Biopolym. Cell. 2021; 37(2):105-116.
Молекулярна Біомедицина
Соматичні геномні реорганізації ділянки лейкоцитарних антигенів людини в солідних пухлинах яєчників
1Грищенко Н. В., 1Гордіюк В. В., 1Кравченко С. А., 2Арбузова С. Б., 1Кашуба В. І.
  1. Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
    Вул. Академіка Заболотного, 150, Київ, Україна, 03143
  2. Комунальне некомерційне підприємство «Східно-український спеціалізований центр медичної генетики та пренатальної діагностики»
    35 Нахімова пр-т, Маріуполь, Україна, 87517
  3. Каролінський інститут
    Стокгольм SE-171 77, Швеція
Успіх імунотерапії раку яєчників визначається ефективністю імунної відповіді пацієнта, а також якісною і кількісною представленістю антигенів основного комплексу гістосумісності в пухлинних клітинах і мікрооточенні. Рівень експресії генів HLA (лейкоцитарних антигенів людини) в пухлинній тканині не завжди коректно відображає експресію цих генів в різних популяціях пухлинних клітин. Метою нашого дослідження є аналіз частоти і спектру соматичних делеций і дуплікацій в локусі HLA з використанням LOH-аналізу (втрата гетерозиготності) STR-маркерів (короткі тандемні повтори) в пухлинах яєчників пацієнтів. Ми показали, що складні соматичні геномні реорганізації, в яких залучені кілька локусів HLA, досить часто зустрічаються в пухлинах яєчників. Виявлені генетичні зміни розрізняються як по типу (делеції і мутації в аллелях STR), так і за кількістю субпопуляцій клітин з мутаціями. Отримані результати дозволяють запропонувати LOH-аналіз як ефективний метод для виявлення анеуплоїдії та інших типів соматичних геномних реорганізацій у ділянці HLA навіть в мінорних популяціях клітин. Цей аналіз надає додаткову прогностичну інформацію для визначення ефективності різних типів імунотерапії раку яєчників на індивідуальному рівні.
Keywords: рак яєчників, імунна відповідь, STR-маркер, HLA, генетичні зміни