Biopolym. Cell. 1991; 7(1):22-24.
http://dx.doi.org/10.7124/bc.0002AC
Алгоритм прискореної побудови точкових матриць гомології
1Шепелев В. О.
  1. Інститут молекулярної генетики АН СРСР
    Москва, СРСР

Abstract

Метод аналізу гомологічних ділянок за допомогою точкових матриць гомології складається із знаходження відображення на прямокутній матриці загальних для двох послідовностей слів, цебто послідовностей довжиною W, в яких співпадають не менше M літер. Запропоновано алгоритм прискореного створення таких матриць з різними параметрами фільтрації.
Повний текст: (PDF, російською)

References

[1] Gibbs AJ, McIntyre GA. The diagram, a method for comparing sequences. Its use with amino acid and nucleotide sequences. Eur J Biochem. 1970;16(1):1-11.
[2] Staden R. An interactive graphics program for comparing and aligning nucleic acid and amino acid sequences. Nucleic Acids Res. 1982;10(9):2951-61.
[3] Golovanov EI, Shepelev VA, Aleksandrov AA. Software system for the study of nucleotide sequences on microcomputers Iskra-226. Theor. research and molecular data base on biology and genetics. Novosibirsk, 1986:59-60.