Фізичне картування геному М82-похідного ДНК-вмісного фага Р23-2 та виявлення в ньому М82-специфічних послідовностей

Мірюта, Н. Ю.; Мірюта, Г. Ю.; Перерва, Т. П.

doi:10.7124/bc.0005AF

Biopolym. Cell. 2001; 17(3):225-229.

http://dx.doi.org/10.7124/bc.0005AF

Геном та його регуляція

Фізичне картування геному М82-похідного ДНК-вмісного фага Р23-2 та виявлення в ньому М82-специфічних послідовностей

1Мірюта Н. Ю., 1Мірюта Г. Ю., 1Перерва Т. П.

Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
Вул. Академіка Заболотного, 150, Київ, Україна, 03680

Abstract

Побудовано фізичну карту одного з представників групи ДНК-вмісних фагів, виділених з клітин MS2-індукованих мутантів Escherichia coli 23-2. Локалізовано сайти для рестриктаз HindllI, PstI, PvuII, BamHI, EcoRI, Smal. Визначено розмір геному фага, який складає 40 тис. пар нуклеотидів. Здійснено аналіз наявності МS2-специфічних послідовностей у геномі цього фага за допомогою методу гібридизації.

Повний текст: (PDF, українською)

References

[1] Gren EYa. Regulatory mechanisms of RNA containing bacteriophages replication. Riga: Zinatne, 1974. 232 p.

[2] Pererva TP, Miryuta NYu, Miryuta AYu. MS2 phage lysogeny. Phage-specific RNA synthesis on cell DNA. Biopolym Cell. 1993; 9(1):45-50.

[3] Pererva TP, Mirjuta NYu, Mirjuta AYu, Woodmaska MI, Zherebtsova EN. Lysogeny by MS2 phage. Analysis of a recombinant plasmid containing MS2 RNA-like sequence. Biopolym Cell. 1995; 11(1):61-5.

[4] Pererva TP, Miriuta AJ, Woodmaska MI, Alekseenko IP. Lyzogeny by MS2 phage. Expression of MS2-specific information with segregants of unstable transducing P1- and ? phages. Biopolym Cell. 1996; 12(4):73-83.

[5] Pererva T. P. DNA-containing phages neutralizing with anti-MS2 serum. Biopolym Cell. 1998;14(6):549-52.

[6] Adams M. Bacteriophages. New York; London: im. Publ. Inc., 1951.

[7] Devos R, van Emmelo J, Contreras R, Fiers W. Construction and characterization of a plasmid containing a nearly full-size DNA copy of bacteriophage MS2 RNA. J Mol Biol. 1979;128(4):595-619.

[8] Maniatis T, Frisch EF, Sambrook J. Molecular cloning: A laboratory manual. New York: Cold Spring Harbor Lab. publ., 1982. 452 p.

[9] Fitch WM, Smith TF, Ralph WW. Mapping the order of DNA restriction fragments. Gene. 1983;22(1):19-29.

[10] Southern EM. Detection of specific sequences among DNA fragments separated by gel electrophoresis. J Mol Biol. 1975;98(3):503-17.

[11] Burrington MG, Seehafer J, Downer DN, Colter JS. Rescue of BKV from BKV-transformed hamster, rat, and mouse cells: correlation with levels of nonintegrated viral DNA. Virology. 1984;138(1):168-73.

[12] Domingo E, Mart?nez-Salas E, Sobrino F, de la Torre JC, Portela A, Ort?n J, L?pez-Galindez C, P?rez-Bre?a P, Villanueva N, N?jera R, et al. The quasispecies (extremely heterogeneous) nature of viral RNA genome populations: biological relevance--a review. Gene. 1985;40(1):1-8.