Biopolym. Cell. 1989; 5(3):60-67.
Структура та функції біополімерів
Матрицезалежне зв’язування аміноацил-тРНК з А-ділянкою 70S рибосом Escherichia coli за відсутності транспептидації
1Дорохов Д. В., 1Одинцов В. Б., 1Кириллов С. В.
  1. Ленінградський інститут ядерної фізики ім. Б. П. Константинова АН СРСР
    Гатчина, Ленінградська обл., СРСР
  2. Інститут екології генетики АН Молдавської РСР
    Кишинів, СРСР

Abstract

Виміряно константи асоціації Phe-тPHKPhe з А-ділянкою 70S рибосом за умов блокування її зв’язування з P-ділянкою деацильованої тPHKPhe. По залежності величини константи асоціації від температури розраховано ентальпію (ΔH0 ~ 11 ккал /моль) і ентропію (ΔS0 ~ –5 кал ·моль–1·град–1) цієї взаємодії. Константа асоціації Phe-tPHKPhe, виміряна за температури 0 оC і блокування Р-ділянки нерозщеплюваним аналогом пептидил-тРНК, добре узгоджується з цією залежністю. Приблизно два іони магнію прямо або опосередковано беруть участь у матричнозалежній взаємодії Phe-тPHKPhe з А-ділянкою 70S рибосом.

References

[1] Kemkhadze KSh, Odintsov VB, Makhno VI, Semenkov IuP, Kirillov SV. Mechanism of codon-anticodon interaction in ribosomes. Interaction of aminoacyl-tRNA with 70S ribosomes in the absence of elongation factor EF-Tu and GTP. Mol Biol (Mosk). 1981;15(4):779-89.
[2] Kirillov SV, Kemkhadze KS, Makarov EM, Makhno VI, Odintsov VB, Semenkov YP. Mechanism of codon-anticodon interaction in ribosomes: codon-anticodon interaction of aminoacyl-tRNA at the ribosomal donor site. FEBS Lett. 1980;120(2):221-4.
[3] Kirillov SV, Makhno VI, Semenkov YP. Mechanism of codon-anticodon interaction in ribosomes. Direct functional evidence that isolated 30S subunits contain two codon-specific binding sites for transfer RNA. Nucleic Acids Res. 1980;8(1):183-96.
[4] Kemkhadze KS, Odintsov VB, Semenkov YP, Kirillov SV. Quantitative study of the interaction of aminoacyl-tRNA with the a site of Escherichia coli ribosomes: equilibrium and kinetic parameters of binding in the absence of EF-Tu factor and GTP. FEBS Lett. 1981;125(1):10-4.
[5] Peters M, Yarus M. Transfer RNA selection at the ribosomal A and P sites. J Mol Biol. 1979;134(3):471-91.
[6] Semenkov IuP, Makhno VI, Makarov EM, Kirillov SV. The effect of the antibiotic edeine on tRNA interaction with A, P and E sites of Escherichia coli 70S ribosomes. Mol Biol (Mosk). 1984;18(5):1348-51.
[7] Katunin VI, Semenkov YP, Makhno VI, Kirillov SV. Comparative study of the interaction of polyuridylic acid with 30S subunits and 70S ribosomes of Escherichia coli. Nucleic Acids Res. 1980;8(2):403-21.
[8] Semenkov YuP, Makarov EM, Kirillov SV. Quantitative study of interaction of deacylated tRNA with the P, A and E sites of Escherichia coli ribosomes. Biopolym. Cell. 1985; 1(4):183-93.
[9] Grajevskaja RA, Ivanov YV, Saminsky EM. 70-S ribosomes of Escherichia coli have an additional site for deacylated tRNA binding. Eur J Biochem. 1982;128(1):47-52.
[10] Kirillov SV, Makhno VI, Odinzov VB, Semenkov YP. The mechanism of codon-anticodon interaction in ribosomes. Heterogeneity of tRNA complexes with 70-S ribosomes of Escherichia coli. Eur J Biochem. 1978;89(1):305-13.
[11] Kirillov SV. Mechanism of codon-anticodon interaction in the ribosomes. Results of science and technology. Moscow, VINITI, 1983; 5-98. (Biol. chemistry; Vol. 18).
[12] Makarov EM, Katunin VI, Odintsov VB, Semenkov IuP, Kirillov SV. How do ribosome binding sites recognize the functional state of tRNA?. Mol Biol (Mosk). 1984;18(5):1342-7.