Biopolym. Cell. 2001; 17(3):242-248.
Біоорганічна хімія
Взаємодія ціанінових барвників з нуклеїновими
кислотами. 22. Спектрально-люмінесцентні
властивості монометинових пірилієвих і
піридинових ціанінів та їхніх комплексів з ДНК
- Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
Вул. Академіка Заболотного, 150, Київ, Україна, 03680 - Київський національний університет імені Тараса Шевченка
вул. Володимирська 64, Київ, Україна, 01033
Abstract
Отримано низку пар структурно подібних монометинових ціанінових барвників з протилежним напрямком електричного диполя та досліджено їхні спектрально-люмінесцентні властивості у вільному стані та в присутності дволанцюгової ДНК Зміна значень стоксових зсувів барвників при їхній взаємодії з ДНК свідчить про те, що барвники в комплексах оточені дипольним
середовищем, що підтверджує «напівінтеркаляційну» модель взаємодії. Розглядаючи зміну стоксового зсуву барвників при взаємодії з ДНК як прояв зміни їхньої електронної асиметрії, висловлено припущення щодо положення кожного барвника в ДНК та зроблено висновок стосовно того, що орієнтацію молекули барвника в комплексі визначає в основному її геометрія, а напрямок дипольного моменту барвника має при цьому вторинне значення.
Повний текст: (PDF, українською)
References
[1]
Rye HS, Yue S, Wemmer DE, Quesada MA, Haugland RP, Mathies RA, Glazer AN. Stable fluorescent complexes of double-stranded DNA with bis-intercalating asymmetric cyanine dyes: properties and applications. Nucleic Acids Res. 1992;20(11):2803-12.
[2]
Skeidsvoll J, Ueland PM. Analysis of double-stranded DNA by capillary electrophoresis with laser-induced fluorescence detection using the monomeric dye SYBR green I. Anal Biochem. 1995;231(2):359-65.
[3]
Suzuki T, Fujikura K, Higashiyama T, Takata K. DNA staining for fluorescence and laser confocal microscopy. J Histochem Cytochem. 1997;45(1):49-53.
[4]
Ogul'chansky TYu, Yashchuk VM, Yarmoluk SM, Losytskyy MYu. Interaction of cyanine dyes with nucleic acids. 14. Spectral peculiarities of several monomethyne benzothiazole cyanine dyes and their interaction with DNA. Biopolym Cell. 2000; 16(5):345-55.
[6]
Pritchard NJ, Blake A, Peacocke AR. Modified intercalation model for the interaction of amino acridines and DNA. Nature. 1966;212(5068):1360-1.
[7]
Rye HS, Glazer AN. Interaction of dimeric intercalating dyes with single-stranded DNA. Nucleic Acids Res. 1995;23(7):1215-22.
[8]
Nord?n B. Optical studies on complexes between DNA and pseudoisocyanine. Biophys Chem. 1976;6(1):31-45.
[9]
Long EC, Barton JK. On demonstrating DNA intercalation. Acc Chem Res. 1990;23(9):271–3.
[10]
Kumar CV, Turner RS, Asuncion EH. Groove binding of a styrylcyanine dye to the DNA double helix: the salt effect. J Photochem Photobiol A Chem. 1993;74(2-3):231–8.
[11]
Milanovich N, Suh M, Jankowiak R, Small GJ, Hayes JM. Binding of TO-PRO-3 and TOTO-3 to DNA: Fluorescence and Hole-Burning Studies. J Phys Chem. 1996;100(21):9181–6.
[12]
Yarmoluk SM, Kovalska VB, Kovtun YuP. Interaction of cyanine dyes with nucleic acids. 5. Towards model of «half intercalation of monomethyne cyanine dyes into double-stranded nucleic acids. Biopolym Cell. 1999; 15(1):75-82.
[13]
Lukashov SS, Losytskii MYu, Yarmoluk SM, Slominskii YL. The interaction of cyanine dyes with nucleic acids. 12. Novel monomethyne cyanines based on the 5,6-methylenedioxy-benzothiazole and spectral-luminescent properties of thier complexes with nucleic acids. Biopolym Cell. 2000; 16(6):562-72.
[14]
Kelemen J, Wizinger R. Uber alkylsubstituierte Pyrylo- und Pyridino-cyanine 1. 2,6-Dimethylpyrylo- und 2,6-Dimethyl- pyridino-cyanine aus 2,6-DimethyI-i-pyron. Helv chim acta. 1962; 45(6):1908-1917.
[15]
Maniatis T, Fritsch EF, Sambrook I. Molecular cloning: A laboratory manual. New York: Cold Spring Harbor Lab. publ., 1982. 458 p.
[16]
ORGANIKUM. Organisch-chemisches Grundpraktikum. Eds Becker H, VEB Deutscher Verlag der Wissenschaften Berlin 1990
[17]
Ishchenko AA. Structure and spectral-luminescent properties of polymethyne cyanine dyes. Kyiv: Naukova dumka 1994. 232 p.
