Biopolym. Cell. 1997; 13(5):403-407.
http://dx.doi.org/10.7124/bc.00049E
Геном та його регуляція
Генетичні механізми стійкості клітин Escherichia coli до інактивації мішеней. Гени пуринового метаболізму: клонування за допомогою комплементації невідомої послідовності
1Черепенко О. Й., 2Крег С.
  1. Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
    Вул. Академіка Заболотного, 150, Київ, Україна, 03680
  2. Фармацевтична школа Ешелмана, Університет Північної Кароліни
    Чапел Хіл, NC 27510, США

Abstract

Використання штамів ентеробактерій, які дозволяють кло­ну вати три різних гени шляхів синтезу GMP, надавало мож­ ливість одержання трьох груп рестрикційних фрагментів. Однак було клоновано п'ять групп таких фрагментів. Фраг­менти однієї з цих груп вміщували 2 SacI-сайти, Секвенування фрагмента геному Salmonella typhimurium показало 100 % гомологію з N-кінцем гена Y, який належить оперону hemC-hemD Е. coli. Зроблено припущення, що цей фрагмент вміщує ген, подібний гену gpp Е. coli. Також показано, що фрагмент геному S. typhimurium, який комплементує блок синтезу GMP, ампліфікований у PCR-реакції за. допомогою 20-членних прай­ме рів до N- та С-кінців гена hpt Е. coli, не кодує HPRT.
Повний текст: (PDF, англійською)

References

[1] Bugg CE, Carson WM, Montgomery JA. Drugs by design. Sci Am. 1993;269(6):92-8.
[2] Craig S. Purine salvage enzymes as targets for the chemotherapeutic treatment of parasitic diseases. Biopolym Cell. 1994; 10(6):65-71.
[3] Cherepenko E, Matsuka G. Genes of prokaryotic and euka- ryotic aminoacyl-tRNA synthetases. Uspekhi biol. chimii. 1989. 30: 67-105 (in Russian).
[4] Cherepenko EI. ColEl plasmids can prevent thermoinactivation of phenylalanyl-tRNA synthetase in Escherichia coli. Biopolym Cell. 1994; 10(3-4):75-8.
[5] Neuhard J, Nygaard P. Purines and pyrimidines. Es­ cherichia coli and Salmonella typhimurium. cellular and mole­ cular biology. Eds F. Neidhardt, J.'Ingraham, K. B. Low et al. Am Soc Microbiol. Washigton: D. C, 1987. - Vol. 1: 445-73.
[6] Jochimsen B, Nygaard P, Vestergaard T. Location on the chromosome of Escherichia coli of genes governing purine metabolism. Adenosine deaminase (add), guanosine kinase (gsk) and hypoxanthine phosphoribosyltransferase (hpt). Mol Gen Genet. 1975;143(1):85-91.
[7] Benson CE, Gots JS. Genetic modification of substrate specificity of hypoxanthine phosphoribosyltransferase in Salmonella typhimurium. J Bacteriol. 1975;121(1):77-82.
[8] Hanahan D. Studies on transformation of Escherichia coli with plasmids. J Mol Biol. 1983;166(4):557-80.
[9] Neidhardt FC, Bloch PL, Smith DF. Culture medium for enterobacteria. J Bacteriol. 1974;119(3):736-47.
[10] Sambrook J, Fritsch EF, Maniatis T. Molecular cloning. A laboratory manual. New York: Cold Spring Harbor Lab., 1989.
[11] Eakin AE, Bouvier J, Sakanari JA, Craik CS, McKerrow JH. Amplification and sequencing of genomic DNA fragments encoding cysteine proteases from protozoan parasites. Mol Biochem Parasitol. 1990;39(1):1-8.
[12] Fujita N, Mori H, Yura T, Ishihama A. Systematic sequencing of the Escherichia coli genome: analysis of the 2.4-4.1 min (110,917-193,643 bp) region. Nucleic Acids Res. 1994;22(9):1637-9.
[13] Craig SP 3rd, McKerrow JH, Newport GR, Wang CC. Analysis of cDNA encoding the hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase (HGPRTase) of Schistosoma mansoni; a putative target for chemotherapy. Nucleic Acids Res. 1988;16(14B):7087-101.
[14] Flannigan KA, Hennigan SH, Vogelbacker HH, Gots JS, Smith JM. Purine biosynthesis in Escherichia coli K12: structure and DNA sequence studies of the purHD locus. Mol Microbiol. 1990;4(3):381-92.
[15] Alefounder PR, Abell C, Battersby AR. The sequence of hemC, hemD and two additional E. coli genes. Nucleic Acids Res. 1988;16(20):9871.
[16] Cashel M, Rudd KE. The stringent response. Escherichia coli and Salmonella typhimurium: cellular and molecular biology. Eds F, Neidhardt, J. Igraham, K. B. Low et al. Am Soc Microbiol. Washington: D. C, 1987. Vol. 2: 1458–96.