Biopolym. Cell. 2000; 16(4):312-319.
http://dx.doi.org/10.7124/bc.000577
Віруси та клітина
Аналіз антигенної структури українських штамів М-вірусу картоплі
1Вітер С. С., 1Ткаченко Т. Ю., 2Коломієць Л. П., 1Радавський Ю. Л.
  1. Інститут біоорганічної хімії та нафтохімії НАН України
    вул. Мурманська, 1, Київ, Україна, 02094
  2. Інститут сільськогосподарської мікробіології та агропромислового виробництва НААН
    вул. Шевченка, 97, Чернігів, Україна, 14027

Abstract

Для аналізу антигенної структури білка оболонки двох ук­раїнських штамів М-вірусу картоплі (PVM) VI та V7 викори­стано три моноклональних антитіаа (МКА) проти PVМ. Фрагменти 22Glu-Lys35 та 22Gly-Lys35 , одержані після фермен­тативного гідролізу трипсином білків оболонки двох штамів PVM, розпізнавалися двома МКА – M6D5 та M9G1. Заміна Glu -> Gly в позиції 22 білка оболонки PVM V7 не змінювала розпізнавання антитілами як триптичних пептидів, так і білків оболонки цих штамів. МКА M9G1 та М4С1 конкурува­ли між собою за ділянки зв'язування з молекулою білка оболонки PVM. Синтетичний пептид П14, який відповідав фрагментові 22Glu-Lys35 , з різною ефективністю пригнічував взаємодію МКА M6D5 та M9G1 з фрагментом П14 і білкооболонки РУМ. Зміна позитивного заряду бокової группи на від'ємний шляхом модифікації пептидів 22Glu-Lys35 та 22Gly-Lys35цитраконовим ангідридом призвела до дворазового посилення реакції МКА M9G1 та до незначного зниження реакції МКА M6D5 з модифікованим пептидом. На підставі одержаних результатів встановлено, що PVM-специфічні епітопи розташовані в N-кінцевій області білка оболонки. Два епітопи, які розпізнаються МКА M6D5 та M9G1, перекрива­ються та мають загальну ділянку зв'язування у фрагменті 22Glu/Gly-Lys35 . Епітопи, які розпізнаються МКА M4C1 та M9G1, або перекриваються між собою, або конформаційно наближені один до одного.
Повний текст: (PDF, англійською)

References

[1] Tavantzis SM. Improved purification of two potato carlaviruses. Phytopathology. 1983; 73(2): 190-4.
[2] Tavantzis SM. Physicochemical properties of potato virus M. Virology. 1984;133(2):427-30.
[3] Zavriev SK, Kanyuka KV, Levay KE. The genome organization of potato virus M RNA. J Gen Virol. 1991;72 ( Pt 1):9-14.
[4] Gramstat A, Courtpozanis A, Rohde W. The 12 kDa protein of potato virus M displays properties of a nucleic acid-binding regulatory protein. FEBS Lett. 1990;276(1-2):34-8.
[5] Foster GD. The structure and expression of the genome of carlaviruses. Res Virol. 1992;143(2):103-12.
[6] Wetter C, Milne RG. Carlaviruses. Handbook of plant virus infections and comparative diagnosis. Ed. E. Kurstak. Amsterdam; New York; Oxford: Elsevier. North-Holland Bio­chemical press, 1981: 685-730.
[7] Viter SS, Raudsepp RA, Gavrish OG, Radavsky YuL. Localization of epitope on potato virus M coat protein. Doklady Akad Nauk Ukrainy. 1992;(9):162-4.
[8] Foster GD, Mills PR. Analysis of the coat proteins of the ordinary and Andean strains of potato virus S and antigenic comparisons of carlaviruses. Acta Virol. 1992;36(2):184-90.
[9] Cerovsk? N, Filigarov? M, Subr Z. Partial antigenic characterization of potato virus S (Andean strain) by monoclonal antibodies. Acta Virol. 1996;40(1):23-6.
[10] Adams AN, Barbara DJ. The use of F(ab‘) 2 -based ELISA to detect serological relationships among carlaviruses . Ann Appl Biol. 1982;101(3):495–500.
[11] J?rvek?lg L, S?ber J, Sinij?rv R, Toots I, Saarma M. Time-resolved fluoroimmunoassay of potato virus M with monoclonal antibodies. Ann Appl Biol. 1989;114(2):279–91.
[12] Nikolaeva OV, Novikov VK Atabekov IG, Kaftanova AS. Changes antigenic properties of potato virus M at the progressive degradation of structural protein in the process of separation and storage. S-H. biology. 1985;10.:75-8.
[13] Laemmli UK. Cleavage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage T4. Nature. 1970;227(5259):680-5.
[14] Wu GJ, Bruening G. Two proteins from cowpea mosaic virus. Virology. 1971;46(3):596-612.
[15] Lowry OH, Rosebrough NJ, Farr AL, Randall RJ. Protein measurement with the Folin phenol reagent. J Biol Chem. 1951;193(1):265-75.
[16] Barany G, Merrifield RB. Solid-phase peptide synthesis. Peptides. Eds E. Gross, J. Meienhoter. New York: Acad, press, 1980. Vol. 2: 1-284.
[17] Pitt-Rivers R, Impiombato FS. The binding of sodium dodecyl sulphate to various proteins. Biochem J. 1968;109(5):825-30.
[18] Tozzini AC, Ek B, Palva ET, Hopp HE. Potato virus X coat protein: a glycoprotein. Virology. 1994;202(2):651-8.
[19] Muller S, Plaue S, Couppez M, Van Regenmortel MH. Comparison of different methods for localizing antigenic regions in histone H2A. Mol Immunol. 1986;23(6):593-601.
[20] Joisson C, Kuster F, Plau? S, Van Regenmortel MH. Antigenic analysis of bean pod mottle virus using linear and cyclized synthetic peptides. Arch Virol. 1993;128(3-4):299-317.
[21] Rajashankar KR, Ramakumar S. Pi-turns in proteins and peptides: Classification, conformation, occurrence, hydration and sequence. Protein Sci. 1996;5(5):932-46.
[22] Shukla DD, Strike PM, Tracy SL, Gough KH, Ward CW. The N and C Termini of the Coat Proteins of Potyviruses Are Surface-located and the N Terminus Contains the Major Virus-specific Epitopes. J Gen Virol. 1988;69(7):1497–508.
[23] Radavsky YuL, Viter SS, Turova IP, Zaitseva LS, J?rvek?lg LV, Saarma MJu, Grebenshchikov NI, Baratova LA. Antigenic structure of the potato virus X coat protein. II. Localization of antigenic determinant(s) at the N-terminus of the protein. Bioorg Khim. 1989; 15 (5):615-9
[24] Baratova LA, Grebenshchikov NI, Dobrov EN, Gedrovich AV, Kashirin IA, Shishkov AV, Efimov AV, J?rvek?lg L, Radavsky YL, Saarma M. The organization of potato virus X coat proteins in virus particles studied by tritium planigraphy and model building. Virology. 1992;188(1):175-80.