Визначення розміру ядерного геному і каріотипічний аналіз видів Papaver для створення ВАС бібліотек

Кириленко, Т. К.; Мартиненко, О. І.; Алхімова, О. Г.

doi:10.7124/bc.0006E5

Biopolym. Cell. 2005; 21(2):145-150.

http://dx.doi.org/10.7124/bc.0006E5

Геном та його регуляція

Визначення розміру ядерного геному і каріотипічний аналіз видів Papaver для створення ВАС бібліотек

1Кириленко Т. К., 1Мартиненко О. І., 1Алхімова О. Г.

Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
Вул. Академіка Заболотного, 150, Київ, Україна, 03680

Abstract

Роботу присвячено вивченню шляхів біосинтезу алкалоїдів у видів Papaver та інтегруванню даних фізичного картування нових маркерних послідовностей ДНК з відмінностями в експресії генів ключових ферментів біосинтезу алкалоїдів. Таке дослідження потребує знання структури геному та його організації, а також передбачає наявність геномних ресурсів задля детального аналізу геному опійного маку. У даному повідомленні визначено розмір геному опійного маку та зроблено каріотипічний аналіз Papaver somniferum і його споріднених видів, P. bracteatum і P. rhoeas. Отримані характеристики є необхідними для створення ВАС бібліотеки, яка слугує базисом для цитогенетичного картування та пошуку змін каріотипу в лініях маку, що відрізняються за шляхами біосинтезу алкалоїдів. Вже одержано декілька клітинних ліній, які накопичують різні типи алкалоїдів.

Keywords: Papaver, алкалоїди, розмір геному, ВАС бібліотека, флуоресцентна гібридизація in situ

Повний текст: (PDF, англійською)

References

[1] Facchini PJ, De Luca V. Phloem-Specific Expression of Tyrosine/Dopa Decarboxylase Genes and the Biosynthesis of Isoquinoline Alkaloids in Opium Poppy. Plant Cell. 1995;7(11):1811-1821.

[2] Bird DA, Franceschi VR, Facchini PJ. A tale of three cell types: alkaloid biosynthesis is localized to sieve elements in opium poppy. Plant Cell. 2003;15(11):2626-35.

[3] Facchini PJ, De Luca V. Differential and tissue-specific expression of a gene family for tyrosine/dopa decarboxylase in opium poppy. J Biol Chem. 1994;269(43):26684-90.

[4] De Luca V, St Pierre B. The cell and developmental biology of alkaloid biosynthesis. Trends Plant Sci. 2000;5(4):168-73.

[5] Gindullis F, Dechyeva D, Schmidt T. Construction and characterization of a BAC library for the molecular dissection of a single wild beet centromere and sugar beet (Beta vulgaris) genome analysis. Genome. 2001;44(5):846-55.

[6] M?ller SG, Chua NH. Chemical regulated production of cDNAs from genomic DNA fragments in plants. Plant J. 2002;32(4):615-22.

[7] Ausubel FM, Brent R, Kingston RE, Moore DD, Seidman JG, Smith JA, Struhl K. Current protocols in molecular biology. New York: Greene. Wiley Int., 1987; 418 p.

[8] Dolezcaronel J, Greilhuber J, Lucretti S, Meister A, Lysak MA, Nardi L, et al. Plant Genome Size Estimation by Flow Cytometry: Inter-laboratory Comparison. Ann Bot. 1998;82(suppl 1):17–26.

[9] Gerlach WL, Bedbrook JR. Cloning and characterization of ribosomal RNA genes from wheat and barley. Nucleic Acids Res. 1979;7(7):1869-85.

[10] Alkhimova AG, Heslop-Harrison JS, Shchapova AI, Vershinin AV. Rye chromosome variability in wheat-rye addition and substitution lines. Chromosome Res. 1999;7(3):205-12.

[11] Dolezel J, Bartos J, Voglmayr H, Greilhuber J. Nuclear DNA content and genome size of trout and human. Cytometry A. 2003;51(2):127-8.

[12] Srivastava S, Lavania UC. Evolutionary DNA variation in Papaver. Genome . 1991;34(5):763–8.

[13] Heslop-Harrison JS, Schwarzacher T, Anamthawat-Jonsson K. In situ hybridization with automated chromosome denaturation. Technique. 1991; 3: 109-116.

[14] Kyrylenko TK, Martynenko OI, Alkhimova OG. Organspecific expression of tyrosine. dopa genes and the biosynthesis of isoquinoline alkaloids in Papaver sp. Ukr Biokhim Zh. 2002; 74(4b suppl 2): 35.