Biopolym. Cell. 2006; 22(2):121-125.
http://dx.doi.org/10.7124/bc.000725
Структура та функції біополімерів
Генотипові властивості збудника бурої бактеріальної плямистості люпину Pseudomonas lupini
1Данкевич Л. А., 1Гвоздяк Р. І.
  1. Інститут мікробіології і вірусології ім. Д. К. Заболотного НАН України
    вул. Академіка Заболотного, 154, Київ, Україна, 03680

Abstract

Визначено молярний відсоток GC-nap у геномній ДНК і нуклеотидну послідовність гена 16S рРНК штамів P. lupini Bettjukova, Koroljova. На основі цих і отриманих раніше фенотшювих ознак більшість досліджених штамів P. lupini віднесено до Pseudomonas syringae. Виняток склав штам P. lupini 8531, який через спорідненість GC-складу геномної ДНК і нукжотидної послідовність гена 16S рРНК віднесений нами до Pseudomonas savastanoi pv. glycinea .
Keywords: Pseudomonas lupini, Pseudomonas syringae, Pseudomonas savastanoi, GC-склад ДНК, нуклеотидна послідовність гена 16S рРНК
Повний текст: (PDF, українською) (PDF, англійською)

References

[1] Beltyukova KI, Koroleva IB. Bacterial diseases of legumes. Kiev: Naukova Dumka. 1974; 339 p.
[2] Koroleva IB. Biology of bacterial diseases of lupine in the Ukr SSR: Auth. Thesis. ... kand biol nauk. Kiev, 1963; 16 p.
[3] Microorganisms - pathogens of plants. Ed. VI Bilay. Kiev: Naukova Dumka. 1988; 547 p.
[4] Bergey's Manual of Determinative Bacteriology . Eds G Holt et al. Baltimore : Williams &? Wilkins, 1993. 787
[5] Young JM, Saddler GS, Takikawa Y, De Boer SH, Vautering L, Gordon L, Gvozdyak RI, Stead DE. Names of plant pathogenic bacteria. Rev Plant Pathol. 1996; 75: 721-63.
[6] Anzai Y, Kim H, Park JY, Wakabayashi H, Oyaizu H. Phylogenetic affiliation of the pseudomonads based on 16S rRNA sequence. Int J Syst Evol Microbiol. 2000;50 Pt 4:1563-89.
[7] Gardan L, Bollet C, Abu Ghorrah M, Grimont F, Grimont PAD. DNA Relatedness among the Pathovar Strains of Pseudomonas syringae subsp. savastanoi Janse (1982) and Proposal of Pseudomonas savastanoi sp. nov. Int J Syst Bacteriol. 1992;42(4):606–12.
[8] Louws F, Rademaker J, de Bruijn F. The three DS of PCR-based genomic analysis of phytobacteria: Diversity, Detection, and Disease Diagnosis. Annu Rev Phytopathol. 1999;37:81-125.
[9] Stead DE, Hennessy J, Elphinstone JG, Wilson JK. Modern Methods for Classification of Plant Pathogenic Bacteria Including Pseudomonas syringae. In: Pseudomonas Syringae Pathovars and Related Pathogens. 1997;427–34.
[10] Yamamoto S, Kasai H, Arnold DL, Jackson RW, Vivian A, Harayama S. Phylogeny of the genus Pseudomonas: intrageneric structure reconstructed from the nucleotide sequences of gyrB and rpoD genes. Microbiology. 2000;146 ( Pt 10):2385-94.
[11] Kotsofliak OI, Kiprianova EA, Levanova GF. [Taxonomic analysis of Pseudomonas strains with uncertain taxonomic status]. Mikrobiol Z. 2004;66(3):5-13.
[12] Kotsoflyak OI. Research bacteria of Pseudomonas polyphasic taxonomic analysis methods: Auth. Theis. ... kand biol nauk. Kyiv, 2004; 21 p.
[13] Dankevich LA. Specialization Pseudomonas lupini at Lupin, peas, beans and soybeans. Nauk Visn Cherniv Univ.: Zb. Nauk, Prats. 2004; 194:47-52.
[14] Dankevich LA. Characterization of cellular lipids Pseudomonas lupini on fatty acid composition. 9th Putin's School-Conference for Young Scientists "Biology-Science of XXI Century" (17-21 May, 2004): Abstr. Puschino, 2005:147.
[15] Dankevich LA, Gvozdyak RI. Pathogenic and biochemical properties of the causative agent of bacterial brown spot lupine Pseudomonas lupini. Agroekologichnyy Zhurnal. 2005; (1): 63-8.
[16] Dankevich LA, Yakovleva LM. Antigenic heterogeneity Pseudomonas lupini. Materials Internat. Conf.; Proc. Minsk, 2004:16.
[17] Levanova GF, Parfenova OV, Kashnikov SYu. Molecular biological methods for the identification and differentiation of bacteria. Methodical recommendations. Moscow, 1995; 19.
[18] Fedorov IA, Sukhanov YuS, Asadi Mobarkhan AH, Artem'ev MI. Polymerase chain reaction (PCR). Handbook for beginners. Principles and Guidelines for its setting in the detection of microorganisms. Moscow, 1996;31.
[19] Xu HX, Kawamura Y, Li N, Zhao L, Li TM, Li ZY, Shu S, Ezaki T. A rapid method for determining the G+C content of bacterial chromosomes by monitoring fluorescence intensity during DNA denaturation in a capillary tube. Int J Syst Evol Microbiol. 2000;50 Pt 4:1463-9.
[20] Edwards U, Rogall T, Bl?cker H, Emde M, B?ttger EC. Isolation and direct complete nucleotide determination of entire genes. Characterization of a gene coding for 16S ribosomal RNA. Nucleic Acids Res. 1989;17(19):7843-53.
[21] Marchuk D, Drumm M, Saulino A, Collins FS. Construction of T-vectors, a rapid and general system for direct cloning of unmodified PCR products. Nucleic Acids Res. 1991;19(5):1154.
[22] Romanovskaia VA, Rokitko PV, Shilin SO, Malashenko IuR. [Actual problems of bacteria phylogenetic classification]. Mikrobiol Z. 2003;65(5):46-65.