Biopolym. Cell. 1995; 11(3-4):66-72.
Формування великих фрагментів ДНК: ключова характеристика апоптозу чи рання геномна відповідь на стрес?
1Солов'ян В. Т., 1Андреев І. О.
  1. Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
    Вул. Академіка Заболотного, 150, Київ, Україна, 03680

Abstract

В роботі досліджено особливості фрагментації ядерної ДНК у первинній культурі тимоцитів мишей і в культурі лімфобластоїдних клітин людини (лінія СЕМ), індукованих до апоптозу різними чинниками. Крім того, наведено дані про те, що процес форму­ вання великих фрагментів за своїми характеристиками відрізняється від міжнуклеосомної фрагментації і спостерігається не лише при апоптозі, але і в клітинах, підданих дії стресу. Зміна нативності ядерної ДНК у відповідь на стрес відбувається швидко, не є пов'язаною з загибеллю клітин і в деяких випадках їй притаманний транзитний характер. Отримані результати дозволяють інтерпретувати формування великих фраг­ментів скоріше як компонент клітинної відповіді на стрес, а не як ключову властивість апоптозу.

References

[1] Wyllie AH, Kerr JF, Currie AR. Cell death: the significance of apoptosis. Int Rev Cytol. 1980;68:251-306.
[2] Arends MJ, Wyllie AH. Apoptosis: mechanisms and roles in pathology. Int Rev Exp Pathol. 1991;32:223-54.
[3] Williams GT, Smith CA, McCarthy NJ, Grimes EA. Apoptosis: final control point in cell biology. Trends Cell Biol. 1992;2(9):263-7.
[4] Cohen JJ, Duke RC, Fadok VA, Sellins KS. Apoptosis and programmed cell death in immunity. Annu Rev Immunol. 1992;10:267-93.
[5] Wyllie AH. Glucocorticoid-induced thymocyte apoptosis is associated with endogenous endonuclease activation. Nature. 1980;284(5756):555-6.
[6] Compton MM. A biochemical hallmark of apoptosis: internucleosomal degradation of the genome. Cancer Metastasis Rev. 1992;11(2):105-19.
[7] Walker PR, Kokileva L, LeBlanc J, Sikorska M. Detection of the initial stages of DNA fragmentation in apoptosis. Biotechniques. 1993;15(6):1032-40.
[8] Brown DG, Sun XM, Cohen GM. Dexamethasone-induced apoptosis involves cleavage of DNA to large fragments prior to internucleosomal fragmentation. J Biol Chem. 1993;268(5):3037-9.
[9] Oberhammer F, Wilson JW, Dive C, Morris ID, Hickman JA, Wakeling AE, Walker PR, Sikorska M. Apoptotic death in epithelial cells: cleavage of DNA to 300 and/or 50 kb fragments prior to or in the absence of internucleosomal fragmentation. EMBO J. 1993;12(9):3679-84.
[10] Cohen GM, Sun XM, Fearnhead H, MacFarlane M, Brown DG, Snowden RT, Dinsdale D. Formation of large molecular weight fragments of DNA is a key committed step of apoptosis in thymocytes. J Immunol. 1994;153(2):507-16.
[11] Heller C, Pohl FM. A systematic study of field inversion gel electrophoresis. Nucleic Acids Res. 1989;17(15):5989-6003.
[12] Solov'ian VT, Andreev IO, Kunakh VA. Fractionation of eukaryotic DNA in a pulsed electrical field. II. Discrete DNA fragments and level of structural organization of chromatin. Mol Biol (Mosk). 1991;25(6):1483-91.
[13] Nelson EM, Tewey KM, Liu LF. Mechanism of antitumor drug action: poisoning of mammalian DNA topoisomerase II on DNA by 4'-(9-acridinylamino)-methanesulfon-m-anisidide. Proc Natl Acad Sci U S A. 1984;81(5):1361-5.
[14] Osheroff N. Biochemical basis for the interactions of type I and type II topoisomerases with DNA. Pharmacol Ther. 1989;41(1-2):223-41.
[15] Liu LF. DNA topoisomerase poisons as antitumor drugs. Annu Rev Biochem. 1989;58:351-75.
[16] Kaufmann SH. Induction of endonucleolytic DNA cleavage in human acute myelogenous leukemia cells by etoposide, camptothecin, and other cytotoxic anticancer drugs: a cautionary note. Cancer Res. 1989;49(21):5870-8.
[17] Ucker DS, Obermiller PS, Eckhart W, Apgar JR, Berger NA, Meyers J. Genome digestion is a dispensable consequence of physiological cell death mediated by cytotoxic T lymphocytes. Mol Cell Biol. 1992;12(7):3060-9.
[18] Filipski J, Leblanc J, Youdale T, Sikorska M, Walker PR. Periodicity of DNA folding in higher order chromatin structures. EMBO J. 1990;9(4):1319-27.
[19] Razin SV, Petrov P, Hancock R. Precise localization of the alpha-globin gene cluster within one of the 20- to 300-kilobase DNA fragments released by cleavage of chicken chromosomal DNA at topoisomerase II sites in vivo: evidence that the fragments are DNA loops or domains. Proc Natl Acad Sci U S A. 1991;88(19):8515-9.
[20] Solovyan VT, Andreyev IO, Kunakh VA. The functional organization of plant nuclear DNA. I. Evidence for nuclear topoisomerase II. DNA complex. Mol Biol (Mosk). 1993; 27(6):1245-51.