Biopolym. Cell. 1989; 5(4):58-62.
Структура та функції біополімерів
Нуклеотидна послідовність великого повтору 5S ДНК у диплоїдної пшениці Triticum monococcum L.
1Вахітов В. А, 1Ніконоров Ю. М.
  1. Відділ біохімії та цитохімії, Башкирської філії АН СРСР
    Уфа, СРСР

Abstract

Визначено нуклеотидну послідовність великої повторюваної одиниці 5S ДНК у диплоїдної пшениці Т. monococcum протяжністю 485 п. н. Показано, що відмінності у розмірах двох родин повторів 5S ДНК у даного виду пшениці пов’язані з делецією 154 п. н. у центральній області міжгенного спейсера. Виявлено високу гомологію областей, що кодують 5S рРНК, термінуючих послідовностей, 3'-кінців міжгенних спейсерів в обох родинах повторів 5S ДНК, а також між повторами однакової протяжності у двох зразків Т. monococcum. Встановлено, що на відміну від дводольних рослин у вивчених видів злаків послідовність ATATATATTA локалізована ближче до 5'-кінця міжгенного спейсера.

References

[1] Vakhitov VA, Nikonorov IuM. Primary structure of the 5S rRNA gene with shortened non-transcribed spacer in diploid wheat Triticum monococcum L. Mol Biol (Mosk). 1988;22(2):406-13.
[2] Vakhitov VA, Gimalov FR, Shumiatskii GP. Nucleotide sequences of 5S rRNA genes of polyploid species of wheat and Aegilops species. Mol Biol (Mosk). 1989;23(2):431-40.
[3] Mackay RM, Spencer DF, Doolittle WF, Gray MW. Nucleotide sequences of wheat-embryo cytosol 5-S and 5.8-S ribosomal ribonucleic acids. Eur J Biochem. 1980;112(3):561-76.
[4] Vakhitov VA, Gimalov FR, Nikonorov IuM. Determination of the copy number of genes for 5S rRNA and tRNA in genomes of 43 species of wheat and Aegilops. Genetika. 1986; 22(4):676-83.
[5] Gerlach WL, Dyer TA. Sequence organization of the repeating units in the nucleus of wheat which contain 5S rRNA genes. Nucleic Acids Res. 1980;8(21):4851-65.
[6] Nosikov VV, Braga EA. Ribosomal RNA genes. Itogi nauki i tekhniki. Moscow, VINITI, 1982;(Ser. Biol. Khimiya; Vol. 18) 110-215
[7] Mazin AL, Vaniushin BF. The loss of CpG dinucleotides from DNA. I. Methylated and non-methylated genome compartments in eukaryotes with different levels of 5-methylcytosine in DNA. Mol Biol (Mosk). 1987;21(2):543-51.
[8] Mazin AL, Vaniushin BF. The loss of CpC dinucleotides from DNA. II. Methylated and non-methylated genes of vertebrates. Mol Biol (Mosk). 1987;21(2):552-62.
[9] Pieler T, Oei SL, Hamm J, Engelke U, Erdmann VA. Functional domains of the Xenopus laevis 5S gene promoter. EMBO J. 1985;4(13B):3751-6.
[10] Morton DG, Sprague KU. In vitro transcription of a silkworm 5S RNA gene requires an upstream signal. Proc Natl Acad Sci U S A. 1984;81(17):5519-22.
[11] Hemleben V, Werts D. Sequence organization and putative regulatory elements in the 5S rRNA genes of two higher plants (Vigna radiata and Matthiola incana). Gene. 1988;62(1):165-9.
[12] Rafalski JA, Wiewiorowski M, Soll D. Organization and nucleotide sequence of nuclear 5S rRNA genes in yellow lupin (Lupinus luteus). Nucleic Acids Res. 1982;10(23):7635-42.
[13] Hariharan N, Reddy PS, Padayatty JD. 5S-rRNA genes in rice embryos. Plant Mol Biol. 1987;9(5):443-51.
[14] Lawrence GJ, Appels R. Mapping the nucleolus organizer region, seed protein loci and isozyme loci on chromosome 1R in rye. Theor Appl Genet. 1986;71(5):742-9.