Biopolym. Cell. 2018; 34(1):24-31.
Молекулярна та клітинна біотехнології
Характеристика вакцинних та польових штамів вірусу ІБХ в Україні з метою правильного підбору вакцин для профілактики захворювання
1Пастиря А. С., 1Будзанівська І. Г., 1Поліщук В. П.
  1. Навчально-науковий центр «Інститут біології та медицини»
    Київського національного університету імені Тараса Шевченка
    вул. Володимирська, 64/13, Київ, Україна, 01601

Abstract

Вірус інфекційної бурсальної хвороби (ІБХ) викликає висококонтагіозне захворювання курчат та поширений у всьому світі. Головним антигеном є білок VP2. Ген VP2 містить гіперваріабельний регіон, мутації в якому призводять до появи нових антигенних варіантів вірусу ІБХ. Для попередження інфікування використовують вакцинацію, ефективність якої залежить від генетичної спорідненості вакцинних та польових штамів вірусу. Мета. проаналізувати нуклеотидну послідовність різних вакцинних та польових штамів вірусу ІБХ, поширених в господарствах України. Методи. У дослідженні було використано 11 вакцинних та 16 польових штамів вірусу ІБХ. РНК виділяли методом магнітної сорбції, здійснювали реакцію зворотної транскрипції та постановку ПЛР із специфічними праймерами до гену VP2. Амплікони секвенували, нуклеотидну та амінокислотну послідовність аналізували за допомогою програми MEGA 6. Результати. 11 вакцинних штамів формували 5 кластерів. Кластер І містив штами GM97, 228E та MB/20. Кластер ІІ бус сформований м’якими штамами LC-75 та D78. Середні штами Winterfield-2512 та Lukert формували кластер ІІІ. «Гарячі» штами MB та MB/3 містились у кластері IV. Кластер V містив штами MB/5 та V877. Після включення 16 польових ізолятів, виявлених в Україні, структура дерева не змінилась. Вісім з них групувалися разом з «гарячими», 5 – з середніми та 3 – з м’якими вакцинними штамами. Порівняння амінокислотних послідовностей підтвердило антигенну спорідненість штамів, що знаходились в одному кластері. Висновки. Отримані результати можуть бути використані для підбору вакцин для профілактики ІБХ в кожному окремому господарстві України.
Keywords: вірус ІБХ, польові штами, вакцинні штами, високовірулентні штами, філогенетичний аналіз

References

[1] Berg TP. Acute infectious bursal disease in poultry: a review. Avian Pathol. 2000;29(3):175-94.
[2] Alkie TN, Rautenschlein S. Infectious bursal disease virus in poultry: current status and future prospects. Veterinary Medicine: Research and Reports. 2016; 2016(7):9–18.
[3] Jackwood DJ, Sreedevi B, LeFever LJ, Sommer-Wagner SE. Studies on naturally occurring infectious bursal disease viruses suggest that a single amino acid substitution at position 253 in VP2 increases pathogenicity. Virology. 2008;377(1):110-6.
[4] Camilotti E, Moraes LB, Furian TQ, Borges KA, Moraes HLS, Salle CTP. Infectious Bursal Disease: Pathogenicity and Immunogenicity of Vaccines. Rev Bras Cienc Avic. 2016; 18(2):303–8.
[5] Jackwood DJ. Advances in vaccine research against economically important viral diseases of food animals: Infectious bursal disease virus. Vet Microbiol. 2017;206:121-125.
[6] Boudaoud A, Mamache B, Tombari W, Ghram A. Virus mutations and their impact on vaccination against infectious bursal disease (Gumboro disease). Rev Sci Tech. 2016;35(3):875-897.
[7] Pastyria A, Sobko I, Polischuk V. Genetic characterization of infectious bursal disease virus isolates in Ukraine. Bulletin of Taras Shevchenko National University of Kyiv. Series: Biology. 2016; 72(2):24–27.
[8] Kataria RS, Tiwari AK, Bandyopadhyay SK, Kataria JM, Butchaiah G. Detection of infectious bursal disease virus of poultry in clinical samples by RT-PCR. Biochem Mol Biol Int. 1998;45(2):315-22.
[9] Tamura K, Stecher G, Peterson D, Filipski A, Kumar S. MEGA6: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 6.0. Mol Biol Evol. 2013;30(12):2725-9.
[10] Saitou N, Nei M. The neighbor-joining method: a new method for reconstructing phylogenetic trees. Mol Biol Evol. 1987;4(4):406-25.
[11] Felsenstein J. Confidence limits on phylogenies: an approach using the bootstrap. Evolution. 1985;39(4):783-791.
[12] Mawgod SA, Arafa AS, Hussein HA. Molecular genotyping of the infectious bursal disease virus (IBDV) isolated from Broiler Flocks in Egypt. Int J Vet Sci Med. 2014; 2(1):46–52
[13] Bayliss CD, Spies U, Shaw K, Peters RW, Papageorgiou A, Müller H, Boursnell ME. A comparison of the sequences of segment A of four infectious bursal disease virus strains and identification of a variable region in VP2. J Gen Virol. 1990;71 ( Pt 6):1303-12.
[14] Mohamed MA, Elzanaty KES, Bakhit BM, Safwat MM. Genetic Characterization of Infectious Bursal Disease Viruses Associated with Gumboro Outbreaks in Commercial Broilers from Asyut Province, Egypt. ISRN Vet Sci. 2014; 2014(1):916412.
[15] Jackwood DJ, Sommer-Wagner SE. Amino acids contributing to antigenic drift in the infectious bursal disease Birnavirus (IBDV). Virology. 2011;409(1):33-7. d