Biopolym. Cell. 1990; 6(1):96-99.
Генно-інженерна біотехнологія
Ексцизія повторюваних послідовностей ядерного геному клітин HeLa як можливий механізм утворення мінікольцевих ДНК
1Телегєєв Г. Д., 1Зозуля І. В., 1Малюта С. С.
  1. Інститут молекулярної біології і генетики АН УСРС
    Київ, СРСР

Abstract

За допомогою проклонованихмолекул мінікільцевих ДНК (мкДНК) вивчали копійность цих структур у геномі клітин HeLa. Показано, що обидва мк-зонди мають гомологію з хромосомною ДНК і представлені в ній безліччю копій (800–900). Обробка культури циклогексимідом, а також старіння клітин in vitro призводять до 0,2–2 -разового зменшення копійності досліджуваних мкДНК у геномі з одночасним збільшенням їхнього вмісту в екстрахромосомній фракції. Найвірогіднішим механізмом для пояснення цього процесу є рекомбінація повторів з подальшою їхньою ексцизією у кільцевій формі.

References

[1] Smith CA, Vinograd J. Small polydisperse circular DNA of HeLa cells. J Mol Biol. 1972;69(2):163-78.
[2] Stanfield S, Helinski DR. Small circular DNA in Drosophila melanogaster. Cell. 1976;9(2):333-45.
[3] Sunnerhagen P, Sj?berg RM, Karlsson AL, Lundh L, Bjursell G. Molecular cloning and characterization of small polydisperse circular DNA from mouse 3T6 cells. Nucleic Acids Res. 1986;14(20):7823-38.
[4] Stanfield SW, Helinski DR. Cloning and characterization of small circular DNA from Chinese hamster ovary cells. Mol Cell Biol. 1984;4(1):173-80.
[5] Kunisada T, Yamagishi H. Sequence repetition and genomic distribution of small polydisperse circular DNA purified from HeLa cells. Gene. 1984;31(1-3):213-23.
[6] Riabowol K, Shmookler Reis RJ, Goldstein S. Interspersed repetitive and tandemly repetitive sequences are differentially represented in extrachromosomal covalently closed circular DNA of human diploid fibroblasts. Nucleic Acids Res. 1985;13(15):5563-84.
[7] DeLap RJ, Rush MG. Change in quantity and size distribution of small circular DNAs during development of chicken bursa. Proc Natl Acad Sci U S A. 1978;75(12):5855-9.
[8] Wiberg FC, Sunnerhagen P, Bjursell G. New, small circular DNA in transfected mammalian cells. Mol Cell Biol. 1986;6(2):653-62.
[9] Yamagishi H, Kunisada T, Tosu M, Sekiguchi T. Extrachromosomal circular DNAs in interspecific mouse-rat reconstituted cells. Gann. 1984;75(1):36-42.
[10] Bell GI, Karam JH, Rutter WJ. Polymorphic DNA region adjacent to the 5' end of the human insulin gene. Proc Natl Acad Sci U S A. 1981;78(9):5759-63.
[11] Kafatos FC, Jones CW, Efstratiadis A. Determination of nucleic acid sequence homologies and relative concentrations by a dot hybridization procedure. Nucleic Acids Res. 1979;7(6):1541-52.
[12] Rigby PW, Dieckmann M, Rhodes C, Berg P. Labeling deoxyribonucleic acid to high specific activity in vitro by nick translation with DNA polymerase I. J Mol Biol. 1977;113(1):237-51.
[13] Telegeev GD, Maliuta SS. HeLa minicircular D1NA cloning in Escherichia coli cells and analysis of recombinant clones obtained. Proc. 4th Soviet-Italian 'Symp. Pushchino 1986:65-6-8.
[14] Kiyama R, Okumura K, Matsui H, Bruns GA, Kanda N, Oishi M. Nature of recombination involved in excision and rearrangement of human repetitive DNA. J Mol Biol. 1987;198(4):589-98.
[15] Jones RS, Potter SS. L1 sequences in HeLa extrachromosomal circular DNA: evidence for circularization by homologous recombination. Proc Natl Acad Sci U S A. 1985;82(7):1989-93.
[16] Krolewski JJ, Rush MG. Some extrachromosomal circular DNAs containing the Alu family of dispersed repetitive sequences may be reverse transcripts. J Mol Biol. 1984;174(1):31-40.
[17] Varshavsky A. On the possibility of metabolic control of replicon "misfiring": relationship to emergence of malignant phenotypes in mammalian cell lineages. Proc Natl Acad Sci U S A. 1981;78(6):3673-7.
[18] Fujimoto S, Yamagishi H. Isolation of an excision product of T-cell receptor alpha-chain gene rearrangements. Nature. 1987;327(6119):242-3.
[19] Okazaki K, Sakano H. Thymocyte circular DNA excised from T cell receptor alpha-delta gene complex. EMBO J. 1988;7(6):1669-74.
[20] Okazaki K, Davis DD, Sakano H. T cell receptor beta gene sequences in the circular DNA of thymocyte nuclei: direct evidence for intramolecular DNA deletion in V-D-J joining. Cell. 1987;49(4):477-85.
[21] Ivanov PL, Akulichev AV, Ryskov AP. Expression of genome repetitive sequences in rat bone marrow cells: cloning and characteristics of cDNA-copies of L1 element transcripts. Genetika. 1987;23(8):1349-59. Russian.