Biopolym. Cell. 2000; 16(4):281-283.
http://dx.doi.org/10.7124/bc.000572
Структура та функції біополімерів
Вивчення різних фізико-хімічних характеристик неканонічного комплексу еукаріотичного фактора елонгації eEF-1A з деацильованою тРНК
1Будкевич Т. В., 1Негруцький Б. С., 2Сердюк І. Н., 1Єльська Г. В.
  1. Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
    Вул. Академіка Заболотного, 150, Київ, Україна, 03680
  2. Інститут білка РАН
    вул. Інститутська, 4, Пущино, Московська область, Російська Федерація, 142290

Abstract

Вперше за допомогою методу стаціонарної флюоресцентної поляризації визначено константу дисоціації [eEF-1A·GDP] з вільною тРНК. Отримане значення – 20 нМ, дозволяє припу­стити фізіологічну важливість досліджуваного неканонічного комплексу. При використанні методу малокутового нейтронного розсіювання вивчали форму [eEF-1A·GDP] комплексу. При порівнянні отриманого радіуса інерції для еукаріотичного фактора елонгації з аналогічним параметром для EF-1A було зроблено висновок щодо існування розгорнутої просторової структури eEF-1A, яка набуває глобулярності при взаємодії з деацильованою тРНК.
Повний текст: (PDF, російською)

References

[1] Petrushenko ZM, Negrutskii BS, Ladokhin AS, Budkevich TV, Shalak VF, El'skaya AV. Evidence for the formation of an unusual ternary complex of rabbit liver EF-1alpha with GDP and deacylated tRNA. FEBS Lett. 1997;407(1):13-7.
[2] Negrutskii BS, Deutscher MP. Channeling of aminoacyl-tRNA for protein synthesis in vivo. Proc Natl Acad Sci U S A. 1991;88(11):4991-5.
[3] Shalak VF, Budkevich TV, Negrutski? BS, El'skaia AV. A fast and effective method for purification of elongation factor 1 alpha from rabbit liver. Ukr Biokhim Zh. 1997;69(2):104-9.
[4] Brunngraber EF. A simplified procedure for the preparation of "soluble" RNA from rat liver. Biochem Biophys Res Commun. 1962;8:1-3.
[5] Weiel J, Hershey JW. Fluorescence polarization studies of the interaction of Escherichia coli protein synthesis initiation factor 3 with 30S ribosomal subunits. Biochemistry. 1981;20(20):5859-65.
[6] Jameson DM, Seifried SE. Quantification of protein-protein interactions using fluorescence polarization. Methods. 1999;19(2):222-33.
[7] Graifer DM, Nekhai SYu, Mundus DA, Fedorova OS, Karpova GG. Interaction of human and Escherichia coli tRNA(Phe) with human 80S ribosomes in the presence of oligo- and polyuridylate templates. Biochim Biophys Acta. 1992;1171(1):56-64.
[8] Bilgin N, Ehrenberg M, Ebel C, Zaccai G, Sayers Z, Koch MH, Svergun DI, Barberato C, Volkov V, Nissen P, Nyborg J. Solution structure of the ternary complex between aminoacyl-tRNA, elongation factor Tu, and guanosine triphosphate. Biochemistry. 1998;37(22):8163-72.