Biopolym. Cell. 2024; 40(3):209-209.
Хроніка та інформація
Передбачувані G-квадруплекси в геномі нетрадиційного ретровірусу пінистого вірусу великої рогатої худоби
- ННЦ «Інститут експериментальної та клінічної ветеринарної медицини» НАН України
Вул. Григорыя Сковороди, 83, Харків, Україна, 61023 - Харківський національний медичний університет
Просп. Науки, 4, Харків, Україна, 61022 - Інститут проблем кріобіології і кріомедицини НАН України
Вул. Переяславська, 23, Харків, Україна, 61016 - ТОВ «Інститут фізіологічних активних сполук»
Просп. Науки, 58, Харків, Україна, 61072
Abstract
Мета. Метою даного дослідження було визначення таких консервативних non-B-DNA-структур, як консервативні G-квадруплекси, які можуть утворюватися двома і трьома G-квартетами в мРНК, смислових і антисмислових ланцюгах провірусної ДНК вірусу пінистості великої рогатої худоби (BFV). Висновки. Консервативні G4 нерівномірно розподілені по всьому геному BFV. Відмінною особливістю геномної організації BFV є той факт, що антисмисловий ланцюг провірусної ДНК BFV характеризується значно більшою щільністю G-квадруплексів у порівнянні з одним із смислових ланцюгів. Програмне забезпечення QGRS Mapper виявляє значно більшу кількість потенційних G4 (34 G4 в антисмисловому ланцюгу провірусної ДНК BFV) порівняно з програмним забезпеченням G4Hunter (7 G4).
Keywords: пінистий вірус великої рогатої худоби, BFV, G–квадруплекс, і–мотив, неканонічна структура, некодуюча нитка
Повний текст: (PDF, англійською)
