Biopolym. Cell. 1989; 5(4):24-30.
Структура та функції біополімерів
Зустрічальність гомопурин-гомопіримідинових дзеркальних повторів у природних ДНК
1Субоч Г. М., 1Сприжицький Ю. А., 1Александров А. А.
- Інститут молекулярної генетики АН СРСР
Москва, СРСР
Abstract
Проведено детальний аналіз зустрічальності потенційних сайтів утворення H-форми (Н-паліндромів) та інших локальних гомопурин-гомопіримідинових дзеркальних повторів у різних функціональних областях природних ДНК. Отримано розподіли зустрічальності таких поєднань нуклеотидів щодо точок ініціації і термінації трансляції.
Повний текст: (PDF, російською)
References
[1]
Lazurkin YuS. DNA: supercoiling and alternative structures. Biopolym Cell. 1986; 2(6):283-92.
[2]
Lyamichev VI, Mirkin SM, Frank-Kamenetskii MD. A PH-dePendent structural transition in the homoPurine-homoPyrimidine tract in suPerhelical DNA. Biopolym Cell. 1986; 2(3):115-24.
[3]
Lyamichev VI, Mirkin SM, Frank-Kamenetskii MD. Structures of homopurine-homopyrimidine tract in superhelical DNA. J Biomol Struct Dyn. 1986;3(4):667-9.
[4]
Mirkin SM, Lyamichev VI, Drushlyak KN, Dobrynin VN, Filippov SA, Frank-Kamenetskii MD. DNA H form requires a homopurine-homopyrimidine mirror repeat. Nature. 1987 Dec 3-9;330(6147):495-7.
[5]
Voloshin ON, Mirkin SM, Lyamichev VI, Belotserkovskii BP, Frank-Kamenetskii MD. Chemical probing of homopurine-homopyrimidine mirror repeats in supercoiled DNA. Nature. 1988;333(6172):475-6.
[6]
Sprizhitskii IuA, Nechipurenko IuD, Aleksandrov AA, Vol'kenshtein MV. Characteristics of nucleotide blocks in coding and non-coding DNA sequences from different organisms. Mol Biol (Mosk). 1988;22(2):338-56.
[7]
Suboch GM, SPrizhitsky YuA. Statistical significance of the occurrence of some comPlex nucleotide combinations: comParison of the DNA models. BioPolym. Cell. 1989; 5(4):30-7.
[8]
Efron B. Bootstrap Methods: Another Look at the Jackknife. Ann Stat. 1979;7(1):1–26.
[9]
Diakonis P, Efron B. Statistical methods with intensive use of comPuters. In the world of science. 1983; 7:60-73.
[10]
GetiBatik (1986). Genetic sequence data bank, R. 44.0. BBN laboratories, USA.
[11]
Beckmann JS, Brendel V, Trifonov EN. Intervening sequences exhibit distinct vocabulary. J Biomol Struct Dyn. 1986;4(3):391-400.
