Biopolym. Cell. 2006; 22(1):38-48.
Біомедицина
Надекспресія генів на різних стадіях розвитку астроцитарних гліом
1Дмитренко В. В., 1Бойко О. І., 1Шостак К. О., 1Симиренко О. Є., 1Букрєєва Т. В., 2Розуменко В. Д., 2Малишева Т. А., 2Шамаєв М. І., 2Зозуля Ю. П., 1Кавсан В. М.
  1. Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
    Вул. Академіка Заболотного, 150, Київ, Україна, 03680
  2. Інститут нейрохірургії ім. академіка А. П. Ромоданова АМН України
    вул. Мануїльського, 32, Київ, Україна, 04050

Abstract

Публічну базу даних із серійного аналізу генної експресії (SAGE) використано для ідентифікації потенційних молекулярних маркерів астроцитарних гліом людини. При порівнянні дев'яти SAGE-бібліотек гліобластом, 11 SAGE-бібліотек анапластичних астроцитом, восьми SAGE-бібліотек дифузних астроцитом та п'яти SAGE-бібліотек нормального головного мозку виявлено 57 генів, рівень експресії яких був більш, ніж у 5 разів вищий (Р ≤ 0,05) в астроцитарних гліомах відносно нормального головного мозку. Серед змін експресії генів, які відбуваються на ранньому етапі формування астроцитом та виявляються і на наступних етапах їхнього розвитку, деякі модифікації є характерними лише для високозлоякісних стадій розвитку пухлин і відсутні в пухлинах низького ступеня злоякісності. Результати аналізу експресії виявлених генів можна використовувати для молекулярної класифікації гліальних пухлин, діагностики, прогностичної оцінки пухлин та визначення потенційних мішеней протипухлинної терапії
Keywords: SAGE, диференційна експресія, астроцитарні гліоми, молекулярні маркери

References

[1] Kleihues P, Louis DN, Scheithauer BW, Rorke LB, Reifenberger G, Burger PC, Cavenee WK. The WHO classification of tumors of the nervous system. J Neuropathol Exp Neurol. 2002;61(3):215-25; discussion 226-9.
[2] Watanabe T, Nakamura M, Kros JM, Burkhard C, Yonekawa Y, Kleihues P, Ohgaki H. Phenotype versus genotype correlation in oligodendrogliomas and low-grade diffuse astrocytomas. Acta Neuropathol. 2002;103(3):267-75.
[3] Okamoto Y, Di Patre PL, Burkhard C, Horstmann S, Jourde B, Fahey M, Sch?ler D, Probst-Hensch NM, Yasargil MG, Yonekawa Y, L?tolf UM, Kleihues P, Ohgaki H. Population-based study on incidence, survival rates, and genetic alterations of low-grade diffuse astrocytomas and oligodendrogliomas. Acta Neuropathol. 2004;108(1):49-56.
[4] Negm RS, Verma M, Srivastava S. The promise of biomarkers in cancer screening and detection. Trends Mol Med. 2002;8(6):288-93.
[5] Huang H, Okamoto Y, Yokoo H, Heppner FL, Vital A, Fevre-Montange M, Jouvet A, Yonekawa Y, Lazaridis EN, Kleihues P, Ohgaki H. Gene expression profiling and subgroup identification of oligodendrogliomas. Oncogene. 2004;23(35):6012-22.
[6] Shai R, Shi T, Kremen TJ, Horvath S, Liau LM, Cloughesy TF, Mischel PS, Nelson SF. Gene expression profiling identifies molecular subtypes of gliomas. Oncogene. 2003;22(31):4918-23.
[7] Shostak K, Labunskyy V, Dmitrenko V, Malisheva T, Shamayev M, Rozumenko V, Zozulya Y, Zehetner G, Kavsan V. HC gp-39 gene is upregulated in glioblastomas. Cancer Lett. 2003;198(2):203-10.
[8] Dmitrenko V, Shostak K, Boyko O, Khomenko O, Rozumenko V, Malisheva T, Shamayev M, Zozulya Y, Kavsan V. Reduction of the transcription level of the mitochondrial genome in human glioblastoma. Cancer Lett. 2005;218(1):99-107.
[9] Kavsan V, Shostak K, Dmitrenko V, Chausovskiy T, Zozulya Y, Demotes-Mainard J. Peculiarities of molecular events in human glial tumors revealed by serial analysis of gene expression (SAGE). Exp Oncol. 2004;26(3):196-204.
[10] Loging WT, Lal A, Siu IM, Loney TL, Wikstrand CJ, Marra MA, Prange C, Bigner DD, Strausberg RL, Riggins GJ. Identifying potential tumor markers and antigens by database mining and rapid expression screening. Genome Res. 2000;10(9):1393-402.
[11] Ljubimova JY, Lakhter AJ, Loksh A, Yong WH, Riedinger MS, Miner JH, Sorokin LM, Ljubimov AV, Black KL. Overexpression of alpha4 chain-containing laminins in human glial tumors identified by gene microarray analysis. Cancer Res. 2001;61(14):5601-10.
[12] Cheng Y, Ng HK, Ding M, Zhang SF, Pang JC, Lo KW. Molecular analysis of microdissected de novo glioblastomas and paired astrocytic tumors. J Neuropathol Exp Neurol. 1999;58(2):120-8.
[13] Zhang L, Zhou W, Velculescu VE, Kern SE, Hruban RH, Hamilton SR, Vogelstein B, Kinzler KW. Gene expression profiles in normal and cancer cells. Science. 1997;276(5316):1268-72.