Biopolym. Cell. 2002; 18(4):319-323.
Геном та його регуляція
Роль гена екзополігалактуронази у процесах взаємодії Klebsiella oxytoca VN13 з коренями проростків пшениці
1Ковтунович Г. Л., 1Лар О. В., 1Козировська Н. О.
  1. Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
    Вул. Академіка Заболотного, 150, Київ, Україна, 03680

Abstract

Отриману інсерційним мутагенезом in vitro дефектну копію гена екзополігалактуронази K. oxytoca VNI3 з повною втратою активності використано для заміщення нашивного гена методом реципрокної рекомбінації. Кількісне співвідношення мутантних бактерій та бактерій дикого типу у змішаній популяції, асоційованій з рослиною, після чотирьох тижнів вегетації суттєво не змінилося. Обидва типи клітин проникали всередину коренів рослини однаково ефективно. Відсутність функціонально активного продукту pehX-гена не впливає на процес проникнення даних бактерій у внутрішні тканини коренів пшениці, що пов'язується з екзосубстратною специфічністю досліджуваного ферменту і не виключає участі інших пектиназ у даному процесі.

References

[1] Hallmann J, Quadt-Hallmann A, Mahaffee WF, Kloepper JW. Bacterial endophytes in agricultural crops. Can J Microbiol. 1997;43(10):895–914.
[2] Reinhold-Hurek B, Hurek T, Claeyssens M, van Montagu M. Cloning, expression in Escherichia coli, and characterization of cellulolytic enzymes of Azoarcus sp., a root-invading diazotroph. J Bacteriol. 1993;175(21):7056-65.
[3] Quadt-Hallmann A, Kloepper JW. Immunological detection and localization of the cotton endophyte Enterobacter asburiae JM22 in different plant species. Can J Microbiol. 1996;42(11):1144–54.
[4] Hazlewood GP, Gilbert HJ. Structure and function analysis of Pseudomonas plant cell wall hydrolases. Prog Nucleic Acid Res Mol Biol. 1998;61:211-41.
[5] Kovtunovych GL, Lar OV, Kordyum VA, Kleiner D, Kozyrovska NO. Enhancing the internal plant colonization rate with endophytic nitrogen-fixing bacteria. Biopolym Cell. 1999; 15(4):300-5.
[6] Kovtunovych G, Lar O, Kamalova S, Kordyum V, Kleiner D, Kozyrovska N. Correlation between pectate lyase activity and ability to penetrate into plant tissues by diazotrophic Klebsiella oxytoca VN 13. Plant and Soil. 1999; 260: 1-6.
[7] Kovtunovich GV, Lar OV, Kozyrovska NO. Cloning and structural analysis of the Klebsiella oxytoca VN13 peh gene. Biopolym Cell. 2000; 16(5):356-62.
[8] Penfold RJ, Pemberton JM. An improved suicide vector for construction of chromosomal insertion mutations in bacteria. Gene. 1992;118(1):145-6.
[9] Fellay R, Frey J, Krisch H. Interposon mutagenesis of soil and water bacteria: a family of DNA fragments designed for in vitro insertional mutagenesis of gram-negative bacteria. Gene. 1987;52(2-3):147-54.
[10] Sambrook J, Fritsch EF, Maniatis T. Molecular cloning: A laboratory manual. New York: Cold Spring Harbor Lab. press, 1989.
[11] Nishimura A, Morita M, Nishimura Y, Sugino Y. A rapid and highly efficient method for preparation of competent Escherichia coli cells. Nucleic Acids Res. 1990;18(20):6169.
[12] He SY, Collmer A. Molecular cloning, nucleotide sequence, and marker exchange mutagenesis of the exo-poly-alpha-D-galacturonosidase-encoding pehX gene of Erwinia chrysanthemi EC16. J Bacteriol. 1990;172(9):4988-95.
[13] Brooks AD, He SY, Gold S, Keen NT, Collmer A, Hutcheson SW. Molecular cloning of the structural gene for exopolygalacturonate lyase from Erwinia chrysanthemi EC16 and characterization of the enzyme product. J Bacteriol. 1990;172(12):6950-8.