Biopolym. Cell. 1990; 6(4):59-65.
http://dx.doi.org/10.7124/bc.00027E
Структура та функції біополімерів
Дослідження взаємодії похідного тPHKPhe, що несе арилазидогрупу на залишку G24, з рибосомами Escherichia coli і тРНК-(Аденін-1)- метилтрансферазою з Thermus thermophilus
1Венкстерн Т. В., 2Грайфер Д. М., 2Карпова Г. Г., 1Морозов І. А.
  1. Інститут молекулярної біології ім. В. А. Енгельгардта АН СРСР
    Москва, СРСР
  2. Інститут біоорганічної хімії Сибірського відділення АН СРСР
    Новосибірськ, СРСР

Abstract

За допомогою похідного тPHKPhe Е. coli, що несе арилазидогрупу на залишку G24, вивчено фотоафінну модифікацію рибосом Е. coli і тРНК-(аденін-1-) метилтрансферази з Т. thermophilus. Показано, що похідне тРНК при опроміненні УФ-світлом (λ > 310 нм) ковалентно приєднується до тРНК-(аденін-1-) метилтрансфераза, але не приєднується до рибосом при локалізації як в A-, так і в Р-ділянці.
Повний текст: (PDF, російською)

References

[1] Vlasov VV, Lavrik OI, Mamaev SV, Khodyreva SN, Chizhikov VE. Chemical modification of phenylalanyl-tRNA synthetase and ribosomes of Escherichia coli with derivatives of tRNA-Phe carrying photoreactive groups on guanosine residues. Mol Biol (Mosk). 1980;14(3):531-8.
[2] Vladimirov SN, Graifer DM, Karpova GG. The proteins of donor tRNA-binding site of Escherichia coli ribosomes. FEBS Lett. 1981;135(1):155-8.
[3] Graifer DM, Babkina GT, Matasova NB, Vladimirov SN, Karpova GG, Vlassov VV. Structural arrangement of tRNA binding sites on Escherichia coli ribosomes, as revealed from data on affinity labelling with photoactivatable tRNA derivatives. Biochim Biophys Acta. 1989;1008(2):146-56.
[4] Gusak NM, Levitina TL, Atepalikhina SA, Kirilenko MT, Gudkova LV, Kozlov EA Tryptic peptides of Penicillium vitale catalase. 3. The structure of some peptides. Biopolym. Cell. 1989; 5(1):45-51.
[5] Gimautdinova OI, Gorshkova II, Karpova GG, Kutiavin IV, Graĭfer DM. Selective alkylation of G24 residue in tRNAPhe. Mol Biol (Mosk). 1984;18(5):1419-23.
[6] Sprinzl M, Grüter F, Gauss DH. Collection of published tRNA sequences. Nucleic Acids Res. 1978;5(5):r15-r27.
[7] Vlasov VV, Grishaev MP, Mamaev SM, Chizhikov VE, Khodyreva SN. Alkylation of tRNA-Phe free and bound to phenylalanyl-tRNA synthetase with 4-(N-2-chloroethyl-N-methylamino)benzylamine. Mol Biol (Mosk). 1981;15(1):45-53.
[8] Buckingham R. H., Kurlatid C. G. Interaction between UGA-suppressor tRNAT r p and the ribosome; mechanisms of tRNA selection. Transfer RNA: Biol. Aspects. New York: Cold Spring Harbor, 1980:421-426.
[9] Morozov IA, Gambarian AS, Venkstern TV. tRNA(adenine-1-)-methyltransferase from Thermus thermophilus HB8. Mol Biol (Mosk). 1984;18(5):1363-8.
[10] Kirillov SV, Makhno VI, Semenkov YP. Mechanism of codon-anticodon interaction in ribosomes. Direct functional evidence that isolated 30S subunits contain two codon-specific binding sites for transfer RNA. Nucleic Acids Res. 1980;8(1):183-96.
[11] Gimautdinova OI, Gorn VV, Gorshkova II, Graĭfer DM, Karpova GG. Alkylation of tRNAPhe with 4-(N-2-chloroethyl-N-methylamino) benzyl-5'-phosphamide of d(ATTTTCA). Bioorg Khim. 1986;12(4):490-8.
[12] Babkina GT, Karpova GG, Matasova NB. Affinity modification of Escherichia coli ribosomes near the acceptor tRNA-binding site. Mol Biol (Mosk). 1984;18(5):1287-96.
[13] Venkstern TV, Graĭfer DM, Gracheva EA, Karpova GG, Morozov IA. Interaction of s4U8 region of tRNA Phe with tRNA-(adenine-1-)-methyltransferase from Thermus thermophilus. Bioorg Khim. 1987;13(10):1344-50.
[14] Kirillov SV, Kemkhadze KS, Makarov EM, Makhno VI, Odintsov VB, Semenkov YP. Mechanism of codon-anticodon interaction in ribosomes: codon-anticodon interaction of aminoacyl-tRNA at the ribosomal donor site. FEBS Lett. 1980;120(2):221-4.
[15] Douthwaite S, Garrett RA, Wagner R. Comparison of Escherichia coli tRNAPhe in the free state, in the ternary complex and in the ribosomal A and P sites by chemical probing. Eur J Biochem. 1983;131(2):261-9.
[16] Bertram S, Göringer U, Wagner R. Structural investigation of Phe-tRNAPhe from E.coli bound to the ribosomal A-site. Nucleic Acids Res. 1983;11(3):575-89.
[17] Peattie DA, Herr W. Chemical probing of the tRNA--ribosome complex. Proc Natl Acad Sci U S A. 1981;78(4):2273-7.
[18] Morozov IA, Gambaryan AS, Lvova TN, Nedospasov AA, Venkstern TV. Purification and characterization of tRNA (adenine-1-)-methyltransferase from Thermus flavus strain 71. Eur J Biochem. 1982;129(2):429-36.
[19] Borisova OF. Morozov IA, Kuznetsova NV, Gambaryan AS, Venkstern TV. A study of tRNA(adenine-1-)-methyltransferase and its complexes with tRNA by means of tryptophan residues. Mol Biol (Mosk). 1986; 20(4):1126-37