Biopolym. Cell. 2010; 26(6):508-511.
http://dx.doi.org/10.7124/bc.00017B
Біоорганічна хімія
Інгібування транскрипції in vitro 2-ариліденовими похідними тіазоло[3,2-α]бензімідазол-3(2Н)-ону
1Пальчиковська Л. Г., 1Алексєєва І. В., 1Негруцька В. В., 1Костюк Ю. К., 1Індиченко Т. М., 1Костенко О. М., 1Криворотенко Д. В., 1Швед А. Д., 1Дубей І. Я.
  1. Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
    Вул. Академіка Заболотного, 150, Київ, Україна, 03680

Abstract

Мета. Дослідити серію 2-заміщених тіазоло[3,2-α]бензімідазолонів як потенційних інгібіторів транскрипції. Методи. Речовини тестували в модельній системі транскрипції на основі РНК-полімерази Т7. Результати. Тестування виявило низку сполук, здатних інгібувати транскрипцію в мікромолярних концентраціях. Найактивнішим з-поміж них є дигідроксипохідне ВТ29 з IC50 = 1,6 μM. Висновки. Встановлено залежність активності вивчених речовин як інгібіторів транскрипції від їхнього структурно-функціонального стану. Ключовим фактором, що визначає їхню високу активність, є присутність гідрокси- чи діалкіламіногрупи в п- або м-положенні ариліденового фрагмента.
Keywords: тіазоло[3,2-α]бензімідазолони, інгібітори транскрипці, РНК-полімераза Т7
Повний текст: (PDF, англійською)

References

[1] Jung D., Choi Y., Uesugi M. Small organic molecules that modulate gene transcription Drug Discov. Today 2006 11, N 9–10:452-457.
[2] Ebalunode J. O., Weifan Z. Molecular shape technologies in drug discovery: methods and applications Curr. Top. Med. Chem 2010 10, N 6:669–679.
[3] Tunitskaya V. L., Kochetkov S. N. Structural-functional analysis of bacteriophage T7 RNA polymerase. Biochemistry (Moscow). 2002; 67(10):1124–1135.
[4] Kennedy W. P., Momand J. R., Yin Y. W. Mechanism for de novo RNA synthesis and initiating nucleotide specificity by T7 RNA polymerase J. Mol. Biol 2007 370, N 2:256– 268.
[5] Sousa R., Chung Y. J., Rose J. P., Wang B.-C. Crystal structure of bacteriophage T7 RNA polymerase at 3.3 C resolution Nature 1993 364, N 6438:593–599.
[6] McAllister W. T., Raskin C. A. The phage RNA polymerases are related to DNA polymerases and reverse transcriptases Mol. Microbiol 1993 10, N 1:1–6.
[7] White R. J., Phillips D. R. Sequence-dependent termination of bacteriophage T7 transcription in vitro by DNA-binding drugs Biochemistry 1989 28, N 10:4277–4283.
[8] Puvvada M. S., Forrow S. A., Hartley J. A., Stephenson P., Gibson I., Jenkins T. C., Thurston D. E. Inhibition of bacteriophage T7 RNA polymerase in vitro transcription by DNAbinding pyrrolo[2,1-c][1,4]benzodiazepines Biochemistry 1997 36, N 9:2478–2484.
[9] Piestrzeniewich M., Studzian K., Wilmanska D., Plucienniczak G., Gniazdowski M. Effect of DNA-interacting drugs on phage T7 RNA polymerase. Acta Biochim. Pol. 1998; 45(1):127–132.
[10] Chen X., Gao F., Zhou Z.-X., Yang W.-Y., Gao L.-T., Ji L.-N. Effect of ancillary ligands on the topoisomerases II and transcription inhibition activity of polypyridyl ruthenium(II) complexes J. Inorg. Biochem 2010 104, N 5:576– 582.
[11] Palchykovska L. G., Alexeeva I. V., Kostina V. G., Platonov M. O., Negrutska V. V., Deriabin O. M., Tarasov O. A., Shved A. D. New amides of phenazine-1-carboxylic acid: antimicrobial activity and structure-activity relationship. Ukr Biokhim Zh. 2008; 80(3):140–147.
[12] Stankiewicz-Drogon A., Palchykovska L. G., Kostina V. G., Alexeeva I. V., Shved A. D., Boguszewska-Chachulska A. M. New acridone-4-carboxylic acid derivatives as potential inhibitors of Hepatitis C virus infection Bioorg. Med. Chem 2008 16, N 19:8846–8852.
[13] Palchykovska L. G., Alexeeva I. V., Platonov M. O., Kostenko O. M., Usenko L. S., Negrutska V. V., Shved A. D. New 1, 2,4-triazine bearing compounds: molecular modeling, synthesis and biotesting. Biopolym. Cell. 2009; 25, N 6 P. 491–499.
[14] Mavrova A. T., Anichina K. K., Vuchev D. I., Tsenov J. A., Kondeva M. S., Micheva M. K. Synthesis and antitrichinellosis activity of some 2-substituted-[1,3]thiazolo[3,2-]benzimidazol-3(2H)-ones Bioorg. Med. Chem 2005 13, N 19:5550–5559.
[15] Al-Rashood K. A., Abdel-Aziz H. A. Thiazolo[3,2-]benzimidazoles: synthetic strategies, chemical transformations and biological activities Molecules 2010 15, N 6:3775– 3815.
[16] Pat. UK Application GB2376944 31.12.2002. Polycyclic heterocyclic compounds and their therapeutic use. N. M. Allanson, B. W. Leslie, S. Thomson.
[17] Pat. USA. Application 20070015768 01.18.2007. Ubiquitin ligase inhibitors and methods related thereto. I. Alroy, Sh. Tuvia, Y. Reiss, O. Levi-Hacham.
[18] Leyssen P., De Clercq E., Neyts J. Molecular strategies to inhibit the replication of RNA viruses Antivir. Res 2008 78, N 1:9–25.
[19] Chimirri A., Monforte P., Musumeci L., Rao A., Zappala M., Monforte A.-M. Synthesis and antitumour activity of 1H,3Hthiazolo[3,4-]benzimidazole derivatives Arch. Pharm 2001 334, N 6:203–208.