Biopolym. Cell. 1987; 3(4):187-192.
http://dx.doi.org/10.7124/bc.0001EE
Структура та функції біополімерів
Аналіз кінетичної схеми стадії елонгації білкового синтезу в рамках гіпотези стереоспецифічної стабілізації кодон-антикодонових комплексів на рибосомі. 2. Співвідношення швидкостей гідролізу GTP і елонгації поліпептидних ланцюгів
1Потапов А. П., 2Гольдштейн Б. Н., 2Сайфуллін С. Р., 1Єльська Г. В.
  1. Інститут молекулярної біології і генетики АН УСРС
    Київ, СРСР
  2. Інститут біологічної фізики АН СРСР
    Пущино, Московська обл., СРСР

Abstract

Наведено теоретичний аналіз стаціонарної кінетики процесу елонгації поліпептидних ланцюгів з позицій гіпотези про стереоспецифічну стабілізацію кодон-антикодонових комплексів на рибосоме в ході відбору аміноацил-тРНК і транслокації. Досліджено співвідношення швидкостей гідролізу GTP і елонгації поліпептидних ланцюгів. Отримано рівняння, що описують залежність величини цього співвідношення від концентрації аміноацил-тРНК, комплексу аміноацил-тРНК з білковим фактором елонгації EF-Tu і GTP, комплексу EF-Tu·GTP і комплексу EF-G·GTP.
Повний текст: (PDF, російською)

References

[1] Potapov AP. Stereospecific mechanism of the aminoacyl-tRNA selection by ribosome. Doklady Akad Nauk Ukr SSR. Ser B. 1982; (5):100-2.
[2] Potapov AP. Mechanism for peptidyl-tRNA and mRNA translocation in ribosome. Doklady Akad Nauk Ukr SSR. Ser B; 1982; (6):73-5.
[3] Potapov AP. A stereospecific mechanism for the aminoacyl-tRNA selection at the ribosome. FEBS Lett. 1982;146(1):5-8.
[4] Potapov AP. Mechanism of the stereospecific stabilization of codon-anticodon complexes in ribosomes during translation. Zh Obshch Biol. 1985;46(1):63-77.
[5] Potapov AP, Goldstein BN, Saifullin SR, Elskaya AV. Analysis of the kinetic scheme for the protein synthesis elongation stage within hypothesis on the stereospecific stabilization of the codon-anticodon complexes by ribosome. 1. The rate of polypeptide chain elongation. Biopolym. Cell. 1987; 3(1):22-26.
[6] Volkenstein MV, Goldstein BN. A new method for solving the problems of the stationary kinetics of enzymological reactions. Biochim Biophys Acta. 1966; 115(2):471-477.
[7] Nishizuka Y, Lipmann F. Comparison of guanosine triphosphate split and polypeptide synthesis with a purified E. coli system. Proc Natl Acad Sci U S A. 1966;55(1):212-9.
[8] Cabrer B, San-Millian MJ, Vazquez D, Modolell J. Stoichiometry of polypeptide chain elongation. J Biol Chem. 1976;251(6):1718-22.
[9] Gavrilova LP, Spirin AS. "Nonenzymatic" translation. Methods Enzymol. 1974;30:452-62.
[10] Hopfield JJ. Kinetic proofreading: a new mechanism for reducing errors in biosynthetic processes requiring high specificity. Proc Natl Acad Sci U S A. 1974;71(10):4135-9.
[11] Thompson RC, Stone PJ. Proofreading of the codon-anticodon interaction on ribosomes. Proc Natl Acad Sci U S A. 1977;74(1):198-202.
[12] Thompson RC, Dix DB, Gerson RB, Karim AM. A GTPase reaction accompanying the rejection of Leu-tRNA2 by UUU-programmed ribosomes. Proofreading of the codon-anticodon interaction by ribosomes. J Biol Chem. 1981;256(1):81-6.
[13] Yates JL. Role of ribosomal protein S12 in discrimination of aminoacyl-tRNA. J Biol Chem. 1979;254(22):11550-4.
[14] Ruusala T, Ehrenberg M, Kurland CG. Is there proofreading during polypeptide synthesis? EMBO J. 1982;1(6):741-5.
[15] Kakhniashvili DG, Smailov SK, Gogiia IN, Gavrilova LP. Stoichiometry of GTP breakdown during peptide synthesis on the ribosome. Stoichiometry of GTP hydrolysis during elongation of polyphenylalanine on polyuridylic acid. Biokhimiia. 1983;48(6):959-69.
[16] Kakhniashvili DG, Smailov SK, Gogiia IN, Gavrilova LP. Stoichiometry of GTP breakdown during peptide synthesis on the ribosome. Stoichiometry of GTP hydrolysis during elongation of polyphenylalanine on polyuridylic acid. Biokhimiia. 1983;48(6):959-69.
[17] Potapov AP. Rate limitations in the elongation working cycle and the action mechanisms of GTP-complexed elongation protein factors. Mol Biol (Mosk). 1982;16(1):28-33.