Взаємодія протимікробного препарату етонію з природною ДНК

Сорокін, В. О.; Валєєв, В. А.; Гладченко, Г. О.; Благой, Ю. П.; Суходуб, Л. Ф.

doi:10.7124/bc.000396

Biopolym. Cell. 1994; 10(1):82-89 .

http://dx.doi.org/10.7124/bc.000396

Взаємодія протимікробного препарату етонію з природною ДНК

1Сорокін В. О., 1Валєєв В. А., 1Гладченко Г. О., 1Благой Ю. П., 1Суходуб Л. Ф.

Фізико-технічний інститут низьких температур ім. Б. І. Вєркіна НАН України
Проспект Леніна, 47, Харків, Україна, 61103

Abstract

Методами диференційної УФ-спектроскопії i термічної денатурації виявлено взаємодію антимікробного препарату етоній з природною ДНК- В області малих концентрацій (~ 10^–6–10^–5 М) етоній підвищує и термостабільність за рахунок взаємодії біс-четвертинних азотів з фосфатами ДНК. Окрім того, етоній зв'язується з основами ДНК, спричиняючи формування одноланцюгових неупорядкованих ділянок та їх перехід до компактної форми, що являє собою частки з R_ef~10 нм. Нуклеотидна селективісеть зв'язування етонію з основами нДНК проявляеться у переважній дестабілізаційним АТ-пар. При концентрациях етоніі (0,75–1) · 10^–4 М розбіжності у термостабільності AT- i ГЦ-пар наскільки велкі, що перехід спіраль – клубок ДНК стае двофазним.

Повний текст: (PDF, російською)

References

[1] Zimmer C, Reinert KE, Luck G, Wähnert U, Löber G, Thrum H. Interaction of the oligopeptide antibiotics netropsin and distamycin A with nucleic acids. J Mol Biol. 1971;58(1):329-48.

[2] Zakrzewska K, Lavery R, Pullman B. A theoretical study of the sequence specificity in binding of lexitropsins to B-DNA. J Biomol Struct Dyn. 1987;4(5):833-43.

[3] Luck G, Reinert KE, Baguley B, Zimmer C. Interaction of the nonintercalative antitumour drugs SN-6999 and SN-18071 with DNA: influence of ligand structure on the binding specificity. J Biomol Struct Dyn. 1987;4(6):1079-94.

[4] Burckhardt G, Zimmer C, Baguley B. Binding of nonintercalative antitumor drugs to DNA-polymers: structural effects of bisquaternary ammonium heterocycles. J Biomol Struct Dyn. 1987;4(5):813-31.

[5] Kukhar' VP, Sorokin VA, Blagoĭ IuP, Sukhodub LF. Observation of AT-nucleotide specificity during the interaction of dexamethoxin with native DNA. Dokl Akad Nauk SSSR. 1989;305(4):997-9.

[6] Sorokin VA, Blagoĭ IuP, Valeev VA, Gladchenko GO, Sukhodub LF, Volianskiĭ IuL. The study of complex-formation of DNA with the antimicrobial drug decamethoxine. Mol Biol (Mosk). 1990;24(1):214-9.

[7] Lowry OH, Rosebrough NJ, Farr AL, Randall RJ. Protein measurement with the Folin phenol reagent. J Biol Chem. 1951;193(1):265-75.

[8] Blagoĭ IuP, Sorokin VA, Valeev VA. Spectral studies of binding between DNA bases and magnesium or calcium ions. Mol Biol (Mosk). 1980;14(3):595-605.

[9] Sorokin VA, Galkin VL, Valeev VA, Arkhipova ES, Gladchenko GO, Blagoi YuP. Studies in hydration energetics of nucleic acid components by the differential UV-spectroscopic method. Biopolym Cell. 1989; 5(5):48-55.

[10] Blagoi YP, Sorokin VA, Valeyev VA, Khomenko SA, Gladchenko GO. Magnesium ion effect on the helix-coil transition of DNA. Biopolymers. 1978;17(5):1103-18.

[11] Evdokimov IuM, Salianov VI, Akimenko NM, Varshavskiĭ IaM. Compact form of DNA in solution. X. Peculiarities of circular dichroism spectra of DNA compact particles forming polyethylene glycol-containing water-salt solutions. Mol Biol (Mosk). 1977;11(2):303-9.

[12] Thomas TJ, Bloomfield VA. Collapse of DNA caused by trivalent cations: pH and ionic specificity effects. Biopolymers. 1983;22(4):1097-106.

[13] Sorokin VA, Blagoi YP, Valeev VA, Lisnyak YV. Studies of calcium ion binding to poly A. J Inorg Biochem. 1983;19(2):143-52.

[14] Sorokin VA. Metal complexes of nucleic acids: Dis .... Doc. fiz- mat. nauk. M., 1992. 387 p.

[15] Cantor CR, Schimmel PR. Biophysical Chemistry: Part II: Techniques for the Study of Biological Structure and Function. W. H. Freeman. 1980, 365 p.

[16] Sukhorukov BI, Kozlova LA, Shabarchina LI. Optical properties and molecular structure of nucleic acids and their components. X. Infrared spectra and molecular structure of denatured DNA with different water content and degree of protonation. Biofizika. 1975;20(3):360-5.

[17] Inorganic Biochemistry, Vol. I. (ed. G. Eichhorn). Amsterdam: Elsevier Sci. Publ. 1973.

[18] Lazurkin YS, Frank-Kamenetskii MD, Trifonov EN. Melting of DNA: its study and application as a research method. Biopolymers. 1970;9(11):1253-306.

[19] Blagoi YuP, Sorokin VA, Valeev VA, Gladchenko GO. Effects of calcium and manganese ions on the helix-coil transition of DNA. Biopolymers. 1983;22(7):1641-56.