Biopolym. Cell. 1997; 13(3):250-253.
http://dx.doi.org/10.7124/bc.000487
Методи
Метиленовий синій: альтернативний багатоцільовий барвник для виявлення, аналізу та виділення нуклеїнових кислот
1Джонсон К. М., 2Хенекамп Т., 2Стэйтон М. М.
  1. Космічний центр Джона Ф. Кеннеді
    Космічний центр Кеннеді, штат Флорида 32899, США
  2. Університет Молекулярної біології Вайомінгу
    відділ № 3944
    1000 E. Університетський проспект. Ларамі, Вайомінг 82071, США

Abstract

Здійснено серію експериментів з використання метиленового синього (МС) замість інтеркалюючих барвників бромистого етидію (ЕВ) та. акридинового оранжевого (АО) для забарвлен­ня, візуалізації та виділення ДНК і РНК. Показано, що МС переважає інші барвники у використанні для декількох цілей: 1) візуалізації гліоксильовано'і (хімічно денатурованої) РНК в агарозних гелях; 2) забарвлювання нуклеїнових кислот, які в подальшому будуть використані в експериментах з гібри­дизації; 3) виділення та очистки плазмідної ДНК ультрацентрифугуванням в CsCl. Знайдено, що за допомогою МС ДНК так само добре виявляється в гелях агарози або акриламіду, як і з використанням ЕВ і АО, а ДНК, забарвлена МС, може бути очищена із зрізів гелей агарози по протоколу «Gene Clean». Ці результати вказують на те, що МС є дуже ефективним барвником нуклеїнових кислот. Обговорюється його безпека іюрівняно з загальноприйнятними інтеркалюючими барвниками.
Повний текст: (PDF, англійською)

References

[1] Ethidium Bromide MSDS (Report Number OHS60703). San Feandro: MDL Inform. Syst., 1994.
[2] Acridine Orange MSDS (Report Number OHS60010). San Feandro: MDL Inform. Syst., 1994..
[3] Methylene Blue MSDS (Report Number OHSl 9415). San Feandro: MDL Inform. Syst., 1994.
[4] Sambrook J, Fritsch EF, Maniatis T, Irwin N. Molecular Cloning. A Laboratory Manual. New York: Cold Spring Ftarbor Fab. press, 1989. 325 p.
[5] Herrin DL, Schmidt GW. Rapid, reversible staining of northern blots prior to hybridization. Biotechniques. 1988;6(3):196-7, 199-200.
[6] Wilkinson M, Doskow J, Lindsey S. RNA blots: staining procedures and optimization of conditions. Nucleic Acids Res. 1991;19(3):679.
[7] Carmichael GG. Molecular weight determinations of RNA by gel electrophoresis. Electrophoresis. 1980;1(2):78–82.
[8] Thomas PS. Hybridization of denatured RNA transferred or dotted nitrocellulose paper. Methods Enzymol. 1983;100:255-66.