Biopolym. Cell. 2015; 31(6):458-464.
Біомедицина
Зміна рівня експресії металотіонеїнів при світло-клітинній карциномі нирок
1Римар В. І., 1Лотоцька Л. В., 1Кондратов О. Г., 2Стаховский Е. О., 2Кононенко О. А., 1Кашуба В. І.
  1. Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
    Вул. Академіка Заболотного, 150, Київ, Україна, 03680
  2. Національний інститут раку
    вул. Ломоносова, 33/43, Київ, Україна, 03022

Abstract

Мета. Пошук потенційних генів-супресорів серед металотіонеїнів при розвитку світло-клітинної карциноми нирок. Методи. Біоінформатичний аналіз баз даних мікрочіпів, кількісна ПЛР. Результати. Використовуючи біоінформатичні методи порівняння різних баз даних мікрочипів із застосуванням кросплатформенної нормалізації по декількох референтних генах, нами було знайдено три гени з родини металотіонеїнів, що показують знижену експресію у різних типах пухлин нирок. Зниження експресії генів МТ1G, MT1F та MT1H в зразках світлоклітинної карциноми нирок було продемонстровано методом кількісної ПЛР. Висновки. Гени МТ1G, MT1F та MT1H є потенційними супресорами росту пухлин нирок.
Keywords: металотіонеїни, пухлини нирок, потенційний ген-супресор росту пухлин, мікрочіпи

References

[1] Tai SK, Tan OJ, Chow VT, Jin R, Jones JL, Tan PH, Jayasurya A, Bay BH. Differential expression of metallothionein 1 and 2 isoforms in breast cancer lines with different invasive potential: identification of a novel nonsilent metallothionein-1H mutant variant. Am J Pathol. 2003;163(5):2009-19.
[2] Vandeghinste N, Proost P, De Ley M. Metallothionein isoform gene expression in zinc-treated human peripheral blood lymphocytes. Cell Mol Biol (Noisy-le-grand). 2000;46(2):419-33.
[3] Ferrario C, Lavagni P, Gariboldi M, Miranda C, Losa M, Cleris L, Formelli F, Pilotti S, Pierotti MA, Greco A. Metallothionein 1G acts as an oncosupressor in papillary thyroid carcinoma. Lab Invest. 2008;88(5):474-81.
[4] Han YC, Zheng ZL, Zuo ZH, Yu YP, Chen R, Tseng GC, Nelson JB, Luo JH. Metallothionein 1 h tumour suppressor activity in prostate cancer is mediated by euchromatin methyltransferase 1. J Pathol. 2013;230(2):184-93.
[5] Sakamoto LH, DE Camargo B, Cajaiba M, Soares FA, Vettore AL. MT1G hypermethylation: a potential prognostic marker for hepatoblastoma. Pediatr Res. 2010;67(4):387-93.
[6] Roth MJ, Abnet CC, Hu N, Wang QH, Wei WQ, Green L, D'Alelio M, Qiao YL, Dawsey SM, Taylor PR, Woodson K. p16, MGMT, RARbeta2, CLDN3, CRBP and MT1G gene methylation in esophageal squamous cell carcinoma and its precursor lesions. Oncol Rep. 2006;15(6):1591-7.
[7] Morris MR, Hesson LB, Wagner KJ, Morgan NV, Astuti D, Lees RD, Cooper WN, Lee J, Gentle D, Macdonald F, Kishida T, Grundy R, Yao M, Latif F, Maher ER. Multigene methylation analysis of Wilms' tumour and adult renal cell carcinoma. Oncogene. 2003;22(43):6794-801.
[8] Yan DW, Fan JW, Yu ZH, Li MX, Wen YG, Li DW, Zhou CZ, Wang XL, Wang Q, Tang HM, Peng ZH. Downregulation of metallothionein 1F, a putative oncosuppressor, by loss of heterozygosity in colon cancer tissue. Biochim Biophys Acta. 2012;1822(6):918-26.
[9] Nagai H, Ponglikitmongkol M, Fujimoto J, Yamamoto H, Kim YS, Konishi N, Matsubara K. Genomic aberrations in early stage human hepatocellular carcinomas. Cancer. 1998;82(3):454-61.
[10] Nguyen A, Jing Z, Mahoney PS, Davis R, Sikka SC, Agrawal KC, Abdel-Mageed AB. In vivo gene expression profile analysis of metallothionein in renal cell carcinoma. Cancer Lett. 2000;160(2):133-40.
[11] Vandesompele J, De Preter K, Pattyn F, Poppe B, Van Roy N, De Paepe A, Speleman F. Accurate normalization of real-time quantitative RT-PCR data by geometric averaging of multiple internal control genes. Genome Biol. 2002;3(7):RESEARCH0034.
[12] Spiess AN, Feig C, Ritz C. Highly accurate sigmoidal fitting of real-time PCR data by introducing a parameter for asymmetry. BMC Bioinformatics. 2008;9:221.
[13] Kanda M, Nomoto S, Okamura Y, Nishikawa Y, Sugimoto H, Kanazumi N, Takeda S, Nakao A. Detection of metallothionein 1G as a methylated tumor suppressor gene in human hepatocellular carcinoma using a novel method of double combination array analysis. Int J Oncol. 2009;35(3):477-83.
[14] Morris MR, Gentle D, Abdulrahman M, Clarke N, Brown M, Kishida T, Yao M, Teh BT, Latif F, Maher ER. Functional epigenomics approach to identify methylated candidate tumour suppressor genes in renal cell carcinoma. Br J Cancer. 2008;98(2):496-501.
[15] Arriaga JM, Levy EM, Bravo AI, Bayo SM, Amat M, Aris M, Hannois A, Bruno L, Roberti MP, Loria FS, Pairola A, Huertas E, Mordoh J, Bianchini M. Metallothionein expression in colorectal cancer: relevance of different isoforms for tumor progression and patient survival. Hum Pathol. 2012;43(2):197-208.
[16] Henrique R, Jerónimo C, Hoque MO, Nomoto S, Carvalho AL, Costa VL, Oliveira J, Teixeira MR, Lopes C, Sidransky D. MT1G hypermethylation is associated with higher tumor stage in prostate cancer. Cancer Epidemiol Biomarkers Prev. 2005;14(5):1274-8.
[17] Lu DD, Chen YC, Zhang XR, Cao XR, Jiang HY, Yao L. The relationship between metallothionein-1F (MT1F) gene and hepatocellular carcinoma. Yale J Biol Med. 2003;76(2):55-62.