Biopolym. Cell. 1990; 6(6):52-58.
Пошук гігантських ДНК-білкових комплексів за допомогою ЕОМ
1Лукіна Н. І., 2Сойдла Т. Р.
  1. Ленінградський політехнічний інститут
    Ленінград, СРСР
  2. Ленінградський інститут ядерної фізики ім. Б. П. Константинова АН СРСР
    Гатчина, Ленінградська обл., СРСР

Abstract

Створено дві програми для виявлення та візуалізації просторової асиметрії ДНК. З їхньою допомогою проаналізовано 2 мкм плазміду дріжджів-сахароміцетів. Виявлено ділянку особливої орієнтації G–С-пар. Розташування цієї ділянки збігається з локалізацією ненуклеосомного ДНК-білкового комплексу, виявленого раніше в експериментальній роботі. Створені програми можуть бути використані для пошуку великих ДНК-білкових комплексів.

References

[1] Johnson PF, McKnight SL. Eukaryotic Transcriptional Regulatory Proteins. Annu Rev Biochem. 1989;58(1):799–839.
[2] Saenger W. Principles of nucleic acid structure. New York: Springer, 1984; 556 p.
[3] Goulet I, Zivanovic Y, Prunell A. Helical repeat of DNA in solution. The V curve method. Nucleic Acids Res. 1987;15(7):2803-21.
[4] Satchwell SC, Drew HR, Travers AA. Sequence periodicities in chicken nucleosome core DNA. J Mol Biol. 1986;191(4):659-75.
[5] Hartley JL, Donelson JE. Nucleotide sequence of the yeast plasmid. Nature. 1980;286(5776):860-5.
[6] So?dla TR, Nevzgliadova OV. A 2-um plasmid of Saccharomyces. Mol Biol (Mosk). 1987;21(6):1467-79.
[7] Murray JA, Cesareni G. Functional analysis of the yeast plasmid partition locus STB. EMBO J. 1986;5(12):3391-9.
[8] Fagrelius TJ, Livingston DM. Location of DNAase I sensitive cleavage sites in the yeast 2 micron plasmid DNA chromosome. J Mol Biol. 1984;173(1):1-13.
[9] Veit BE, Fangman WL. Chromatin organization of the Saccharomyces cerevisiae 2 microns plasmid depends on plasmid-encoded products. Mol Cell Biol. 1985;5(9):2190-6.
[10] Ptashne M. Gene regulation by proteins acting nearby and at a distance. Nature. 1986 Aug 21-27;322(6081):697-701.