Biopolym. Cell. 2005; 21(5):440-445.
http://dx.doi.org/10.7124/bc.000708
Молекулярна біофізика
Сендвічоподібна самоасоціація цитозину та її прояви в оптичних спектрах
1Петрушко І. А., 1Суховія М. І.
  1. Ужгородський національний університет
    вул. Волошина, 54, Ужгород, Україна, 88000

Abstract

З використанням багатоконфігураційної теорії самоузгодженого поля з оптимізацією геометрії в рамках гамільтоніана AM] проведено квантово-хімічне вивчення геометричних та оптичних характеристик сендвічоподібних комплексів цитозину. Аналіз довжин зв'язків, просторових кутів, частот коливальних та електронних спектрів у мономері, димері і тетрамері цитозину показує, що ці фізичні властивості молекул змінюються при комплексоутворенні. Зокрема, розрахунки демонструють високочастотний зсув валентних коливань ЯНг-групи, що узгоджується з експери­ментальними даними. Розподіл інтенсивностей смуг в електронних спектрах суттєво залежить від кількості молекул у комплексах цитозину. Обговорюється біофізична значущість отриманих результатів.
Keywords: комплекси цитозину, фізичні характеристики, теоретичне вивчення
Повний текст: (PDF, українською)

References

[1] Krasnokutski SA, Ivanov AY, Izvekov V, Sheina GG, Blagoi YP. FTIR matrix isolation study of uridine, thymidine, ribose, and glucose. J Mol Struct. 1999;482-483:249–52.
[2] Maleev V, Semenov M, Kruglova E, Bolbukh T, Gasan A, Bereznyak E, et al. Spectroscopic and calorimetric study of DNA interaction with a new series of actinocin derivatives. J Mol Struct. 2003;645(2-3):145–58.
[3] Hovorun DM. How structural changeability of nitrogen bases affects macroscopic properties of their crystals. Biopolym Cell. 1998;14(5):419-27.
[4] Kruglova EB, Dovbeshko GI, Krut'ko NA, Poshuk EP, Karpenko NA, Alesina MYu, Krasnitskaya AA. Investigation of structural damage in DNA molecules of gamma-irradiated rats. Vestn HNU 440. Biofiz Vestn. 1999; (4): 92-5.
[5] Morozov YuV, Bazhulin YaYa Electronic structure, spectroscopy and reactivity of molecules. Nucleobases, vitamins B6 and their analogs. Ed. Vol'kenshten. M .: Nauka, 1989. 288 p.
[6] Hobza P, Sponer J. Structure, energetics, and dynamics of the nucleic Acid base pairs: nonempirical ab initio calculations. Chem Rev. 1999;99(11):3247-76.
[7] Sivanesan D, Babu K, Gadre SR, Subramanian V, Ramasami T. Does a Stacked DNA Base Pair Hydrate Better than a Hydrogen-Bonded One?: An ab Initio Study. J Phys Chem A. 2000;104(46):10887–94.
[8] Nir E, Hunig I, Kleinermanns K, de Vries MS. The nucleobase cytosine and the cytosine dimer investigated by double resonance laser spectroscopy and ab initio calculations. Phys Chem Chem Phys. 2003;5(21):4780-5.
[9] Petrushko IA, Tsud NM, Sukhoviya MI. Infrared spectroscopy of the effect of ultraviolet on the films structure of the cytosine, guanine and their complex. Vestn HNU 637 Biofiz Vestn. 2004; Iss 1-2 (14):23-26.
[10] Vinogradov IP, Zemskikh VV, Dodonova N Ye. The absorption spectra of nucleic acid bases (110-300 nm) and their luminescence excited in the vacuum ultraviolet region. Optika i spektroskopiya. 1974; 36(3):596-9.
[11] Sukhovija MI, Slavik VN, Shafranyosh II, Shimon LL. Interaction of nucleic acid bases molecules with low-energy electrons. Biopolym Cell. 1991; 7(6):77-82.
[12] Novikov VV. [Electromagnetic bioengineering]. Biofizika. 1998;43(4):588-93.
[13] Danilov VI. [Effect of hydration on the tautomerism of nucleic acid bases: computer simulation Monte Carlo]. Vestn HNU 466. Biofiz Vestn. 1999;(5):11-20.