Biopolym. Cell. 2001; 17(3):253-255.
http://dx.doi.org/10.7124/bc.0005B5
Короткі повідомлення
Формамід і гліцерин у секвенуванні GC-багатої ДНК
1, 2Кваша С. М., 2, 3, 4Забаровський Є. Р., 1, 2, 3Кашуба В. І., 1Риндич А. В.
  1. Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
    Вул. Академіка Заболотного, 150, Київ, Україна, 03680
  2. Центр геноміки і біоінформатики, Каролінський інститут
    Стокгольм , Швеція, 171 77
  3. Відділ мікробіології, пухлини і клітинної біології,
    Каролінський інститут
    Нобелівська дорога 5, Солна, Швеція, 171 65
  4. Інститут молекулярної біології ім. В. А. Енгельгардта РАН
    вул. Вавилова, 32, Москва, Російська Федерація, 119991

Abstract

Відомо, що формамід та гліцерин підвищують ефективність секвенування. В даній роботі порівняно вплив різних концентрацій формаміду та гліцерину на секвенування GC-багатих матриць і показано, що найефективнішим є додавання до реакційної суміші 5 % формаміду або 7,5–10 % гліцерину.
Повний текст: (PDF, російською)

References

[1] Kozak M. An analysis of vertebrate mRNA sequences: intimations of translational control. J Cell Biol. 1991;115(4):887-903.
[2] Hengen PN. Cycle sequencing through GC-rich regions. Trends Biochem Sci. 1996;21(1):33-4.
[3] Agarwal RK, Perl A. PCR amplification of highly GC-rich DNA template after denaturation by NaOH. Nucleic Acids Res. 1993;21(22):5283-4.
[4] Sun Y, Hegamyer G, Colburn NH. PCR-direct sequencing of a GC-rich region by inclusion of 10% DMSO: application to mouse c-jun. Biotechniques. 1993;15(3):372-4.
[5] Zhang W, Reading C, Deisseroth AB. Improved PCR sequencing with formamide. Trends Genet. 1992;8(10):332.
[6] Zhang W, Hu GY, Deisseroth A. Improvement of PCR sequencing by formamide. Nucleic Acids Res. 1991;19(23):6649.