Biopolym. Cell. 2016; 32(3):179-183.
http://dx.doi.org/10.7124/bc.00091C
Структура та функції біополімерів
Внутрішньоядерна локалізація транскрипційних фабрик і алелей гену важкого ланцюгу імуноглобуліну в процесі дозрівання В-клітин людини
1, 2, 3Пичугін А. В., 1, 2, 4Ярова О. В., 1, 2, 4Скляр І. В., 5Лякомб Г., 2, 4, 5Разин С. В., 5Фест Т., 1, 2Липинскій М., 1, 2Васецький Є. С.
  1. Інститут Густава Русі
    вул. Едуарда Вальян, 114, Вільжюіф, Франція, 94805
  2. LIA 1066 Об'єднана французько-російська лабораторія з дослідження раку
    Вільжюіф, Франція-Москва, Російська Федерація
  3. Санкт-Петербурзький політехнічний університет Петра Великого
    вул Політехнічна 29, Санкт-Петербург, Росія, 195251
  4. Інститут біології гена РАН
    вул. Вавілова 34/5, Москва, Російська Федерація, 119334
  5. INSERM U 917, Університет Рене
    вул. професор Леона Бернарда, 2, F - 35043 Рене, Франція
  6. Біологічний факультет, Московський державний університет імені М. В. Ломоносова
    Ленінські гори, Російська Федерація, 119991

Abstract

Лише один аллель гену важкого ланцюгу імуноглобуліну (IGH) експресується в В -клітинах людини. Мета. Вивчити роль ядерної організації у регуляції експресії IGH при диференціюванні В-клітин. Методи. Імунофлуоресцентна гібридизація in situ (3D immuno-FISH). Результати. Активна форма РНК-полімерази II (Pol II) і ген IGH були виявлені на периферії ядерець на деяких стадіях диференціювання В-клітин. Висновки. Ми спостерігали значні зміни в характері розподілу РНК-полімерази II в ядрі під час диференціювання В-клітин. При цьому, не спостерігалося мажорної локалізації продуктивного алелі IGH з транскрипційними фабриками ні у безпосередній близькості від ядерець, ні в нуклеоплазмі.
Keywords: гени важких ланцюгів імуноглобуліну, транскрипція, ядро, дозрівання B-клітин
Повний текст: (PDF, англійською)

References

[1] Razin SV, Vassetzky YS. 3D genomics imposes evolution of the domain model of eukaryotic genome organization. Chromosoma. 2016 Jun 10.
[2] Razin SV, Gavrilov AA, Pichugin A, Lipinski M, Iarovaia OV, Vassetzky YS. Transcription factories in the context of the nuclear and genome organization. Nucleic Acids Res. 2011;39(21):9085-92.
[3] Hosokawa Y, Arnold A. Mechanism of cyclin D1 (CCND1, PRAD1) overexpression in human cancer cells: analysis of allele-specific expression. Genes Chromosomes Cancer. 1998;22(1):66-71.
[4] Rajewsky K. Clonal selection and learning in the antibody system. Nature. 1996;381(6585):751-8.
[5] Hewitt SL, Yin B, Ji Y, Chaumeil J, Marszalek K, Tenthorey J, Salvagiotto G, Steinel N, Ramsey LB, Ghysdael J, Farrar MA, Sleckman BP, Schatz DG, Busslinger M, Bassing CH, Skok JA. RAG-1 and ATM coordinate monoallelic recombination and nuclear positioning of immunoglobulin loci. Nat Immunol. 2009;10(6):655-64.
[6] Kosak ST, Skok JA, Medina KL, Riblet R, Le Beau MM, Fisher AG, Singh H. Subnuclear compartmentalization of immunoglobulin loci during lymphocyte development. Science. 2002;296(5565):158-62.
[7] Skok JA, Brown KE, Azuara V, Caparros ML, Baxter J, Takacs K, Dillon N, Gray D, Perry RP, Merkenschlager M, Fisher AG. Nonequivalent nuclear location of immunoglobulin alleles in B lymphocytes. Nat Immunol. 2001;2(9):848-54.
[8] Sklyar I, Iarovaia OV, Gavrilov AA, Pichugin A, Germini D, Tsfasman T, Caron G, Fest T, Lipinski M, Razin SV, Vassetzky YS. Distinct Patterns of Colocalization of the CCND1 and CMYC Genes With Their Potential Translocation Partner IGH at Successive Stages of B-Cell Differentiation. J Cell Biochem. 2016;117(7):1506-10.
[9] Allinne J, Pichugin A, Iarovaia O, Klibi M, Barat A, Zlotek-Zlotkiewicz E, Markozashvili D, Petrova N, Camara-Clayette V, Ioudinkova E, Wiels J, Razin SV, Ribrag V, Lipinski M, Vassetzky YS. Perinucleolar relocalization and nucleolin as crucial events in the transcriptional activation of key genes in mantle cell lymphoma. Blood. 2014;123(13):2044-53.
[10] Ulianov SV, Gavrilov AA, Razin SV. Nuclear compartments, genome folding, and enhancer-promoter communication. Int Rev Cell Mol Biol. 2015;315:183-244.
[11] Le Gallou S, Caron G, Delaloy C, Rossille D, Tarte K, Fest T. IL-2 requirement for human plasma cell generation: coupling differentiation and proliferation by enhancing MAPK-ERK signaling. J Immunol. 2012;189(1):161-73.
[12] Politz JC, Scalzo D, Groudine M. The redundancy of the mammalian heterochromatic compartment. Curr Opin Genet Dev. 2016;37:1-8.
[13] Schlissel MS. Regulating antigen-receptor gene assembly. Nat Rev Immunol. 2003;3(11):890-9.
[14] Daly J, Licence S, Nanou A, Morgan G, Mårtensson IL. Transcription of productive and nonproductive VDJ-recombined alleles after IgH allelic exclusion. EMBO J. 2007;26(19):4273-82.
[15] Vettermann C, Schlissel MS. Allelic exclusion of immunoglobulin genes: models and mechanisms. Immunol Rev. 2010;237(1):22-42.
[16] Snider L, Asawachaicharn A, Tyler AE, Geng LN, Petek LM, Maves L, Miller DG, Lemmers RJ, Winokur ST, Tawil R, van der Maarel SM, Filippova GN, Tapscott SJ. RNA transcripts, miRNA-sized fragments and proteins produced from D4Z4 units: new candidates for the patophysiology of facioscapulohumeral dystrophy. Hum Mol Genet. 2009;18(13):2414-30.
[17] Woo CJ, Martin A, Scharff MD. Induction of somatic hypermutation is associated with modifications in immunoglobulin variable region chromatin. Immunity. 2003;19(4):479-89.
[18] Hanakahi LA, Maizels N. Transcriptional activation by LR1 at the Emu enhancer and switch region sites. Nucleic Acids Res. 2000;28(14):2651-7.