Biopolym. Cell. 1987; 3(5):234-240.
http://dx.doi.org/10.7124/bc.0001F5
Структура та функції біополімерів
Дослідження комплексоутворення бромистого етидію з ДНК у вологих плівках методом інфрачервоної спектроскопії
1Семенов М. О., 1Больбух Т. В.
  1. Інститут радіофізики та електроніки АН УРСР
    Харків, СРСР

Abstract

Показано можливість ІЧ-спектроскопічного дослідження комплексоутворення бромистого етидію з ДНК у вологих плівках. На основі аналізу змін частот і інтенсивностей смуг поглинання азотистих основ і сахарофосфатного ланцюга ДНК від кількості молекул води, сорбованих на нуклеїновій кислоті, встановлено, що спіралізація ДНК за відносної вологості більше 56 % супроводжується інтеркаляцією бромистого етидію в ГЦ-пари з боку малої борозенки. Це призводить до спотворення структури ДНК і дегідратації NH2-rpyпп азотистих основ. Знайдено також, що інтеркаляція зменшує число взаємодіючих карбонільних груп гуаніну.
Повний текст: (PDF, російською)

References

[1] Sanenov NAm, Sukhorukov BI, Maleev VIa. Are nitrogen bases of DNA hydrated at low humidity? Biofizika. 1981;26(6):979-84.
[2] Semenov MA. IR spectroscopic manifestation of DNA hydration. Mol. genetics and biophysics. Kiev, Kiev Univ. press, 1984; 25-33.
[3] Semenov MA. Experimental investigation of the energy contribution of hydration in stabilizing helical structure of DNA. Tez. of reports. posts and posters. I all-union biophys. Meet. Moscow, 1982; 1: 57.
[4] Semenov MA, Bol'bukh TV, Maleev VIa. Study of the hydratation of the double-helical poly A-poly U complex by IR-spectroscopy and piezogravimetry methods. Biofizika. 1985;30(4):571-7.
[5] Fuller W, Waring MJ. A molecular model for the interaction of ethidium bromide with deoxyribonucleic acids. Ber Bunsenges Phys Chem. 1967; 68(8):805-8.
[6] Dougherty G. A single-beam microspectrophotometer suitable for investigating the linear dichroism of DNA-drug fibers. Anal Biochem. 1981;115(1):52-7.
[7] Miller KJ, Brodzinsky R, Hall S. Interactions of molecules with nucleic acids. IV. Binding energies and conformations of acridine and phenanthridine compounds in the two principal and in several unconstrained dimer-duplex intercalation sites. Biopolymers. 1980;19(11):2091-122.
[8] Neidle S, Berman HM. X-ray crystallographic studies of nucleic acids and nucleic acid-drug complexes. Prog Biophys Mol Biol. 1983;41(2):43-66. Review.
[9] Tsai CC, Jain SC, Sobell HM. X-ray crystallographic visualization of drug-nucleic acid intercalative binding: structure of an ethidium-dinucleoside monophosphate crystalline complex, Ethidium: 5-iodouridylyl (3'-5') adenosine. Proc Natl Acad Sci U S A. 1975;72(2):628-32.
[10] Jain SC, Tsai CC, Sobell HM. Visualization of drug-nucleic acid interactions at atomic resolution. II. Structure of an ethidium/dinucleoside monophosphate crystalline complex, ethidium:5-iodocytidylyl (3'-5') guanosine. J Mol Biol. 1977;114(3):317-31.
[11] Sobell HM, Tsai CC, Jain SC, Gilbert SG. Visualization of drug-nucleic acid interactions at atomic resolution. III. Unifying structural concepts in understanding drug-DNA interactions and their broader implications in understanding protein-DNA interactions. J Mol Biol. 1977;114(3):333-65.
[12] Semenov MA, Bolbukh TV. Carbonyl vibration resonance interactions of helical polynucleotides polv(dA)-poly (dT) and polyG poly C. Stud. biophys. 1984; 102(3):215-20.
[13] Semenov MA, Bolbukh TV. Resonance oscillations in reacting carbonyl spiral and DNA polynucleotides. IV all-union conf. on spectroscopy of biopolymers: Thes. Kharkiv, 1981:162.
[14] Semenov MA, Bolbukh TV. IR spectroscopic study of complexation with ethidium bromide to DNA in wet films. Conformational changes in the biopolymer solution; Tez. of reports. All-union conf. Tbilisi, 1985; 151.
[15] Porumb H. The solution spectroscopy of drugs and the drug-nucleic acid interactions. Prog Biophys Mol Biol. 1978;34(3):175-95.
[16] Bolbukh TV, Semenov MA. Isotherms of polynucleotide hydration. Biofizika. 1985; 30(3):409-13.
[17] Lu KC, Prohofsky EW, Van Zandt LL. Vibrational modes of A-DNA, B-DNA, and A-RNA backbones: an application of a green-function refinement procedure. Biopolymers. 1977;16(11):2491-506.
[18] Bolbukh TV, Starikov EB, Semenov MA. The hydration of double-helical poly(2A) films studied by IR-spectroscopy and piezomicrobalance. Stud biophys. 1985; 108(3):199-207.