Biopolym. Cell. 2007; 23(5):416-424.
http://dx.doi.org/10.7124/bc.00077C
Геном та його регуляція
Геномна мінливість у калюсних культурах кукурудзи лінії Р346 і отриманих від неї сомаклональних ліній
1Майданюк Д. М., 1Андрєєв І. О., 1Спірідонова К. В., 1Кунах В. А.
  1. Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
    Вул. Академіка Заболотного, 150, Київ, Україна, 03680

Abstract

Методом RAPD-аналізу досліджено калюсні тканини індивідуальних рослин кукурудзи лінії Р346 і отриманих від неї через культуру тканин in vitro сомаклональних ліній з підвищеною регенераційною здатністю. Геномні зміни в культивованих тканинах спостерігали вже в двомісячних калюсах, але після чотирьох місяців культивування їхній рівень знижувався майже вдвічі. Відмічено появу однотипних змін ДНК в калюсах, отриманих від різних рослин окремих ліній, що свідчить про можливість існування в геномі кукурудзи «гарячих точок» мінливості. Показано, що сомаклональні лінії відрізняються за рівнем генетичної мінливості в культурі in vitro.
Keywords: кукурудза, культура тканин рослин, сомаклональні лінії, RAPD-аналіз, геномні перебудови
Повний текст: (PDF, українською) (PDF, англійською)

References

[1] Jain SM. Tissue culture-derived variation in crop improvement. Euphytica. 2004; 118(2): 153-66.
[2] Checheneva TN, Gur'eva IA. Comparative study somaclonal inbred maize lines for quantitative traits. Genetics in Ukraine at the turn of the millennium. K.: Logos, 2001. Vol 1:586-9.
[3] Checheneva TM. Spontaneous and induced variability of maize in vitro: Thesis.... Dr biol nauk: 03.00.15. Institute of Plant Physiology and Genetics, National Academy of Sciences of Ukraine. K., 2003. 302 p.
[4] Maidanyuk DM, Andreev IO, Spiridonova KV, Kunakh VA. Genetic polymorphism of the maize somaclonal lines derived from P346 line. Biopolym Cell. 2007; 23(4):324-31.
[5] Murashige T, Skoog F. A revised medium for rapid growth and bio assays with tobacco tissue cultures. Physiol Plant. 1962;15(3):473–97.
[6] Rogers SO, Bendich AJ. Extraction of DNA from milligram amounts of fresh, herbarium and mummified plant tissues. Plant Mol Biol. 1985;5(2):69-76.
[7] Maniatis T, Fritsch EF, Sambrook J. Molecular cloning: a laboratory manual. New York: Cold Spring Harbor Lab, 1982; 545 p.
[8] Yeh FC, Rongcai Y, Boyle T. POPGENE. Version 1.31. Edmonton: Univ. Alberta,1999.
[9] Nei M. Genetic Distance between Populations. Am Nat. 1972;106(949):283-92.
[10] Kumar S, Tamura K, Nei M. MEGA3: Integrated software for Molecular Evolutionary Genetics Analysis and sequence alignment. Brief Bioinform. 2004;5(2):150-63.
[11] Williams JG, Kubelik AR, Livak KJ, Rafalski JA, Tingey SV. DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers. Nucleic Acids Res. 1990;18(22):6531-5.
[12] Osipova ES, Koveza OV, Troitskiĭ AV, Dolgikh IuI, Shamina ZB, Gostimskiĭ SA. [Analysis of specific RAPD- and ISSR-fragments in somaclonal maize (Zea mays L.) and development of SCAR markers based on them]. Genetika. 2003;39(12):1664-72.
[13] Maidanyuk DN, Andreev IO, Spiridonova KV, Checheneva TN, Kunakh VA. Genome variaability of maize line Black Mexican Sweet Corn C456 in tissue culture in vitro: RAPD-amalysis results. Visn Ukr Tov Genet Sel. 2006; 4(1): 58-67.
[14] Godwin ID, Sangduen N, Kunanuvatchaidach R, Piperidis G, Adkins SW. RAPD polymorphisms among variant and phenotypically normal rice ( Oryza sativa var. indica ) somaclonal progenies. Plant Cell Rep. 1997; 16(5): 320-4.
[15] Linacero R, Freitas Alves E, V?zquez AM. Hot spots of DNA instability revealed through the study of somaclonal variation in rye. Theor Appl Genet. 2000;100(3-4):506–11.
[16] Mangolin CA, Ottoboni LM, Machado Mde F. RAPD markers to evaluate callus tissue of Cereus peruvianus Mill. (Cactaceae) maintained in different growth regulator combinations. Biochem Genet. 2002;40(9-10):351-8.
[17] Bogani P, Simoni A, Lio' P, Scialpi A, Buiatti M. Genome flux in tomato cell clones cultured in vitro in different physiological equilibria. II. A RAPD analysis of variability. Genome. 1996;39(5):846-53.
[18] Fourre J-L, Berger P, Niquet L, Andre P. Somatic embryogenesis and somaclonal variation in Norway spruce: morphogenetic, cytogenetic and molecular approaches. Theor Appl Genet.1997;94(2):159–69.
[19] Gallego FJ, Martinez I, Celestino C, Toribio M. Testing Somaclonal Variation Using RAPDs in Quercus suber L. Somatic Embryos. Int J Plant Sci. 1997;158(5):563-7.
[20] Xie QJ, Oard JH, Rush MC. Genetic Analysis of an Unstable, Purple-Red Hull Rice Mutation Derived from Tissue Culture. J Hered. 1995; 86(2): 154-6.
[21] Rani V, Parida A, Raina SN. Random amplified polymorphic DNA (RAPD) markers for genetic analysis in micropropagated plants of Populus deltoides Marsh. Plant Cell Rep. 1995;14(7):459-62.
[22] Polanco C, Ruiz ML. AFLP analysis of somaclonal variation in Arabidopsis thaliana regenerated plants. Plant Sci. 2002;162(5):817–24.