1Райт А. С.
  1. Інститут хімичної біології і фундаментальної медицини СО РАН
    пр. ак. Лаврентьєва, 8, Новосибірськ, Російська Федерація, 630090
  2. Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
    Вул. Академіка Заболотного, 150, Київ, Україна, 03680

Abstract

Досліджено вплив модифікації 5'- і З'-кінцевих ланок дезоксирибонуклеотидів на їх стабільність в культуральному середовищі та клітинах мікоплазм Acholeplasma Iaidlawii PG-8 і Mycoplasma capricolum California Kid. Показано, що в середовищі з 10 % сироватки коня всі похідні стабільні на протязі 24 год. В середовищі з мікоплазмами, а також всередині клітин всі незахищені з 5'-кінця олігонуклеотиди швидко руйнуються до мононуклеотидів і дефосфорилюються. В клітинах утворений фосфат реутилізується. Феназінієва або холестеринова групи на З'-кінці олігонуклеотидів перешкоджають його руйнуванню. Похідні від гетерогенних олігонуклеотидів руйнуються швидше, ніж оліготиміділати. Модифікація олігонуклеотидів по 5'-кінцю шляхом утворення 5'-фосфамідів перешкоджає їх дефосфорилюванню та уповільнює деградацію олігонуклеотидів. Останні, захищені з 3'- та 5'-кінців, є найбільш стабільними по відношенню до дії нуклеаз мікоплазм.
Повний текст: (PDF, російською)

References

[1] Knorre DG, Vlassov VV, Zarytova VF, Lebedev AV. Reactive oligonucleotide derivatives as tools for site specific modification of biopolymers. Sov. Sci. Rev. 1989; 12(5):271-339.
[2] Letsinger RL, Zhang GR, Sun DK, Ikeuchi T, Sarin PS. Cholesteryl-conjugated oligonucleotides: synthesis, properties, and activity as inhibitors of replication of human immunodeficiency virus in cell culture. Proc Natl Acad Sci U S A. 1989;86(17):6553-6.
[3] Uhlmann E, Peyman A. Antisense oligonucleotides: a new therapeutic principle. Chem Rev. 1990;90(4):543–84.
[4] Stanbridge EJ, Reff ME. The mycoplasmas. Eds M. F. Barile, S. Razin. New York: Acad, press, 1979. Vol. I: 157-85.
[5] Lo SC, Dawson MS, Wong DM, Newton PB 3rd, Sonoda MA, Engler WF, Wang RY, Shih JW, Alter HJ, Wear DJ. Identification of Mycoplasma incognitus infection in patients with AIDS: an immunohistochemical, in situ hybridization and ultrastructural study. Am J Trop Med Hyg. 1989;41(5):601-16.
[6] Chowdhury IH, Munakata T, Koyanagi Y, Kobayashi S, Arai S, Yamamoto N. Mycoplasma can enhance HIV replication in vitro: a possible cofactor responsible for the progression of AIDS. Biochem Biophys Res Commun. 1990;170(3):1365-70.
[7] Zarytova VF, Ivanova EM, Romanenko VP. Synthesis of oligonucleotides by phosphotriester approach in chloroform. Bioorg Khim. 1983; 9(4):516-21.
[8] Zarytova VF, Ivanova EM, Chasovskikh MN. Synthesis of steroid-containing oligonucleotides and their alkylating derivatives. Bioorg Khim. 1990;16(5):610-6.
[9] Zarytova VF, Ivanova EM, Kutyavin IV synthesis derivatives of oligodeoxyribonucleotides containing at the 3'-end of the chain residue N-(2-hydroxyethyl)-phenazinium Izvestia SO AN USSR. khim seria 1989;(6):3—9.
[10] Maniatis T, Fritsch EF, Sambrook J. Molecular cloning: a laboratory manual. New York: Cold Spring Harbor Lab, 1982; 545 p.
[11] Godovikova TS, Zarytova VF, Mal'tseva TV, Khalimskaia LM. Active derivatives of oligonucleotides with a zwitterionic terminal phosphate group for design of affinity reagents and probes. Bioorg Khim. 1989;15(9):1246-52.
[12] Grineva NI, Lomakina TS, Tegeyeva NG, Chimitova TA. Kinetics of the C–Cl bond ionization in the nucleoside and oligonucleotide 4-(N-2-chloroethyl-N-methylamino)benzyl 5'-phosphamides. Bioorg Khim. 1977; 3(2):210-214