Biopolym. Cell. 2023; 39(4):277-282.
Геноміка, транскриптоміка та протеоміка
Використання in situ proximity ligation методу для підтвердження КоАлювання S6 кінази 1 в умовах оксидативного стресу
1Бджола А. В., 1Філоненко В. В., 1, 2Гут І. Т., 1, 2Маланчук О. М.
  1. Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
    Вул. Академіка Заболотного, 150, Київ, Україна, 03143
  2. Університетський коледж Лондона
    вул. Гавер, Лондон, WC1E 6BT, Велика Британія

Abstract

Keywords: КоА, S6 кіназа 1, in situ proximity ligation метод, пост-трансляційна модифікація, оксидативний стрес, передача сигналу, конфокальна мікроскопія, ріст клітин, антитіла

References

[1] Leonardi R, Zhang YM, Rock CO, Jackowski S. Coenzyme A: back in action. Prog Lipid Res. 2005; 44(2-3):125-53.
[2] Malanchuk OM, Panasyuk GG, Serbin NM, Gout IT, Filonenko VV. Generation and characterization of monoclonal antibodies specific to Coenzyme A. Biopolym Cell. 2015; 31(3):187-92.
[3] Malanchuk OM, Bdzhola AV, Tykhonkova IO, Gout IT, Filonenko VV. Monoclonal antibodies to Coenzyme A. Biopolym Cell. 2022; 38(4):215-23.
[4] Tossounian MA, Baczynska M, Dalton W, Newell C, Ma Y, Das S, Semelak JA, Estrin DA, Filonenko V, Trujillo M, Peak-Chew SY, Skehel M, Fraternali F, Orengo C, Gout I. Profiling the Site of Protein CoAlation and Coenzyme A Stabilization Interactions. Antioxidants (Basel). 2022; 11(7):1362.
[5] Tsuchiya Y, Peak-Chew SY, Newell C, Miller-Aidoo S, Mangal S, Zhyvoloup A, Bakovic J, Malanchuk O, Pereira GC, Kotiadis V, Szabadkai G, Duchen MR, Campbell M, Cuenca SR, Vidal-Puig A, James AM, Murphy MP, Filonenko V, Skehel M, Gout I. Protein CoAlation: a redox-regulated protein modification by coenzyme A in mammalian cells. Biochem J. 2017; 474(14):2489-508.
[6] Gout I. Coenzyme A, protein CoAlation and redox regulation in mammalian cells. Biochem Soc Trans. 2018; 46(3):721-8.
[7] Tsuchiya Y, Zhyvoloup A, Baković J, Thomas N, Yu BYK, Das S, Orengo C, Newell C, Ward J, Saladino G, Comitani F, Gervasio FL, Malanchuk OM, Khoruzhenko AI, Filonenko V, Peak-Chew SY, Skehel M, Gout I. Protein CoAlation and antioxidant function of coenzyme A in prokaryotic cells. Biochem J. 2018; 475(11):1909-37.
[8] Tsuchiya Y, Byrne DP, Burgess SG, Bormann J, Baković J, Huang Y, Zhyvoloup A, Yu BYK, Peak-Chew S, Tran T, Bellany F, Tabor AB, Chan AE, Guruprasad L, Garifulin O, Filonenko V, Vonderach M, Ferries S, Eyers CE, Carroll J, Skehel M, Bayliss R, Eyers PA, Gout I. Covalent Aurora A regulation by the metabolic integrator coenzyme A. Redox Biol. 2020; 28:101318.
[9] Magnuson B, Ekim B, Fingar DC. Regulation and function of ribosomal protein S6 kinase (S6K) within mTOR signalling networks. Biochem J. 2012; 441(1):1-21.
[10] Hegazy M, Cohen-Barak E, Koetsier JL, Najor NA, Arvanitis C, Sprecher E, Green KJ, Godsel LM. Proximity Ligation Assay for Detecting Protein-Protein Interactions and Protein Modifications in Cells and Tissues in Situ. Curr Protoc Cell Biol. 2020; 89(1):e115.